RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505490.2

ALYREF-202, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALYREF, Length 1,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-202ENST00000505490 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP48.21■■■■■ 5.31
ALYREF-202ENST00000505490 KIF3BO15066 747 aa48.2■■■■■ 5.31
ALYREF-202ENST00000505490 KDM5DQ9BY66 1539 aa48.2■■■■■ 5.31
ALYREF-202ENST00000505490 PZPP20742 1482 aa48.17■■■■■ 5.3
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP48.13■■■■■ 5.3
ALYREF-202ENST00000505490 MAP3K1Q13233 1512 aa48.13■■■■■ 5.3
ALYREF-202ENST00000505490 MAST1Q9Y2H9 1570 aa48.09■■■■■ 5.29
ALYREF-202ENST00000505490 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP48.08■■■■■ 5.29
ALYREF-202ENST00000505490 TNRQ92752 1358 aa48.08■■■■■ 5.29
ALYREF-202ENST00000505490 TSPY4P0CV99 314 aa48.06■■■■■ 5.28
ALYREF-202ENST00000505490 TSPY10P0CW01 314 aa48.06■■■■■ 5.28
ALYREF-202ENST00000505490 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa48.05■■■■■ 5.28
ALYREF-202ENST00000505490 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa48.03■■■■■ 5.28
ALYREF-202ENST00000505490 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP48.02■■■■■ 5.28
ALYREF-202ENST00000505490 NEURL4Q96JN8 1562 aa47.99■■■■■ 5.27
ALYREF-202ENST00000505490 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP47.98■■■■■ 5.27
ALYREF-202ENST00000505490 MIA2Q96PC5 1412 aa47.98■■■■■ 5.27
ALYREF-202ENST00000505490 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP47.97■■■■■ 5.27
ALYREF-202ENST00000505490 NLRP1Q9C000 1473 aa47.94■■■■■ 5.26
ALYREF-202ENST00000505490 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP47.92■■■■■ 5.26
ALYREF-202ENST00000505490 MYOM3Q5VTT5 1437 aa47.92■■■■■ 5.26
ALYREF-202ENST00000505490 DISP3Q9P2K9 1392 aa47.9■■■■■ 5.26
ALYREF-202ENST00000505490 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP47.89■■■■■ 5.26
ALYREF-202ENST00000505490 ABCC3O15438 1527 aa47.88■■■■■ 5.26
ALYREF-202ENST00000505490 MROH1Q8NDA8 1641 aa47.85■■■■■ 5.25
ALYREF-202ENST00000505490 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa47.83■■■■■ 5.25
ALYREF-202ENST00000505490 UGGT1Q9NYU2 1555 aa47.82■■■■■ 5.25
ALYREF-202ENST00000505490 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP47.81■■■■■ 5.24
ALYREF-202ENST00000505490 MED14O60244 1454 aa47.8■■■■■ 5.24
ALYREF-202ENST00000505490 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP47.8■■■■■ 5.24
ALYREF-202ENST00000505490 DEPDC5O75140 1603 aa47.8■■■■■ 5.24
ALYREF-202ENST00000505490 UBAP1LF5GYI3 381 aa47.79■■■■■ 5.24
ALYREF-202ENST00000505490 ILDR2Q71H61 639 aa47.78■■■■■ 5.24
ALYREF-202ENST00000505490 CPS1P31327 1500 aa47.77■■■■■ 5.24
ALYREF-202ENST00000505490 ANKLE2Q86XL3 938 aa47.76■■■■■ 5.24
ALYREF-202ENST00000505490 SHANK2Q9UPX8 1470 aa47.74■■■■■ 5.23
ALYREF-202ENST00000505490 DUOX2Q9NRD8 1548 aa47.74■■■■■ 5.23
ALYREF-202ENST00000505490 VWDEQ8N2E2 1590 aa47.71■■■■■ 5.23
ALYREF-202ENST00000505490 ERVK-7P63135 1459 aa47.71■■■■■ 5.23
ALYREF-202ENST00000505490 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP47.65■■■■■ 5.22
ALYREF-202ENST00000505490 CEP152O94986 1710 aa47.65■■■■■ 5.22
ALYREF-202ENST00000505490 CROCC2H7BZ55 1655 aa47.65■■■■■ 5.22
ALYREF-202ENST00000505490 ABCC5O15440 1437 aa47.64■■■■■ 5.22
ALYREF-202ENST00000505490 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP47.61■■■■■ 5.21
ALYREF-202ENST00000505490 IQGAP1P46940 1657 aa47.6■■■■■ 5.21
ALYREF-202ENST00000505490 PTPN23Q9H3S7 1636 aa47.59■■■■■ 5.21
ALYREF-202ENST00000505490 ERBINQ96RT1 1412 aa47.58■■■■■ 5.21
