RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505186.1

TNIP2-204, Transcript of TNFAIP3 interacting protein 2, human

TSL 3

Gene TNIP2, Length 980 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNIP2-204	ENST00000505186	ILDR2	Q71H61	639 aa		29.32	■■■□□ 2.28
TNIP2-204	ENST00000505186	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		29.3	■■■□□ 2.28
TNIP2-204	ENST00000505186	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		29.27	■■■□□ 2.28
TNIP2-204	ENST00000505186	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		29.27	■■■□□ 2.28
TNIP2-204	ENST00000505186	PZP	P20742	1482 aa		29.26	■■■□□ 2.27
TNIP2-204	ENST00000505186	TNR	Q92752	1358 aa		29.26	■■■□□ 2.27
TNIP2-204	ENST00000505186	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		29.25	■■■□□ 2.27
TNIP2-204	ENST00000505186	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	29.25	■■■□□ 2.27
TNIP2-204	ENST00000505186	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	29.25	■■■□□ 2.27
TNIP2-204	ENST00000505186	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		29.24	■■■□□ 2.27
TNIP2-204	ENST00000505186	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		29.22	■■■□□ 2.27
TNIP2-204	ENST00000505186	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		29.19	■■■□□ 2.26
TNIP2-204	ENST00000505186	SOCS7	O14512	581 aa		29.18	■■■□□ 2.26
TNIP2-204	ENST00000505186	TSPY4	P0CV99	314 aa		29.18	■■■□□ 2.26
TNIP2-204	ENST00000505186	TSPY10	P0CW01	314 aa		29.18	■■■□□ 2.26
TNIP2-204	ENST00000505186	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		29.16	■■■□□ 2.26
TNIP2-204	ENST00000505186	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		29.13	■■■□□ 2.25
TNIP2-204	ENST00000505186	MIA2	Q96PC5	1412 aa		29.13	■■■□□ 2.25
TNIP2-204	ENST00000505186	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	29.13	■■■□□ 2.25
TNIP2-204	ENST00000505186	NLRP1	Q9C000	1473 aa		29.12	■■■□□ 2.25
TNIP2-204	ENST00000505186	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		29.11	■■■□□ 2.25
TNIP2-204	ENST00000505186	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	29.11	■■■□□ 2.25
TNIP2-204	ENST00000505186	CPS1	P31327	1500 aa		29.1	■■■□□ 2.25
TNIP2-204	ENST00000505186	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		29.1	■■■□□ 2.25
TNIP2-204	ENST00000505186	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TNIP2-204	ENST00000505186	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
TNIP2-204	ENST00000505186	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TNIP2-204	ENST00000505186	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	29.08	■■■□□ 2.25
TNIP2-204	ENST00000505186	ABCC3	O15438	1527 aa		29.06	■■■□□ 2.24
TNIP2-204	ENST00000505186	DEPDC5	O75140	1603 aa		29.05	■■■□□ 2.24
TNIP2-204	ENST00000505186	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
TNIP2-204	ENST00000505186	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	29.03	■■■□□ 2.24
TNIP2-204	ENST00000505186	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		29.03	■■■□□ 2.24
TNIP2-204	ENST00000505186	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
TNIP2-204	ENST00000505186	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		29.02	■■■□□ 2.24
TNIP2-204	ENST00000505186	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	29.02	■■■□□ 2.24
TNIP2-204	ENST00000505186	MED14	O60244	1454 aa		29.02	■■■□□ 2.24
TNIP2-204	ENST00000505186	MAP3K1	Q13233	1512 aa		29	■■■□□ 2.23
TNIP2-204	ENST00000505186	PIP4K2B	P78356	416 aa		29	■■■□□ 2.23
TNIP2-204	ENST00000505186	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		29	■■■□□ 2.23
TNIP2-204	ENST00000505186	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		29	■■■□□ 2.23
TNIP2-204	ENST00000505186	IQGAP1	P46940	1657 aa		28.99	■■■□□ 2.23
TNIP2-204	ENST00000505186	TOM1	O60784	492 aa		28.99	■■■□□ 2.23
TNIP2-204	ENST00000505186	CEP152	O94986	1710 aa		28.99	■■■□□ 2.23
TNIP2-204	ENST00000505186	ERVK-7	P63135	1459 aa		28.98	■■■□□ 2.23
TNIP2-204	ENST00000505186	HSPA1L	P34931	641 aa		28.95	■■■□□ 2.22
TNIP2-204	ENST00000505186	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
TNIP2-204	ENST00000505186	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TNIP2-204	ENST00000505186	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TNIP2-204	ENST00000505186	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TNIP2-204	ENST00000505186	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TNIP2-204	ENST00000505186	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
