RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493959.6

SENP6-211, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 867 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-211ENST00000493959 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.23■■■■□ 3.23
SENP6-211ENST00000493959 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
SENP6-211ENST00000493959 DAPK1P53355 1430 aa35.21■■■■□ 3.23
SENP6-211ENST00000493959 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.2■■■■□ 3.23
SENP6-211ENST00000493959 FBXO41Q8TF61 875 aa35.19■■■■□ 3.22
SENP6-211ENST00000493959 NCOA1Q15788 1441 aa35.17■■■■□ 3.22
SENP6-211ENST00000493959 KIF15Q9NS87 1388 aa35.17■■■■□ 3.22
SENP6-211ENST00000493959 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.17■■■■□ 3.22
SENP6-211ENST00000493959 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa35.17■■■■□ 3.22
SENP6-211ENST00000493959 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
SENP6-211ENST00000493959 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
SENP6-211ENST00000493959 MYO3AQ8NEV4 1616 aa35.15■■■■□ 3.22
SENP6-211ENST00000493959 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.15■■■■□ 3.22
SENP6-211ENST00000493959 CERKQ8TCT0 537 aa35.14■■■■□ 3.22
SENP6-211ENST00000493959 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.14■■■■□ 3.22
SENP6-211ENST00000493959 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.14■■■■□ 3.22
SENP6-211ENST00000493959 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.14■■■■□ 3.22
SENP6-211ENST00000493959 PZPP20742 1482 aa35.13■■■■□ 3.21
SENP6-211ENST00000493959 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
SENP6-211ENST00000493959 TNRQ92752 1358 aa35.12■■■■□ 3.21
SENP6-211ENST00000493959 PTPRTO14522 1441 aa35.11■■■■□ 3.21
SENP6-211ENST00000493959 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.11■■■■□ 3.21
SENP6-211ENST00000493959 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.1■■■■□ 3.21
SENP6-211ENST00000493959 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.09■■■■□ 3.21
SENP6-211ENST00000493959 ABCC3O15438 1527 aa35.08■■■■□ 3.21
SENP6-211ENST00000493959 MROH1Q8NDA8 1641 aa35.08■■■■□ 3.21
SENP6-211ENST00000493959 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
SENP6-211ENST00000493959 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.06■■■■□ 3.23e-7■□□□□ 10.1
SENP6-211ENST00000493959 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.05■■■■□ 3.2
SENP6-211ENST00000493959 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.04■■■■□ 3.2
SENP6-211ENST00000493959 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
SENP6-211ENST00000493959 ERBINQ96RT1 1412 aa35.01■■■■□ 3.2
SENP6-211ENST00000493959 PKD2Q13563 968 aa34.99■■■■□ 3.19
SENP6-211ENST00000493959 CEP152O94986 1710 aa34.98■■■■□ 3.19
SENP6-211ENST00000493959 PLA2R1Q13018 1463 aa34.97■■■■□ 3.19
SENP6-211ENST00000493959 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP34.94■■■■□ 3.18
SENP6-211ENST00000493959 ADGRL2O95490 1459 aa34.9■■■■□ 3.18
SENP6-211ENST00000493959 ERVK-7P63135 1459 aa34.9■■■■□ 3.18
SENP6-211ENST00000493959 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP34.9■■■■□ 3.18
SENP6-211ENST00000493959 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP34.89■■■■□ 3.18
SENP6-211ENST00000493959 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP34.89■■■■□ 3.18
SENP6-211ENST00000493959 NLRP1Q9C000 1473 aa34.89■■■■□ 3.18
SENP6-211ENST00000493959 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa34.88■■■■□ 3.17
SENP6-211ENST00000493959 LTBP4Q8N2S1 1624 aa34.88■■■■□ 3.17
SENP6-211ENST00000493959 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP34.87■■■■□ 3.17
SENP6-211ENST00000493959 DEPDC5O75140 1603 aa34.85■■■■□ 3.17
