RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497348.1

MAGED4-208, Transcript of MAGE family member D4, human

TSL 5

Gene MAGED4, Length 512 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MAGED4-208	ENST00000497348	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MAGED4-208	ENST00000497348	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
MAGED4-208	ENST00000497348	TSPY4	P0CV99	314 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MAGED4-208	ENST00000497348	TSPY10	P0CW01	314 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MAGED4-208	ENST00000497348	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		12.04	□□□□□ -0.48
MAGED4-208	ENST00000497348	NPAT	Q14207	1427 aa		12.03	□□□□□ -0.48
MAGED4-208	ENST00000497348	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
MAGED4-208	ENST00000497348	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
MAGED4-208	ENST00000497348	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		12.02	□□□□□ -0.48
MAGED4-208	ENST00000497348	GGT6	Q6P531	493 aa		12.02	□□□□□ -0.49
MAGED4-208	ENST00000497348	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		12.02	□□□□□ -0.49
MAGED4-208	ENST00000497348	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
MAGED4-208	ENST00000497348	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		12.02	□□□□□ -0.49
MAGED4-208	ENST00000497348	ABCC5	O15440	1437 aa		12.02	□□□□□ -0.49
MAGED4-208	ENST00000497348	DAPK1	P53355	1430 aa		12.02	□□□□□ -0.49
MAGED4-208	ENST00000497348	PTPRK	Q15262	1439 aa		12.02	□□□□□ -0.49
MAGED4-208	ENST00000497348	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		12.01	□□□□□ -0.49
MAGED4-208	ENST00000497348	ZMYM3	Q14202	1370 aa		12	□□□□□ -0.49
MAGED4-208	ENST00000497348	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
MAGED4-208	ENST00000497348	PLA2R1	Q13018	1463 aa		12	□□□□□ -0.49
MAGED4-208	ENST00000497348	KIF3B	O15066	747 aa		11.99	□□□□□ -0.49
MAGED4-208	ENST00000497348	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		11.99	□□□□□ -0.49
MAGED4-208	ENST00000497348	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		11.99	□□□□□ -0.49
MAGED4-208	ENST00000497348	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
MAGED4-208	ENST00000497348	CEP152	O94986	1710 aa		11.98	□□□□□ -0.49
MAGED4-208	ENST00000497348	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
MAGED4-208	ENST00000497348	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
MAGED4-208	ENST00000497348	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
MAGED4-208	ENST00000497348	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		11.96	□□□□□ -0.49
MAGED4-208	ENST00000497348	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		11.96	□□□□□ -0.49
MAGED4-208	ENST00000497348	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		11.96	□□□□□ -0.49
MAGED4-208	ENST00000497348	KIF15	Q9NS87	1388 aa		11.96	□□□□□ -0.49
MAGED4-208	ENST00000497348	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		11.96	□□□□□ -0.49
MAGED4-208	ENST00000497348	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MAGED4-208	ENST00000497348	ITGAE	P38570	1179 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MAGED4-208	ENST00000497348	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MAGED4-208	ENST00000497348	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		11.93	□□□□□ -0.5
MAGED4-208	ENST00000497348	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		11.93	□□□□□ -0.5
MAGED4-208	ENST00000497348	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
MAGED4-208	ENST00000497348	IQGAP1	P46940	1657 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MAGED4-208	ENST00000497348	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MAGED4-208	ENST00000497348	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
MAGED4-208	ENST00000497348	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MAGED4-208	ENST00000497348	PZP	P20742	1482 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MAGED4-208	ENST00000497348	ALK	Q9UM73	1620 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MAGED4-208	ENST00000497348	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MAGED4-208	ENST00000497348	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MAGED4-208	ENST00000497348	TNR	Q92752	1358 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MAGED4-208	ENST00000497348	ADGRL2	O95490	1459 aa		11.9	□□□□□ -0.5
