RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506180.5

CTBP1-208, Transcript of C-terminal binding protein 1, human

TSL 5

Gene CTBP1, Length 843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP1-208	ENST00000506180	MIA2	Q96PC5	1412 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CTBP1-208	ENST00000506180	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CTBP1-208	ENST00000506180	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CTBP1-208	ENST00000506180	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		28.83	■■■□□ 2.21
CTBP1-208	ENST00000506180	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		28.82	■■■□□ 2.2
CTBP1-208	ENST00000506180	PLA2R1	Q13018	1463 aa		28.81	■■■□□ 2.2
CTBP1-208	ENST00000506180	APLP2	Q06481	763 aa		28.81	■■■□□ 2.2
CTBP1-208	ENST00000506180	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		28.8	■■■□□ 2.2
CTBP1-208	ENST00000506180	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
CTBP1-208	ENST00000506180	PZP	P20742	1482 aa		28.79	■■■□□ 2.2
CTBP1-208	ENST00000506180	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
CTBP1-208	ENST00000506180	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		28.78	■■■□□ 2.2
CTBP1-208	ENST00000506180	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
CTBP1-208	ENST00000506180	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
CTBP1-208	ENST00000506180	PKD2	Q13563	968 aa		28.76	■■■□□ 2.19
CTBP1-208	ENST00000506180	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.19
CTBP1-208	ENST00000506180	TNR	Q92752	1358 aa		28.75	■■■□□ 2.19
CTBP1-208	ENST00000506180	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		28.74	■■■□□ 2.19
CTBP1-208	ENST00000506180	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		28.74	■■■□□ 2.19
CTBP1-208	ENST00000506180	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
CTBP1-208	ENST00000506180	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	28.7	■■■□□ 2.19
CTBP1-208	ENST00000506180	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		28.69	■■■□□ 2.18
CTBP1-208	ENST00000506180	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		28.69	■■■□□ 2.18
CTBP1-208	ENST00000506180	ABCC3	O15438	1527 aa		28.69	■■■□□ 2.18
CTBP1-208	ENST00000506180	CEP152	O94986	1710 aa		28.68	■■■□□ 2.18
CTBP1-208	ENST00000506180	ABCC5	O15440	1437 aa		28.67	■■■□□ 2.18
CTBP1-208	ENST00000506180	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
CTBP1-208	ENST00000506180	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		28.66	■■■□□ 2.18
CTBP1-208	ENST00000506180	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		28.66	■■■□□ 2.18
CTBP1-208	ENST00000506180	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	28.64	■■■□□ 2.18
CTBP1-208	ENST00000506180	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CTBP1-208	ENST00000506180	NLRP1	Q9C000	1473 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CTBP1-208	ENST00000506180	DAPK1	P53355	1430 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CTBP1-208	ENST00000506180	KIF15	Q9NS87	1388 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CTBP1-208	ENST00000506180	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CTBP1-208	ENST00000506180	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CTBP1-208	ENST00000506180	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CTBP1-208	ENST00000506180	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CTBP1-208	ENST00000506180	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	28.58	■■■□□ 2.17
CTBP1-208	ENST00000506180	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	28.58	■■■□□ 2.17	8e-7	■■■■□ 23.2
CTBP1-208	ENST00000506180	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		28.57	■■■□□ 2.16
CTBP1-208	ENST00000506180	ERVK-7	P63135	1459 aa		28.56	■■■□□ 2.16
CTBP1-208	ENST00000506180	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	28.55	■■■□□ 2.16
CTBP1-208	ENST00000506180	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		28.54	■■■□□ 2.16
CTBP1-208	ENST00000506180	DEPDC5	O75140	1603 aa		28.52	■■■□□ 2.16
CTBP1-208	ENST00000506180	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		28.51	■■■□□ 2.15
CTBP1-208	ENST00000506180	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		28.49	■■■□□ 2.15
CTBP1-208	ENST00000506180	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	28.48	■■■□□ 2.15	3e-7	■■□□□ 12.4
