RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-215ENST00000498284 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-215ENST00000498284 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-215ENST00000498284 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-215ENST00000498284 ZDHHC16Q969W1 377 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-215ENST00000498284 MAP3K7O43318 606 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-215ENST00000498284 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-215ENST00000498284 ADAM33Q9BZ11 813 aa10.17□□□□□ -0.78
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PTPRK-215ENST00000498284 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-215ENST00000498284 BCL2L12Q9HB09 334 aa10.13□□□□□ -0.79
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PTPRK-215ENST00000498284 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
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PTPRK-215ENST00000498284 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa9.9□□□□□ -0.82
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PTPRK-215ENST00000498284 NUDT18Q6ZVK8 323 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-215ENST00000498284 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-215ENST00000498284 RABGEF1Q9UJ41 708 aa9.89□□□□□ -0.83
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PTPRK-215ENST00000498284 AMHR2Q16671 573 aa9.88□□□□□ -0.83
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PTPRK-215ENST00000498284 PNMA3Q9UL41 463 aa9.88□□□□□ -0.83
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PTPRK-215ENST00000498284 NEUROD2Q15784 382 aa9.86□□□□□ -0.83
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PTPRK-215ENST00000498284 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRK-215ENST00000498284 NLRP7Q8WX94 980 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRK-215ENST00000498284 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
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PTPRK-215ENST00000498284 PARP9Q8IXQ6 854 aa9.82□□□□□ -0.84
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PTPRK-215ENST00000498284 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRK-215ENST00000498284 CLCN1P35523 988 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRK-215ENST00000498284 HRO43593 1189 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRK-215ENST00000498284 DNAJB2P25686 324 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRK-215ENST00000498284 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPRK-215ENST00000498284 KDM4CQ9H3R0 1056 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRK-215ENST00000498284 GPCPD1Q9NPB8 672 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRK-215ENST00000498284 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
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