RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505926.5

PDE8B-209, Transcript of phosphodiesterase 8B, human

TSL 5

Gene PDE8B, Length 736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE8B-209	ENST00000505926	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		33.39	■■■□□ 2.94
PDE8B-209	ENST00000505926	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	33.39	■■■□□ 2.94
PDE8B-209	ENST00000505926	ABCC5	O15440	1437 aa		33.36	■■■□□ 2.93
PDE8B-209	ENST00000505926	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		33.35	■■■□□ 2.93
PDE8B-209	ENST00000505926	DAPK1	P53355	1430 aa		33.35	■■■□□ 2.93
PDE8B-209	ENST00000505926	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	33.35	■■■□□ 2.93
PDE8B-209	ENST00000505926	STRC	Q7RTU9	1775 aa		33.34	■■■□□ 2.93
PDE8B-209	ENST00000505926	FBXO41	Q8TF61	875 aa		33.34	■■■□□ 2.93
PDE8B-209	ENST00000505926	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
PDE8B-209	ENST00000505926	KIF15	Q9NS87	1388 aa		33.34	■■■□□ 2.93
PDE8B-209	ENST00000505926	PZP	P20742	1482 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PDE8B-209	ENST00000505926	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PDE8B-209	ENST00000505926	PTPRT	O14522	1441 aa		33.32	■■■□□ 2.92
PDE8B-209	ENST00000505926	NCOA1	Q15788	1441 aa		33.31	■■■□□ 2.92
PDE8B-209	ENST00000505926	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	33.31	■■■□□ 2.92
PDE8B-209	ENST00000505926	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		33.3	■■■□□ 2.92
PDE8B-209	ENST00000505926	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	33.3	■■■□□ 2.92
PDE8B-209	ENST00000505926	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	33.29	■■■□□ 2.92
PDE8B-209	ENST00000505926	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		33.29	■■■□□ 2.92
PDE8B-209	ENST00000505926	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		33.28	■■■□□ 2.92
PDE8B-209	ENST00000505926	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		33.28	■■■□□ 2.92
PDE8B-209	ENST00000505926	TNR	Q92752	1358 aa		33.28	■■■□□ 2.92
PDE8B-209	ENST00000505926	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		33.25	■■■□□ 2.91
PDE8B-209	ENST00000505926	PKD2	Q13563	968 aa		33.25	■■■□□ 2.91
PDE8B-209	ENST00000505926	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	33.25	■■■□□ 2.91
PDE8B-209	ENST00000505926	PLA2R1	Q13018	1463 aa		33.25	■■■□□ 2.91
PDE8B-209	ENST00000505926	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	33.22	■■■□□ 2.91
PDE8B-209	ENST00000505926	CERK	Q8TCT0	537 aa		33.22	■■■□□ 2.91
PDE8B-209	ENST00000505926	ABCC3	O15438	1527 aa		33.22	■■■□□ 2.91
PDE8B-209	ENST00000505926	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		33.2	■■■□□ 2.91
PDE8B-209	ENST00000505926	KANK1	Q14678	1352 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PDE8B-209	ENST00000505926	NLRP1	Q9C000	1473 aa		33.18	■■■□□ 2.9
PDE8B-209	ENST00000505926	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PDE8B-209	ENST00000505926	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	33.13	■■■□□ 2.89
PDE8B-209	ENST00000505926	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PDE8B-209	ENST00000505926	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	33.13	■■■□□ 2.89
PDE8B-209	ENST00000505926	ADGRL2	O95490	1459 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PDE8B-209	ENST00000505926	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	33.1	■■■□□ 2.89
PDE8B-209	ENST00000505926	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PDE8B-209	ENST00000505926	CEP152	O94986	1710 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PDE8B-209	ENST00000505926	DEPDC5	O75140	1603 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PDE8B-209	ENST00000505926	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PDE8B-209	ENST00000505926	ERVK-7	P63135	1459 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PDE8B-209	ENST00000505926	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PDE8B-209	ENST00000505926	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PDE8B-209	ENST00000505926	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		33	■■■□□ 2.87
PDE8B-209	ENST00000505926	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	32.97	■■■□□ 2.87
PDE8B-209	ENST00000505926	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		32.97	■■■□□ 2.87
PDE8B-209	ENST00000505926	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	32.97	■■■□□ 2.87