CTBP1-208	ENST00000506180	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		28.48	■■■□□ 2.15
CTBP1-208	ENST00000506180	MED14	O60244	1454 aa		28.46	■■■□□ 2.15
CTBP1-208	ENST00000506180	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		28.46	■■■□□ 2.15
CTBP1-208	ENST00000506180	IQGAP1	P46940	1657 aa		28.45	■■■□□ 2.15
CTBP1-208	ENST00000506180	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	28.45	■■■□□ 2.15
CTBP1-208	ENST00000506180	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		28.44	■■■□□ 2.14
CTBP1-208	ENST00000506180	CPS1	P31327	1500 aa		28.43	■■■□□ 2.14
CTBP1-208	ENST00000506180	KANK1	Q14678	1352 aa		28.42	■■■□□ 2.14
CTBP1-208	ENST00000506180	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	28.42	■■■□□ 2.14
CTBP1-208	ENST00000506180	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		28.41	■■■□□ 2.14
CTBP1-208	ENST00000506180	ADGRL2	O95490	1459 aa		28.4	■■■□□ 2.14
CTBP1-208	ENST00000506180	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		28.37	■■■□□ 2.13
CTBP1-208	ENST00000506180	PIK3C2B	O00750	1634 aa		28.36	■■■□□ 2.13
CTBP1-208	ENST00000506180	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		28.34	■■■□□ 2.13
CTBP1-208	ENST00000506180	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		28.32	■■■□□ 2.12
CTBP1-208	ENST00000506180	SLIT1	O75093	1534 aa		28.32	■■■□□ 2.12
CTBP1-208	ENST00000506180	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	28.31	■■■□□ 2.12
CTBP1-208	ENST00000506180	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		28.31	■■■□□ 2.12
CTBP1-208	ENST00000506180	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		28.29	■■■□□ 2.12
CTBP1-208	ENST00000506180	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		28.28	■■■□□ 2.12
CTBP1-208	ENST00000506180	LTK	P29376	864 aa		28.28	■■■□□ 2.12
CTBP1-208	ENST00000506180	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		28.28	■■■□□ 2.12
CTBP1-208	ENST00000506180	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	28.28	■■■□□ 2.12
CTBP1-208	ENST00000506180	SYNM	O15061	1565 aa		28.27	■■■□□ 2.12
CTBP1-208	ENST00000506180	TOM1	O60784	492 aa		28.25	■■■□□ 2.11
CTBP1-208	ENST00000506180	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		28.25	■■■□□ 2.11
CTBP1-208	ENST00000506180	IDI1	Q13907	227 aa		28.24	■■■□□ 2.11
CTBP1-208	ENST00000506180	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	28.23	■■■□□ 2.11
CTBP1-208	ENST00000506180	PIP4K2B	P78356	416 aa		28.23	■■■□□ 2.11
CTBP1-208	ENST00000506180	EID1	Q9Y6B2	187 aa		28.23	■■■□□ 2.11
CTBP1-208	ENST00000506180	NOS1	P29475	1434 aa		28.23	■■■□□ 2.11
CTBP1-208	ENST00000506180	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		28.22	■■■□□ 2.11
CTBP1-208	ENST00000506180	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		28.2	■■■□□ 2.1
CTBP1-208	ENST00000506180	TET3	O43151	1660 aa		28.19	■■■□□ 2.1
CTBP1-208	ENST00000506180	ALK	Q9UM73	1620 aa		28.18	■■■□□ 2.1
CTBP1-208	ENST00000506180	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		28.17	■■■□□ 2.1
CTBP1-208	ENST00000506180	UNC13B	O14795	1591 aa		28.17	■■■□□ 2.1
CTBP1-208	ENST00000506180	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
CTBP1-208	ENST00000506180	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	28.16	■■■□□ 2.1
CTBP1-208	ENST00000506180	ADGRB3	O60242	1522 aa		28.16	■■■□□ 2.1
CTBP1-208	ENST00000506180	ILDR2	Q71H61	639 aa		28.15	■■■□□ 2.1
CTBP1-208	ENST00000506180	ROCK1	Q13464	1354 aa		28.14	■■■□□ 2.1
CTBP1-208	ENST00000506180	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		28.14	■■■□□ 2.1
CTBP1-208	ENST00000506180	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		28.14	■■■□□ 2.1
CTBP1-208	ENST00000506180	HSPA1L	P34931	641 aa		28.13	■■■□□ 2.09
CTBP1-208	ENST00000506180	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	28.13	■■■□□ 2.09
CTBP1-208	ENST00000506180	ITGAE	P38570	1179 aa		28.09	■■■□□ 2.09
CTBP1-208	ENST00000506180		E9PCH4	1651 aa		28.09	■■■□□ 2.09
CTBP1-208	ENST00000506180	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		28.07	■■■□□ 2.08
CTBP1-208	ENST00000506180	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		28.04	■■■□□ 2.08
CTBP1-208	ENST00000506180	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		28.03	■■■□□ 2.08
CTBP1-208	ENST00000506180	KCNA6	P17658	529 aa		27.99	■■■□□ 2.07

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