RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498678.5

HOXB3-212, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-212ENST00000498678 MLH3Q9UHC1 1453 aa37.36■■■■□ 3.57
HOXB3-212ENST00000498678 L3MBTL2Q969R5 705 aa37.35■■■■□ 3.57
HOXB3-212ENST00000498678 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP37.34■■■■□ 3.57
HOXB3-212ENST00000498678 TEX14Q8IWB6 1497 aa37.31■■■■□ 3.56
HOXB3-212ENST00000498678 RAPGEF3O95398 923 aa37.3■■■■□ 3.56
HOXB3-212ENST00000498678 HECW2Q9P2P5 1572 aa37.3■■■■□ 3.56
HOXB3-212ENST00000498678 DEPDC5O75140 1603 aa37.28■■■■□ 3.56
HOXB3-212ENST00000498678 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP37.27■■■■□ 3.56
HOXB3-212ENST00000498678 KIF3BO15066 747 aa37.24■■■■□ 3.55
HOXB3-212ENST00000498678 A2MP01023 1474 aa37.24■■■■□ 3.55
HOXB3-212ENST00000498678 RICTORQ6R327 1708 aa37.23■■■■□ 3.55
HOXB3-212ENST00000498678 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP37.22■■■■□ 3.55
HOXB3-212ENST00000498678 TSPOAP1O95153 1857 aa37.18■■■■□ 3.54
HOXB3-212ENST00000498678 PLA2R1Q13018 1463 aa37.18■■■■□ 3.54
HOXB3-212ENST00000498678 ABCA6Q8N139 1617 aa37.17■■■■□ 3.54
HOXB3-212ENST00000498678 VWDEQ8N2E2 1590 aa37.17■■■■□ 3.54
HOXB3-212ENST00000498678 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa37.15■■■■□ 3.54
HOXB3-212ENST00000498678 MROH1Q8NDA8 1641 aa37.15■■■■□ 3.54
HOXB3-212ENST00000498678 KIF13AQ9H1H9 1805 aa37.15■■■■□ 3.54
HOXB3-212ENST00000498678 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP37.15■■■■□ 3.54
HOXB3-212ENST00000498678 KANK1Q14678 1352 aa37.14■■■■□ 3.54
HOXB3-212ENST00000498678 ATP10AO60312 1499 aa37.11■■■■□ 3.53
HOXB3-212ENST00000498678 CCDC144AA2RUR9 1427 aa37.1■■■■□ 3.53
HOXB3-212ENST00000498678 NBPF8Q3BBV2 869 aa37.08■■■■□ 3.53
HOXB3-212ENST00000498678 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa37.08■■■■□ 3.53
HOXB3-212ENST00000498678 E9PCH4 1651 aa37.08■■■■□ 3.53
HOXB3-212ENST00000498678 TET3O43151 1660 aa37.07■■■■□ 3.52
HOXB3-212ENST00000498678 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP37.06■■■■□ 3.52
HOXB3-212ENST00000498678 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa37.03■■■■□ 3.52
HOXB3-212ENST00000498678 BCORL1Q5H9F3 1711 aa37.03■■■■□ 3.52
HOXB3-212ENST00000498678 YEATS2Q9ULM3 1422 aa37.02■■■■□ 3.52
HOXB3-212ENST00000498678 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP36.97■■■■□ 3.51
HOXB3-212ENST00000498678 PTPRTO14522 1441 aa36.96■■■■□ 3.51
HOXB3-212ENST00000498678 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.96■■■■□ 3.51
HOXB3-212ENST00000498678 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa36.93■■■■□ 3.5
HOXB3-212ENST00000498678 GGT6Q6P531 493 aa36.93■■■■□ 3.5
HOXB3-212ENST00000498678 TRPM2O94759 1503 aa36.92■■■■□ 3.5
HOXB3-212ENST00000498678 EFCAB6Q5THR3 1501 aa36.91■■■■□ 3.5
HOXB3-212ENST00000498678 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa36.9■■■■□ 3.5
HOXB3-212ENST00000498678 DCAF11Q8TEB1 546 aa36.89■■■■□ 3.5
HOXB3-212ENST00000498678 CEP152O94986 1710 aa36.88■■■■□ 3.49
HOXB3-212ENST00000498678 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.87■■■■□ 3.49
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HOXB3-212ENST00000498678 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP36.85■■■■□ 3.494e-7■■■□□ 18.3
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HOXB3-212ENST00000498678 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa36.85■■■■□ 3.49
HOXB3-212ENST00000498678 RGL3Q3MIN7 710 aa36.84■■■■□ 3.49
