RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
TRDMT1-211ENST00000495022 TSPY4P0CV99 314 aa35.76■■■■□ 3.32
TRDMT1-211ENST00000495022 TSPY10P0CW01 314 aa35.76■■■■□ 3.32
TRDMT1-211ENST00000495022 PKD2Q13563 968 aa35.76■■■■□ 3.32
TRDMT1-211ENST00000495022 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.76■■■■□ 3.32
TRDMT1-211ENST00000495022 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.76■■■■□ 3.32
TRDMT1-211ENST00000495022 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.75■■■■□ 3.31
TRDMT1-211ENST00000495022 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
TRDMT1-211ENST00000495022 PZPP20742 1482 aa35.74■■■■□ 3.31
TRDMT1-211ENST00000495022 MIA2Q96PC5 1412 aa35.7■■■■□ 3.31
TRDMT1-211ENST00000495022 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
TRDMT1-211ENST00000495022 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.68■■■■□ 3.3
TRDMT1-211ENST00000495022 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.68■■■■□ 3.3
TRDMT1-211ENST00000495022 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
TRDMT1-211ENST00000495022 TNRQ92752 1358 aa35.67■■■■□ 3.3
TRDMT1-211ENST00000495022 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
TRDMT1-211ENST00000495022 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.66■■■■□ 3.3
TRDMT1-211ENST00000495022 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
TRDMT1-211ENST00000495022 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
TRDMT1-211ENST00000495022 NLRP1Q9C000 1473 aa35.57■■■■□ 3.29
TRDMT1-211ENST00000495022 ABCC3O15438 1527 aa35.56■■■■□ 3.28
TRDMT1-211ENST00000495022 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.54■■■■□ 3.28
TRDMT1-211ENST00000495022 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.54■■■■□ 3.28
TRDMT1-211ENST00000495022 MROH1Q8NDA8 1641 aa35.53■■■■□ 3.28
TRDMT1-211ENST00000495022 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.51■■■■□ 3.28
TRDMT1-211ENST00000495022 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.5■■■■□ 3.27
TRDMT1-211ENST00000495022 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.49■■■■□ 3.27
TRDMT1-211ENST00000495022 CEP152O94986 1710 aa35.49■■■■□ 3.27
TRDMT1-211ENST00000495022 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.48■■■■□ 3.27
TRDMT1-211ENST00000495022 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa35.48■■■■□ 3.27
TRDMT1-211ENST00000495022 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
TRDMT1-211ENST00000495022 APLP2Q06481 763 aa35.46■■■■□ 3.27
TRDMT1-211ENST00000495022 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
TRDMT1-211ENST00000495022 DEPDC5O75140 1603 aa35.45■■■■□ 3.27
TRDMT1-211ENST00000495022 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.43■■■■□ 3.26
TRDMT1-211ENST00000495022 ANKLE2Q86XL3 938 aa35.42■■■■□ 3.26
TRDMT1-211ENST00000495022 ERVK-7P63135 1459 aa35.42■■■■□ 3.26
TRDMT1-211ENST00000495022 ABCC5O15440 1437 aa35.41■■■■□ 3.26
TRDMT1-211ENST00000495022 KIF15Q9NS87 1388 aa35.39■■■■□ 3.26
TRDMT1-211ENST00000495022 CPS1P31327 1500 aa35.39■■■■□ 3.26
TRDMT1-211ENST00000495022 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
TRDMT1-211ENST00000495022 MED14O60244 1454 aa35.39■■■■□ 3.26
TRDMT1-211ENST00000495022 ERBINQ96RT1 1412 aa35.39■■■■□ 3.26
TRDMT1-211ENST00000495022 UBAP1LF5GYI3 381 aa35.37■■■■□ 3.25
TRDMT1-211ENST00000495022 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.36■■■■□ 3.25
TRDMT1-211ENST00000495022 DISP3Q9P2K9 1392 aa35.36■■■■□ 3.25
TRDMT1-211ENST00000495022 IQGAP1P46940 1657 aa35.35■■■■□ 3.25
TRDMT1-211ENST00000495022 DAPK1P53355 1430 aa35.34■■■■□ 3.25
TRDMT1-211ENST00000495022 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