SENP6-211ENST00000493959 KANK1Q14678 1352 aa34.85■■■■□ 3.17
SENP6-211ENST00000493959 ITGAEP38570 1179 aa34.84■■■■□ 3.17
SENP6-211ENST00000493959 UGGT1Q9NYU2 1555 aa34.83■■■■□ 3.17
SENP6-211ENST00000493959 ANKLE2Q86XL3 938 aa34.83■■■■□ 3.17
SENP6-211ENST00000493959 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa34.82■■■■□ 3.17
SENP6-211ENST00000493959 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa34.81■■■■□ 3.16
SENP6-211ENST00000493959 VWDEQ8N2E2 1590 aa34.76■■■■□ 3.16
SENP6-211ENST00000493959 NEURL4Q96JN8 1562 aa34.76■■■■□ 3.16
SENP6-211ENST00000493959 LMTK2Q8IWU2 1503 aa34.72■■■■□ 3.15
SENP6-211ENST00000493959 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP34.72■■■■□ 3.15
SENP6-211ENST00000493959 ROCK1Q13464 1354 aa34.68■■■■□ 3.14
SENP6-211ENST00000493959 IDI1Q13907 227 aa34.68■■■■□ 3.14
SENP6-211ENST00000493959 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP34.66■■■■□ 3.14
SENP6-211ENST00000493959 UBR1Q8IWV7 1749 aa34.66■■■■□ 3.14
SENP6-211ENST00000493959 LTKP29376 864 aa34.64■■■■□ 3.14
SENP6-211ENST00000493959 MED14O60244 1454 aa34.63■■■■□ 3.13
SENP6-211ENST00000493959 TXNDC2Q86VQ3 553 aa34.61■■■■□ 3.13
SENP6-211ENST00000493959 EFCAB6Q5THR3 1501 aa34.6■■■■□ 3.13
SENP6-211ENST00000493959 STAG3Q9UJ98 1225 aa34.6■■■■□ 3.13
SENP6-211ENST00000493959 NOS1P29475 1434 aa34.59■■■■□ 3.13
SENP6-211ENST00000493959 PIK3C2BO00750 1634 aa34.59■■■■□ 3.13
SENP6-211ENST00000493959 SYNMO15061 1565 aa34.57■■■■□ 3.13
SENP6-211ENST00000493959 IQSEC2Q5JU85 1478 aa34.57■■■■□ 3.12
SENP6-211ENST00000493959 ARHGAP23Q9P227 1491 aa34.54■■■■□ 3.12
SENP6-211ENST00000493959 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP34.54■■■■□ 3.12
SENP6-211ENST00000493959 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP34.52■■■■□ 3.12
SENP6-211ENST00000493959 IQGAP1P46940 1657 aa34.52■■■■□ 3.12
SENP6-211ENST00000493959 UBAP1LF5GYI3 381 aa34.52■■■■□ 3.12
SENP6-211ENST00000493959 UNC13BO14795 1591 aa34.52■■■■□ 3.12
SENP6-211ENST00000493959 SLIT1O75093 1534 aa34.51■■■■□ 3.12
SENP6-211ENST00000493959 TMEM2Q9UHN6 1383 aa34.5■■■■□ 3.11
SENP6-211ENST00000493959 SLC52A1Q9NWF4 448 aa34.5■■■■□ 3.11
SENP6-211ENST00000493959 EID1Q9Y6B2 187 aa34.5■■■■□ 3.11
SENP6-211ENST00000493959 NUP155O75694 1391 aa34.49■■■■□ 3.11
SENP6-211ENST00000493959 TET3O43151 1660 aa34.49■■■■□ 3.11
SENP6-211ENST00000493959 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP34.46■■■■□ 3.11
SENP6-211ENST00000493959 CPS1P31327 1500 aa34.42■■■■□ 3.1
SENP6-211ENST00000493959 STRCP1A6NGW2 1772 aa34.41■■■■□ 3.1
SENP6-211ENST00000493959 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.41■■■■□ 3.1
SENP6-211ENST00000493959 E9PCH4 1651 aa34.39■■■■□ 3.1
SENP6-211ENST00000493959 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP34.39■■■■□ 3.1
SENP6-211ENST00000493959 IQGAP3Q86VI3 1631 aa34.39■■■■□ 3.1
SENP6-211ENST00000493959 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
SENP6-211ENST00000493959 ADGRB3O60242 1522 aa34.36■■■■□ 3.09
SENP6-211ENST00000493959 CHGAP10645 457 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
SENP6-211ENST00000493959 SLC26A8Q96RN1 970 aa34.34■■■■□ 3.09
SENP6-211ENST00000493959 NAIPQ13075 1403 aa34.33■■■■□ 3.09
SENP6-211ENST00000493959 MYO5BQ9ULV0 1848 aa34.32■■■■□ 3.09
SENP6-211ENST00000493959 PIP4K2BP78356 416 aa34.31■■■■□ 3.08
SENP6-211ENST00000493959 LRRC7Q96NW7 1537 aa34.3■■■■□ 3.08
SENP6-211ENST00000493959 TOM1O60784 492 aa34.28■■■■□ 3.08
SENP6-211ENST00000493959 BCANQ96GW7 911 aa34.28■■■■□ 3.08
SENP6-211ENST00000493959 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
SENP6-211ENST00000493959 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa34.27■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms