RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495040.1

PLXNA3-208, Transcript of plexin A3, humanhuman

TSL 5

Gene PLXNA3, Length 421 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA3-208ENST00000495040 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP41.55■■■■■ 4.24
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PLXNA3-208ENST00000495040 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.53■■■■■ 4.24
PLXNA3-208ENST00000495040 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.52■■■■■ 4.24
PLXNA3-208ENST00000495040 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.24
PLXNA3-208ENST00000495040 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
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PLXNA3-208ENST00000495040 DAPK1P53355 1430 aa41.44■■■■■ 4.22
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PLXNA3-208ENST00000495040 A2ML1A8K2U0 1454 aa41.41■■■■■ 4.22
PLXNA3-208ENST00000495040 KIF15Q9NS87 1388 aa41.4■■■■■ 4.22
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PLXNA3-208ENST00000495040 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa41.35■■■■■ 4.21
PLXNA3-208ENST00000495040 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.34■■■■■ 4.21
PLXNA3-208ENST00000495040 ERBINQ96RT1 1412 aa41.33■■■■■ 4.21
PLXNA3-208ENST00000495040 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.27■■■■■ 4.2
PLXNA3-208ENST00000495040 NLRP1Q9C000 1473 aa41.26■■■■■ 4.2
PLXNA3-208ENST00000495040 CEP152O94986 1710 aa41.25■■■■■ 4.19
PLXNA3-208ENST00000495040 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.25■■■■■ 4.19
PLXNA3-208ENST00000495040 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
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PLXNA3-208ENST00000495040 LTBP4Q8N2S1 1624 aa41.2■■■■■ 4.19
PLXNA3-208ENST00000495040 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.2■■■■■ 4.19
PLXNA3-208ENST00000495040 ERVK-7P63135 1459 aa41.16■■■■■ 4.18
PLXNA3-208ENST00000495040 DEPDC5O75140 1603 aa41.16■■■■■ 4.18
PLXNA3-208ENST00000495040 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP41.16■■■■■ 4.18
PLXNA3-208ENST00000495040 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.15■■■■■ 4.18
PLXNA3-208ENST00000495040 ADGRL2O95490 1459 aa41.15■■■■■ 4.18
PLXNA3-208ENST00000495040 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.14■■■■■ 4.18
PLXNA3-208ENST00000495040 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.17
PLXNA3-208ENST00000495040 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.12■■■■■ 4.171e-7■■■■□ 19.4
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PLXNA3-208ENST00000495040 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.11■■■■■ 4.17
PLXNA3-208ENST00000495040 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.09■■■■■ 4.171e-6■■■■□ 21.4
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PLXNA3-208ENST00000495040 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP41.07■■■■■ 4.17
PLXNA3-208ENST00000495040 IQSEC2Q5JU85 1478 aa41.06■■■■■ 4.16
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PLXNA3-208ENST00000495040 LMTK2Q8IWU2 1503 aa40.99■■■■■ 4.15
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PLXNA3-208ENST00000495040 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.84■■■■■ 4.13
PLXNA3-208ENST00000495040 IQGAP1P46940 1657 aa40.84■■■■■ 4.13
PLXNA3-208ENST00000495040 PIK3C2BO00750 1634 aa40.79■■■■■ 4.12
PLXNA3-208ENST00000495040 CPS1P31327 1500 aa40.79■■■■■ 4.12
PLXNA3-208ENST00000495040 SLIT1O75093 1534 aa40.77■■■■■ 4.12
PLXNA3-208ENST00000495040 ARHGAP23Q9P227 1491 aa40.77■■■■■ 4.12
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PLXNA3-208ENST00000495040 UNC13BO14795 1591 aa40.73■■■■■ 4.11
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PLXNA3-208ENST00000495040 TET3O43151 1660 aa40.72■■■■■ 4.11
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PLXNA3-208ENST00000495040 LTKP29376 864 aa40.69■■■■■ 4.1
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PLXNA3-208ENST00000495040 HDGFP51858 240 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.05
PLXNA3-208ENST00000495040 ZFYVE9O95405 1425 aa40.35■■■■■ 4.05
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PLXNA3-208ENST00000495040 RIMS2Q9UQ26 1411 aa40.33■■■■■ 4.05
PLXNA3-208ENST00000495040 CHGAP10645 457 aaKnown RBP40.33■■■■■ 4.05
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