TRDMT1-211ENST00000495022 VWDEQ8N2E2 1590 aa35.33■■■■□ 3.25
TRDMT1-211ENST00000495022 UBR1Q8IWV7 1749 aa35.32■■■■□ 3.25
TRDMT1-211ENST00000495022 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa35.29■■■■□ 3.24
TRDMT1-211ENST00000495022 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.28■■■■□ 3.24
TRDMT1-211ENST00000495022 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.21■■■■□ 3.23
TRDMT1-211ENST00000495022 KANK1Q14678 1352 aa35.18■■■■□ 3.22
TRDMT1-211ENST00000495022 STRCP1A6NGW2 1772 aa35.18■■■■□ 3.22
TRDMT1-211ENST00000495022 SLIT1O75093 1534 aa35.16■■■■□ 3.22
TRDMT1-211ENST00000495022 LMTK2Q8IWU2 1503 aa35.16■■■■□ 3.22
TRDMT1-211ENST00000495022 TOM1O60784 492 aa35.15■■■■□ 3.22
TRDMT1-211ENST00000495022 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP35.15■■■■□ 3.22
TRDMT1-211ENST00000495022 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.15■■■■□ 3.22
TRDMT1-211ENST00000495022 ILDR2Q71H61 639 aa35.14■■■■□ 3.22
TRDMT1-211ENST00000495022 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.14■■■■□ 3.22
TRDMT1-211ENST00000495022 SYNMO15061 1565 aa35.13■■■■□ 3.21
TRDMT1-211ENST00000495022 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
TRDMT1-211ENST00000495022 PIK3C2BO00750 1634 aa35.13■■■■□ 3.21
TRDMT1-211ENST00000495022 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.13■■■■□ 3.21
TRDMT1-211ENST00000495022 ADGRL2O95490 1459 aa35.12■■■■□ 3.21
TRDMT1-211ENST00000495022 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
TRDMT1-211ENST00000495022 PIP4K2BP78356 416 aa35.05■■■■□ 3.2
TRDMT1-211ENST00000495022 EFCAB6Q5THR3 1501 aa35.05■■■■□ 3.2
TRDMT1-211ENST00000495022 LRRC7Q96NW7 1537 aa35.05■■■■□ 3.2
TRDMT1-211ENST00000495022 ALKQ9UM73 1620 aa35.05■■■■□ 3.2
TRDMT1-211ENST00000495022 LTKP29376 864 aa35.03■■■■□ 3.2
TRDMT1-211ENST00000495022 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.02■■■■□ 3.2
TRDMT1-211ENST00000495022 EID1Q9Y6B2 187 aa35■■■■□ 3.19
TRDMT1-211ENST00000495022 HSPA1LP34931 641 aa35■■■■□ 3.19
TRDMT1-211ENST00000495022 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35■■■■□ 3.19
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP34.99■■■■□ 3.19
TRDMT1-211ENST00000495022 SOCS7O14512 581 aa34.98■■■■□ 3.19
TRDMT1-211ENST00000495022 NOS1P29475 1434 aa34.97■■■■□ 3.19
TRDMT1-211ENST00000495022 STAG3Q9UJ98 1225 aa34.96■■■■□ 3.19
TRDMT1-211ENST00000495022 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa34.95■■■■□ 3.19
TRDMT1-211ENST00000495022 IDI1Q13907 227 aa34.94■■■■□ 3.18
TRDMT1-211ENST00000495022 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP34.94■■■■□ 3.18
TRDMT1-211ENST00000495022 ADGRB3O60242 1522 aa34.92■■■■□ 3.18
TRDMT1-211ENST00000495022 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP34.92■■■■□ 3.18
TRDMT1-211ENST00000495022 TET3O43151 1660 aa34.9■■■■□ 3.18
TRDMT1-211ENST00000495022 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP34.88■■■■□ 3.17
TRDMT1-211ENST00000495022 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.88■■■■□ 3.17
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC52A1Q9NWF4 448 aa34.86■■■■□ 3.17
TRDMT1-211ENST00000495022 UNC13BO14795 1591 aa34.85■■■■□ 3.17
TRDMT1-211ENST00000495022 MYO5BQ9ULV0 1848 aa34.84■■■■□ 3.17
TRDMT1-211ENST00000495022 ROCK1Q13464 1354 aa34.77■■■■□ 3.16
TRDMT1-211ENST00000495022 E9PCH4 1651 aa34.73■■■■□ 3.15
TRDMT1-211ENST00000495022 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa34.73■■■■□ 3.15
TRDMT1-211ENST00000495022 IQGAP3Q86VI3 1631 aa34.72■■■■□ 3.15
TRDMT1-211ENST00000495022 NWD1Q149M9 1564 aa34.72■■■■□ 3.15
TRDMT1-211ENST00000495022 KCNA6P17658 529 aa34.72■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms