RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498438.1

HOXD11-202, Transcript of homeobox D11, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HOXD11, Length 1,259 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-202ENST00000498438 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
HOXD11-202ENST00000498438 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
HOXD11-202ENST00000498438 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXD11-202ENST00000498438 PTPRKQ15262 1439 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXD11-202ENST00000498438 KIF15Q9NS87 1388 aa28.51■■■□□ 2.16
HOXD11-202ENST00000498438 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.49■■■□□ 2.15
HOXD11-202ENST00000498438 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.47■■■□□ 2.15
HOXD11-202ENST00000498438 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.47■■■□□ 2.15
HOXD11-202ENST00000498438 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
HOXD11-202ENST00000498438 STRCQ7RTU9 1775 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXD11-202ENST00000498438 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.15
HOXD11-202ENST00000498438 ERBINQ96RT1 1412 aa28.45■■■□□ 2.15
HOXD11-202ENST00000498438 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.45■■■□□ 2.14
HOXD11-202ENST00000498438 PZPP20742 1482 aa28.45■■■□□ 2.14
HOXD11-202ENST00000498438 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
HOXD11-202ENST00000498438 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.44■■■□□ 2.14
HOXD11-202ENST00000498438 ABCC3O15438 1527 aa28.43■■■□□ 2.14
HOXD11-202ENST00000498438 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.42■■■□□ 2.14
HOXD11-202ENST00000498438 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
HOXD11-202ENST00000498438 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
HOXD11-202ENST00000498438 CEP152O94986 1710 aa28.39■■■□□ 2.14
HOXD11-202ENST00000498438 ADGRL2O95490 1459 aa28.39■■■□□ 2.13
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HOXD11-202ENST00000498438 NCOA1Q15788 1441 aa28.38■■■□□ 2.13
HOXD11-202ENST00000498438 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.37■■■□□ 2.13
HOXD11-202ENST00000498438 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
HOXD11-202ENST00000498438 DEPDC5O75140 1603 aa28.36■■■□□ 2.13
HOXD11-202ENST00000498438 TNRQ92752 1358 aa28.36■■■□□ 2.13
HOXD11-202ENST00000498438 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD11-202ENST00000498438 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXD11-202ENST00000498438 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXD11-202ENST00000498438 PLA2R1Q13018 1463 aa28.27■■■□□ 2.12
HOXD11-202ENST00000498438 PTPRTO14522 1441 aa28.27■■■□□ 2.12
HOXD11-202ENST00000498438 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
HOXD11-202ENST00000498438 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.26■■■□□ 2.11
HOXD11-202ENST00000498438 ERVK-7P63135 1459 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXD11-202ENST00000498438 NLRP1Q9C000 1473 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXD11-202ENST00000498438 KANK1Q14678 1352 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXD11-202ENST00000498438 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
HOXD11-202ENST00000498438 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.23■■■□□ 2.11
HOXD11-202ENST00000498438 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.23■■■□□ 2.11
HOXD11-202ENST00000498438 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.22■■■□□ 2.11
HOXD11-202ENST00000498438 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXD11-202ENST00000498438 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.2■■■□□ 2.11
HOXD11-202ENST00000498438 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.19■■■□□ 2.1
HOXD11-202ENST00000498438 ROCK1Q13464 1354 aa28.19■■■□□ 2.1
HOXD11-202ENST00000498438 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.18■■■□□ 2.1
HOXD11-202ENST00000498438 PKD2Q13563 968 aa28.17■■■□□ 2.1
HOXD11-202ENST00000498438 ITGAEP38570 1179 aa28.16■■■□□ 2.1
HOXD11-202ENST00000498438 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
HOXD11-202ENST00000498438 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
HOXD11-202ENST00000498438 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.13■■■□□ 2.09
HOXD11-202ENST00000498438 FBXO41Q8TF61 875 aa28.12■■■□□ 2.09
HOXD11-202ENST00000498438 UNC13BO14795 1591 aa28.11■■■□□ 2.09
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HOXD11-202ENST00000498438 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXD11-202ENST00000498438 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
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HOXD11-202ENST00000498438 PIK3C2BO00750 1634 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXD11-202ENST00000498438 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.02■■■□□ 2.08
HOXD11-202ENST00000498438 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.02■■■□□ 2.08
HOXD11-202ENST00000498438 NOS1P29475 1434 aa28.01■■■□□ 2.07
HOXD11-202ENST00000498438 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
HOXD11-202ENST00000498438 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28■■■□□ 2.07
HOXD11-202ENST00000498438 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
HOXD11-202ENST00000498438 MED14O60244 1454 aa27.97■■■□□ 2.07
HOXD11-202ENST00000498438 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
HOXD11-202ENST00000498438 IQGAP1P46940 1657 aa27.95■■■□□ 2.07
HOXD11-202ENST00000498438 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
HOXD11-202ENST00000498438 SLIT1O75093 1534 aa27.94■■■□□ 2.06
HOXD11-202ENST00000498438 ARHGAP23Q9P227 1491 aa27.94■■■□□ 2.06
HOXD11-202ENST00000498438 E9PCH4 1651 aa27.94■■■□□ 2.06
HOXD11-202ENST00000498438 NUP155O75694 1391 aa27.92■■■□□ 2.06
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HOXD11-202ENST00000498438 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
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HOXD11-202ENST00000498438 ADGRB3O60242 1522 aa27.9■■■□□ 2.06
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HOXD11-202ENST00000498438 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.89■■■□□ 2.06
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HOXD11-202ENST00000498438 LTKP29376 864 aa27.85■■■□□ 2.05
HOXD11-202ENST00000498438 TXNDC2Q86VQ3 553 aa27.84■■■□□ 2.05
HOXD11-202ENST00000498438 HFM1A2PYH4 1435 aa27.84■■■□□ 2.05
HOXD11-202ENST00000498438 EID1Q9Y6B2 187 aa27.82■■■□□ 2.04
HOXD11-202ENST00000498438 MYO5BQ9ULV0 1848 aa27.82■■■□□ 2.04
HOXD11-202ENST00000498438 CPS1P31327 1500 aa27.81■■■□□ 2.04
HOXD11-202ENST00000498438 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa27.78■■■□□ 2.04
HOXD11-202ENST00000498438 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXD11-202ENST00000498438 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXD11-202ENST00000498438 ZFYVE9O95405 1425 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXD11-202ENST00000498438 CHGAP10645 457 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
HOXD11-202ENST00000498438 RIMS2Q9UQ26 1411 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXD11-202ENST00000498438 TRIM52Q96A61 297 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXD11-202ENST00000498438 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXD11-202ENST00000498438 LRRC7Q96NW7 1537 aa27.64■■■□□ 2.02
HOXD11-202ENST00000498438 TRPM2O94759 1503 aa27.63■■■□□ 2.01
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