RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CERKQ8TCT0 537 aa36.3■■■■□ 3.4
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.3■■■■□ 3.4
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa36.3■■■■□ 3.4
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NCOA1Q15788 1441 aa36.29■■■■□ 3.4
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PTPRTO14522 1441 aa36.27■■■■□ 3.4
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ABCC5O15440 1437 aa36.27■■■■□ 3.4
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.39
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.23■■■■□ 3.39
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PZPP20742 1482 aa36.23■■■■□ 3.39
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DUOX2Q9NRD8 1548 aa36.23■■■■□ 3.39
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.22■■■■□ 3.39
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DAPK1P53355 1430 aa36.22■■■■□ 3.39
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.22■■■■□ 3.39
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TNRQ92752 1358 aa36.21■■■■□ 3.39
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa36.21■■■■□ 3.39
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIF15Q9NS87 1388 aa36.2■■■■□ 3.39
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A2ML1A8K2U0 1454 aa36.18■■■■□ 3.38
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.16■■■■□ 3.38
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PKD2Q13563 968 aa36.14■■■■□ 3.38
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ABCC3O15438 1527 aa36.13■■■■□ 3.38
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLA2R1Q13018 1463 aa36.13■■■■□ 3.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ERBINQ96RT1 1412 aa36.09■■■■□ 3.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.09■■■■□ 3.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.09■■■■□ 3.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CEP152O94986 1710 aa36.06■■■■□ 3.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP36.06■■■■□ 3.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NLRP1Q9C000 1473 aa36.03■■■■□ 3.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
HOXC-AS1-201ENST00000505700 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP36■■■■□ 3.35
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP35.98■■■■□ 3.35
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.97■■■■□ 3.35
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KANK1Q14678 1352 aa35.97■■■■□ 3.35
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ERVK-7P63135 1459 aa35.97■■■■□ 3.35
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa35.97■■■■□ 3.35
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.96■■■■□ 3.35
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.95■■■■□ 3.35
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANKLE2Q86XL3 938 aa35.93■■■■□ 3.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DEPDC5O75140 1603 aa35.92■■■■□ 3.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADGRL2O95490 1459 aa35.92■■■■□ 3.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.91■■■■□ 3.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa35.88■■■■□ 3.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.84■■■■□ 3.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IQSEC2Q5JU85 1478 aa35.81■■■■□ 3.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.81■■■■□ 3.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LMTK2Q8IWU2 1503 aa35.78■■■■□ 3.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 VWDEQ8N2E2 1590 aa35.77■■■■□ 3.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP35.76■■■■□ 3.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UBR1Q8IWV7 1749 aa35.75■■■■□ 3.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ITGAEP38570 1179 aa35.74■■■■□ 3.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MED14O60244 1454 aa35.73■■■■□ 3.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 STAG3Q9UJ98 1225 aa35.7■■■■□ 3.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ROCK1Q13464 1354 aa35.67■■■■□ 3.3
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IQGAP1P46940 1657 aa35.67■■■■□ 3.3
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EFCAB6Q5THR3 1501 aa35.67■■■■□ 3.3
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PIK3C2BO00750 1634 aa35.65■■■■□ 3.3
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UBAP1LF5GYI3 381 aa35.65■■■■□ 3.3
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IDI1Q13907 227 aa35.64■■■■□ 3.3
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.64■■■■□ 3.3
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EID1Q9Y6B2 187 aa35.62■■■■□ 3.29
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CPS1P31327 1500 aa35.62■■■■□ 3.29
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LTKP29376 864 aa35.6■■■■□ 3.29
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SYNMO15061 1565 aa35.59■■■■□ 3.29
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NOS1P29475 1434 aa35.59■■■■□ 3.29
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLIT1O75093 1534 aa35.59■■■■□ 3.29
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.59■■■■□ 3.29
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TET3O43151 1660 aa35.56■■■■□ 3.28
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UNC13BO14795 1591 aa35.56■■■■□ 3.28
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP35.55■■■■□ 3.28
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.55■■■■□ 3.28
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC52A1Q9NWF4 448 aa35.55■■■■□ 3.28
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.51■■■■□ 3.28
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NUP155O75694 1391 aa35.47■■■■□ 3.27
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADGRB3O60242 1522 aa35.46■■■■□ 3.27
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TOM1O60784 492 aa35.45■■■■□ 3.27
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.45■■■■□ 3.27
HOXC-AS1-201ENST00000505700 STRCP1A6NGW2 1772 aa35.43■■■■□ 3.26
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.43■■■■□ 3.26
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP35.43■■■■□ 3.26
HOXC-AS1-201ENST00000505700 E9PCH4 1651 aa35.41■■■■□ 3.26
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PIP4K2BP78356 416 aa35.4■■■■□ 3.26
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CHGAP10645 457 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LRRC7Q96NW7 1537 aa35.37■■■■□ 3.25
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BCANQ96GW7 911 aa35.36■■■■□ 3.25
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MYO5BQ9ULV0 1848 aa35.34■■■■□ 3.25
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC26A8Q96RN1 970 aa35.33■■■■□ 3.25
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HDGFP51858 240 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.24
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa35.3■■■■□ 3.24
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
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