MAGED4-208	ENST00000497348	DEPDC5	O75140	1603 aa		11.9	□□□□□ -0.5
MAGED4-208	ENST00000497348	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	11.9	□□□□□ -0.5
MAGED4-208	ENST00000497348	ABCC3	O15438	1527 aa		11.9	□□□□□ -0.5
MAGED4-208	ENST00000497348	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		11.9	□□□□□ -0.5
MAGED4-208	ENST00000497348	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
MAGED4-208	ENST00000497348	CPS1	P31327	1500 aa		11.88	□□□□□ -0.51
MAGED4-208	ENST00000497348	PKD2	Q13563	968 aa		11.88	□□□□□ -0.51
MAGED4-208	ENST00000497348	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		11.88	□□□□□ -0.51
MAGED4-208	ENST00000497348	PIP4K2B	P78356	416 aa		11.87	□□□□□ -0.51
MAGED4-208	ENST00000497348	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
MAGED4-208	ENST00000497348	SYNM	O15061	1565 aa		11.87	□□□□□ -0.51
MAGED4-208	ENST00000497348	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
MAGED4-208	ENST00000497348	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		11.86	□□□□□ -0.51
MAGED4-208	ENST00000497348	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
MAGED4-208	ENST00000497348	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	11.86	□□□□□ -0.51
MAGED4-208	ENST00000497348	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		11.86	□□□□□ -0.51
MAGED4-208	ENST00000497348	KANK1	Q14678	1352 aa		11.85	□□□□□ -0.51
MAGED4-208	ENST00000497348	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
MAGED4-208	ENST00000497348	HSPA1L	P34931	641 aa		11.83	□□□□□ -0.52
MAGED4-208	ENST00000497348	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.52
MAGED4-208	ENST00000497348	UNC13B	O14795	1591 aa		11.83	□□□□□ -0.52
MAGED4-208	ENST00000497348	ERVK-7	P63135	1459 aa		11.83	□□□□□ -0.52
MAGED4-208	ENST00000497348	NLRP1	Q9C000	1473 aa		11.83	□□□□□ -0.52
MAGED4-208	ENST00000497348	ROCK1	Q13464	1354 aa		11.82	□□□□□ -0.52
MAGED4-208	ENST00000497348	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		11.82	□□□□□ -0.52
MAGED4-208	ENST00000497348	TET3	O43151	1660 aa		11.8	□□□□□ -0.52
MAGED4-208	ENST00000497348	PIK3C2B	O00750	1634 aa		11.79	□□□□□ -0.52
MAGED4-208	ENST00000497348	MED14	O60244	1454 aa		11.79	□□□□□ -0.52
MAGED4-208	ENST00000497348	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		11.79	□□□□□ -0.52
MAGED4-208	ENST00000497348	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		11.78	□□□□□ -0.52
MAGED4-208	ENST00000497348	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		11.78	□□□□□ -0.52
MAGED4-208	ENST00000497348	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		11.78	□□□□□ -0.52
MAGED4-208	ENST00000497348		E9PCH4	1651 aa		11.78	□□□□□ -0.52
MAGED4-208	ENST00000497348	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		11.77	□□□□□ -0.52
MAGED4-208	ENST00000497348	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MAGED4-208	ENST00000497348	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
MAGED4-208	ENST00000497348	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
MAGED4-208	ENST00000497348	TOM1	O60784	492 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MAGED4-208	ENST00000497348	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MAGED4-208	ENST00000497348	NUP155	O75694	1391 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MAGED4-208	ENST00000497348	NAIP	Q13075	1403 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MAGED4-208	ENST00000497348	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
MAGED4-208	ENST00000497348	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		11.72	□□□□□ -0.53
MAGED4-208	ENST00000497348	SLIT1	O75093	1534 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MAGED4-208	ENST00000497348	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MAGED4-208	ENST00000497348	HFM1	A2PYH4	1435 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MAGED4-208	ENST00000497348	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
MAGED4-208	ENST00000497348	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MAGED4-208	ENST00000497348	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		11.71	□□□□□ -0.54
MAGED4-208	ENST00000497348	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
MAGED4-208	ENST00000497348	TRIM52	Q96A61	297 aa		11.7	□□□□□ -0.54

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