ALYREF-202ENST00000505490 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa47.57■■■■■ 5.21
ALYREF-202ENST00000505490 KIF15Q9NS87 1388 aa47.57■■■■■ 5.21
ALYREF-202ENST00000505490 UBR1Q8IWV7 1749 aa47.55■■■■■ 5.2
ALYREF-202ENST00000505490 SOCS7O14512 581 aa47.53■■■■■ 5.2
ALYREF-202ENST00000505490 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP47.53■■■■■ 5.2
ALYREF-202ENST00000505490 DAPK1P53355 1430 aa47.49■■■■■ 5.19
ALYREF-202ENST00000505490 TOM1O60784 492 aa47.47■■■■■ 5.19
ALYREF-202ENST00000505490 FGD6Q6ZV73 1430 aa47.47■■■■■ 5.19
ALYREF-202ENST00000505490 ALKQ9UM73 1620 aa47.45■■■■■ 5.19
ALYREF-202ENST00000505490 STRCP1A6NGW2 1772 aa47.45■■■■■ 5.19
ALYREF-202ENST00000505490 ARHGAP23Q9P227 1491 aa47.44■■■■■ 5.18
ALYREF-202ENST00000505490 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa47.42■■■■■ 5.18
ALYREF-202ENST00000505490 SLIT1O75093 1534 aa47.41■■■■■ 5.18
ALYREF-202ENST00000505490 APLP2Q06481 763 aa47.4■■■■■ 5.18
ALYREF-202ENST00000505490 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP47.37■■■■■ 5.17
ALYREF-202ENST00000505490 HSPA1LP34931 641 aa47.35■■■■■ 5.17
ALYREF-202ENST00000505490 LMTK2Q8IWU2 1503 aa47.35■■■■■ 5.17
ALYREF-202ENST00000505490 LRRC7Q96NW7 1537 aa47.35■■■■■ 5.17
ALYREF-202ENST00000505490 SYNMO15061 1565 aa47.33■■■■■ 5.17
ALYREF-202ENST00000505490 PIP4K2BP78356 416 aa47.32■■■■■ 5.17
ALYREF-202ENST00000505490 LTKP29376 864 aa47.29■■■■■ 5.16
ALYREF-202ENST00000505490 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa47.28■■■■■ 5.16
ALYREF-202ENST00000505490 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP47.26■■■■■ 5.16
ALYREF-202ENST00000505490 PIK3C2BO00750 1634 aa47.26■■■■■ 5.16
ALYREF-202ENST00000505490 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP47.25■■■■■ 5.15
ALYREF-202ENST00000505490 KANK1Q14678 1352 aa47.24■■■■■ 5.15
ALYREF-202ENST00000505490 ADGRL2O95490 1459 aa47.22■■■■■ 5.15
ALYREF-202ENST00000505490 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP47.22■■■■■ 5.15
ALYREF-202ENST00000505490 TXNDC2Q86VQ3 553 aa47.21■■■■■ 5.15
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM2Q9UHN6 1383 aa47.18■■■■■ 5.14
ALYREF-202ENST00000505490 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP47.17■■■■■ 5.14
ALYREF-202ENST00000505490 CHIC2Q9UKJ5 165 aa47.17■■■■■ 5.14
ALYREF-202ENST00000505490 NOS1P29475 1434 aa47.13■■■■■ 5.14
ALYREF-202ENST00000505490 EFCAB6Q5THR3 1501 aa47.12■■■■■ 5.13
ALYREF-202ENST00000505490 EID1Q9Y6B2 187 aa47.11■■■■■ 5.13
ALYREF-202ENST00000505490 IDI1Q13907 227 aa47.1■■■■■ 5.13
ALYREF-202ENST00000505490 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP47.09■■■■■ 5.13
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ALYREF-202ENST00000505490 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP46.97■■■■■ 5.11
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ALYREF-202ENST00000505490 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa46.96■■■■■ 5.11
ALYREF-202ENST00000505490 SLC52A1Q9NWF4 448 aa46.94■■■■■ 5.1
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ALYREF-202ENST00000505490 NWD1Q149M9 1564 aa46.81■■■■■ 5.08
ALYREF-202ENST00000505490 UNC13BO14795 1591 aa46.8■■■■■ 5.08
ALYREF-202ENST00000505490 FAM135BQ49AJ0 1406 aa46.79■■■■■ 5.08
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM94Q12767 1356 aa46.79■■■■■ 5.08
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ALYREF-202ENST00000505490 SLC26A8Q96RN1 970 aa46.77■■■■■ 5.08
ALYREF-202ENST00000505490 MYO5BQ9ULV0 1848 aa46.75■■■■■ 5.07
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