TNIP2-204	ENST00000505186	ALK	Q9UM73	1620 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TNIP2-204	ENST00000505186	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
TNIP2-204	ENST00000505186	KIF15	Q9NS87	1388 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TNIP2-204	ENST00000505186	SYNM	O15061	1565 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TNIP2-204	ENST00000505186	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TNIP2-204	ENST00000505186	ABCC5	O15440	1437 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TNIP2-204	ENST00000505186	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TNIP2-204	ENST00000505186	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TNIP2-204	ENST00000505186	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
TNIP2-204	ENST00000505186	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		28.81	■■■□□ 2.2
TNIP2-204	ENST00000505186	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		28.8	■■■□□ 2.2
TNIP2-204	ENST00000505186	SLIT1	O75093	1534 aa		28.78	■■■□□ 2.2
TNIP2-204	ENST00000505186	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		28.77	■■■□□ 2.2
TNIP2-204	ENST00000505186	DAPK1	P53355	1430 aa		28.77	■■■□□ 2.2
TNIP2-204	ENST00000505186	APLP2	Q06481	763 aa		28.76	■■■□□ 2.19
TNIP2-204	ENST00000505186	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	28.76	■■■□□ 2.19	3e-8	■■■□□ 14.6
TNIP2-204	ENST00000505186	PIK3C2B	O00750	1634 aa		28.74	■■■□□ 2.19
TNIP2-204	ENST00000505186	LTK	P29376	864 aa		28.74	■■■□□ 2.19
TNIP2-204	ENST00000505186	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		28.74	■■■□□ 2.19
TNIP2-204	ENST00000505186	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
TNIP2-204	ENST00000505186	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		28.71	■■■□□ 2.19
TNIP2-204	ENST00000505186	KANK1	Q14678	1352 aa		28.71	■■■□□ 2.19
TNIP2-204	ENST00000505186	EID1	Q9Y6B2	187 aa		28.69	■■■□□ 2.18
TNIP2-204	ENST00000505186	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	28.66	■■■□□ 2.18
TNIP2-204	ENST00000505186	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		28.66	■■■□□ 2.18
TNIP2-204	ENST00000505186	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	28.66	■■■□□ 2.18
TNIP2-204	ENST00000505186	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		28.66	■■■□□ 2.18
TNIP2-204	ENST00000505186	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		28.66	■■■□□ 2.18
TNIP2-204	ENST00000505186	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		28.65	■■■□□ 2.18
TNIP2-204	ENST00000505186	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		28.65	■■■□□ 2.18
TNIP2-204	ENST00000505186	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	28.64	■■■□□ 2.17
TNIP2-204	ENST00000505186	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		28.63	■■■□□ 2.17
TNIP2-204	ENST00000505186	IDI1	Q13907	227 aa		28.59	■■■□□ 2.17
TNIP2-204	ENST00000505186	NOS1	P29475	1434 aa		28.55	■■■□□ 2.16
TNIP2-204	ENST00000505186	ADGRB3	O60242	1522 aa		28.53	■■■□□ 2.16
TNIP2-204	ENST00000505186	ADGRL2	O95490	1459 aa		28.53	■■■□□ 2.16
TNIP2-204	ENST00000505186	TET3	O43151	1660 aa		28.51	■■■□□ 2.16
TNIP2-204	ENST00000505186	TMEM94	Q12767	1356 aa		28.5	■■■□□ 2.15
TNIP2-204	ENST00000505186	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		28.5	■■■□□ 2.15
TNIP2-204	ENST00000505186	KCNA6	P17658	529 aa		28.48	■■■□□ 2.15
TNIP2-204	ENST00000505186	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	28.47	■■■□□ 2.15
TNIP2-204	ENST00000505186	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		28.46	■■■□□ 2.15
TNIP2-204	ENST00000505186	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		28.46	■■■□□ 2.15
TNIP2-204	ENST00000505186	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		28.45	■■■□□ 2.15
TNIP2-204	ENST00000505186	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	28.45	■■■□□ 2.14
TNIP2-204	ENST00000505186	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	28.44	■■■□□ 2.14
TNIP2-204	ENST00000505186	NWD1	Q149M9	1564 aa		28.44	■■■□□ 2.14
TNIP2-204	ENST00000505186	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	28.43	■■■□□ 2.14

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