HOXB3-212ENST00000498678 ABCC3O15438 1527 aa36.81■■■■□ 3.48
HOXB3-212ENST00000498678 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa36.8■■■■□ 3.48
HOXB3-212ENST00000498678 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa36.8■■■■□ 3.48
HOXB3-212ENST00000498678 CLTCL1P53675 1640 aa36.79■■■■□ 3.48
HOXB3-212ENST00000498678 MIER1Q8N108 512 aa36.76■■■■□ 3.48
HOXB3-212ENST00000498678 RALGAPBQ86X10 1494 aa36.76■■■■□ 3.47
HOXB3-212ENST00000498678 REREQ9P2R6 1566 aa36.75■■■■□ 3.47
HOXB3-212ENST00000498678 NPATQ14207 1427 aa36.75■■■■□ 3.47
HOXB3-212ENST00000498678 PRAG1Q86YV5 1406 aa36.72■■■■□ 3.47
HOXB3-212ENST00000498678 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa36.69■■■■□ 3.46
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HOXB3-212ENST00000498678 NEURL4Q96JN8 1562 aa36.64■■■■□ 3.46
HOXB3-212ENST00000498678 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.62■■■■□ 3.45
HOXB3-212ENST00000498678 USP47Q96K76 1375 aa36.61■■■■□ 3.45
HOXB3-212ENST00000498678 CNTLNQ9NXG0 1405 aa36.6■■■■□ 3.45
HOXB3-212ENST00000498678 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.6■■■■□ 3.45
HOXB3-212ENST00000498678 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa36.6■■■■□ 3.45
HOXB3-212ENST00000498678 CARD11Q9BXL7 1154 aa36.6■■■■□ 3.45
HOXB3-212ENST00000498678 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.58■■■■□ 3.45
HOXB3-212ENST00000498678 WASHC2AQ641Q2 1341 aa36.57■■■■□ 3.44
HOXB3-212ENST00000498678 NOS1P29475 1434 aa36.57■■■■□ 3.44
HOXB3-212ENST00000498678 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP36.57■■■■□ 3.44
HOXB3-212ENST00000498678 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP36.56■■■■□ 3.44
HOXB3-212ENST00000498678 STAC3Q96MF2 364 aa36.56■■■■□ 3.44
HOXB3-212ENST00000498678 KIF1BO60333 1816 aa36.55■■■■□ 3.44
HOXB3-212ENST00000498678 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.53■■■■□ 3.44
HOXB3-212ENST00000498678 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP36.53■■■■□ 3.44
HOXB3-212ENST00000498678 PPP6R1Q9UPN7 881 aa36.53■■■■□ 3.44
HOXB3-212ENST00000498678 NBPF1Q3BBV0 1214 aa36.5■■■■□ 3.43
HOXB3-212ENST00000498678 GPRASP1Q5JY77 1395 aa36.5■■■■□ 3.43
HOXB3-212ENST00000498678 MADDQ8WXG6 1647 aa36.48■■■■□ 3.43
HOXB3-212ENST00000498678 MROH2AA6NES4 1674 aa36.47■■■■□ 3.43
HOXB3-212ENST00000498678 SYNMO15061 1565 aa36.47■■■■□ 3.43
HOXB3-212ENST00000498678 ADGRB3O60242 1522 aa36.47■■■■□ 3.43
HOXB3-212ENST00000498678 CCDC7Q96M83 1385 aa36.46■■■■□ 3.43
HOXB3-212ENST00000498678 PIK3C2BO00750 1634 aa36.43■■■■□ 3.42
HOXB3-212ENST00000498678 LAMC1P11047 1609 aa36.43■■■■□ 3.42
HOXB3-212ENST00000498678 CHGAP10645 457 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
HOXB3-212ENST00000498678 MLECQ14165 292 aa36.4■■■■□ 3.42
HOXB3-212ENST00000498678 MYOM2P54296 1465 aa36.39■■■■□ 3.42
HOXB3-212ENST00000498678 KIF7Q2M1P5 1343 aa36.39■■■■□ 3.42
HOXB3-212ENST00000498678 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
HOXB3-212ENST00000498678 PREX1Q8TCU6 1659 aa36.38■■■■□ 3.42
HOXB3-212ENST00000498678 IFT172Q9UG01 1749 aa36.38■■■■□ 3.41
HOXB3-212ENST00000498678 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa36.37■■■■□ 3.41
HOXB3-212ENST00000498678 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP36.36■■■■□ 3.41
HOXB3-212ENST00000498678 SLC52A1Q9NWF4 448 aa36.34■■■■□ 3.41
HOXB3-212ENST00000498678 IDI1Q13907 227 aa36.33■■■■□ 3.41
HOXB3-212ENST00000498678 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
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