PDE8B-209	ENST00000505926	ROCK1	Q13464	1354 aa		32.96	■■■□□ 2.87
PDE8B-209	ENST00000505926	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.87
PDE8B-209	ENST00000505926	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		32.94	■■■□□ 2.86
PDE8B-209	ENST00000505926	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		32.93	■■■□□ 2.86
PDE8B-209	ENST00000505926	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PDE8B-209	ENST00000505926	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	32.91	■■■□□ 2.86
PDE8B-209	ENST00000505926	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	32.88	■■■□□ 2.85
PDE8B-209	ENST00000505926	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		32.86	■■■□□ 2.85
PDE8B-209	ENST00000505926	MED14	O60244	1454 aa		32.85	■■■□□ 2.85
PDE8B-209	ENST00000505926	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		32.84	■■■□□ 2.85
PDE8B-209	ENST00000505926	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		32.84	■■■□□ 2.85
PDE8B-209	ENST00000505926	ITGAE	P38570	1179 aa		32.84	■■■□□ 2.85
PDE8B-209	ENST00000505926	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	32.84	■■■□□ 2.85
PDE8B-209	ENST00000505926	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	32.82	■■■□□ 2.84
PDE8B-209	ENST00000505926	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		32.82	■■■□□ 2.84
PDE8B-209	ENST00000505926	EID1	Q9Y6B2	187 aa		32.8	■■■□□ 2.84
PDE8B-209	ENST00000505926	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		32.79	■■■□□ 2.84
PDE8B-209	ENST00000505926	IQGAP1	P46940	1657 aa		32.75	■■■□□ 2.83
PDE8B-209	ENST00000505926	UNC13B	O14795	1591 aa		32.75	■■■□□ 2.83
PDE8B-209	ENST00000505926	CPS1	P31327	1500 aa		32.75	■■■□□ 2.83
PDE8B-209	ENST00000505926	NOS1	P29475	1434 aa		32.75	■■■□□ 2.83
PDE8B-209	ENST00000505926	TET3	O43151	1660 aa		32.75	■■■□□ 2.83
PDE8B-209	ENST00000505926	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	32.75	■■■□□ 2.83
PDE8B-209	ENST00000505926	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
PDE8B-209	ENST00000505926	SLIT1	O75093	1534 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PDE8B-209	ENST00000505926	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
PDE8B-209	ENST00000505926	IDI1	Q13907	227 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PDE8B-209	ENST00000505926	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PDE8B-209	ENST00000505926	PIK3C2B	O00750	1634 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PDE8B-209	ENST00000505926	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		32.72	■■■□□ 2.83
PDE8B-209	ENST00000505926	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		32.69	■■■□□ 2.82
PDE8B-209	ENST00000505926	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		32.69	■■■□□ 2.82
PDE8B-209	ENST00000505926	SYNM	O15061	1565 aa		32.67	■■■□□ 2.82
PDE8B-209	ENST00000505926	NUP155	O75694	1391 aa		32.67	■■■□□ 2.82
PDE8B-209	ENST00000505926	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		32.65	■■■□□ 2.82
PDE8B-209	ENST00000505926	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		32.64	■■■□□ 2.82
PDE8B-209	ENST00000505926	LTK	P29376	864 aa		32.63	■■■□□ 2.81
PDE8B-209	ENST00000505926	ADGRB3	O60242	1522 aa		32.62	■■■□□ 2.81
PDE8B-209	ENST00000505926	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	32.62	■■■□□ 2.81
PDE8B-209	ENST00000505926	TOM1	O60784	492 aa		32.57	■■■□□ 2.8
PDE8B-209	ENST00000505926		E9PCH4	1651 aa		32.54	■■■□□ 2.8
PDE8B-209	ENST00000505926	BCAN	Q96GW7	911 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PDE8B-209	ENST00000505926	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
PDE8B-209	ENST00000505926	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
PDE8B-209	ENST00000505926	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	32.48	■■■□□ 2.79
PDE8B-209	ENST00000505926	NAIP	Q13075	1403 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PDE8B-209	ENST00000505926	HFM1	A2PYH4	1435 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PDE8B-209	ENST00000505926	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PDE8B-209	ENST00000505926	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PDE8B-209	ENST00000505926	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
PDE8B-209	ENST00000505926	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		32.43	■■■□□ 2.78

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