RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492979.2

SSC4D-202, Transcript of scavenger receptor cysteine rich family member with 4 domains, humanhuman

TSL 5

Gene SSC4D, Length 1,224 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4D-202ENST00000492979 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.33■■■□□ 2.29
SSC4D-202ENST00000492979 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.33■■■□□ 2.29
SSC4D-202ENST00000492979 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
SSC4D-202ENST00000492979 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
SSC4D-202ENST00000492979 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.29■■■□□ 2.28
SSC4D-202ENST00000492979 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.29■■■□□ 2.28
SSC4D-202ENST00000492979 PZPP20742 1482 aa29.28■■■□□ 2.28
SSC4D-202ENST00000492979 ERBINQ96RT1 1412 aa29.27■■■□□ 2.28
SSC4D-202ENST00000492979 KIF15Q9NS87 1388 aa29.26■■■□□ 2.28
SSC4D-202ENST00000492979 STRCQ7RTU9 1775 aa29.26■■■□□ 2.27
SSC4D-202ENST00000492979 PTPRTO14522 1441 aa29.24■■■□□ 2.27
SSC4D-202ENST00000492979 NCOA1Q15788 1441 aa29.23■■■□□ 2.27
SSC4D-202ENST00000492979 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
SSC4D-202ENST00000492979 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.22■■■□□ 2.27
SSC4D-202ENST00000492979 ADGRL2O95490 1459 aa29.22■■■□□ 2.27
SSC4D-202ENST00000492979 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
SSC4D-202ENST00000492979 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.2■■■□□ 2.26
SSC4D-202ENST00000492979 PLA2R1Q13018 1463 aa29.19■■■□□ 2.26
SSC4D-202ENST00000492979 ABCC3O15438 1527 aa29.19■■■□□ 2.26
SSC4D-202ENST00000492979 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.18■■■□□ 2.26
SSC4D-202ENST00000492979 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.17■■■□□ 2.26
SSC4D-202ENST00000492979 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.17■■■□□ 2.26
SSC4D-202ENST00000492979 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.17■■■□□ 2.26
SSC4D-202ENST00000492979 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
SSC4D-202ENST00000492979 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
SSC4D-202ENST00000492979 TNRQ92752 1358 aa29.15■■■□□ 2.26
SSC4D-202ENST00000492979 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
SSC4D-202ENST00000492979 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.14■■■□□ 2.26
SSC4D-202ENST00000492979 PKD2Q13563 968 aa29.14■■■□□ 2.26
SSC4D-202ENST00000492979 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
SSC4D-202ENST00000492979 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.12■■■□□ 2.25
SSC4D-202ENST00000492979 NLRP1Q9C000 1473 aa29.12■■■□□ 2.25
SSC4D-202ENST00000492979 DEPDC5O75140 1603 aa29.12■■■□□ 2.25
SSC4D-202ENST00000492979 FBXO41Q8TF61 875 aa29.1■■■□□ 2.25
SSC4D-202ENST00000492979 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
SSC4D-202ENST00000492979 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.09■■■□□ 2.25
SSC4D-202ENST00000492979 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.07■■■□□ 2.24
SSC4D-202ENST00000492979 ROCK1Q13464 1354 aa29.06■■■□□ 2.24
SSC4D-202ENST00000492979 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.05■■■□□ 2.24
SSC4D-202ENST00000492979 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.05■■■□□ 2.24
SSC4D-202ENST00000492979 KANK1Q14678 1352 aa29.03■■■□□ 2.24
SSC4D-202ENST00000492979 CERKQ8TCT0 537 aa29.03■■■□□ 2.24
SSC4D-202ENST00000492979 ERVK-7P63135 1459 aa29.03■■■□□ 2.24
SSC4D-202ENST00000492979 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
SSC4D-202ENST00000492979 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.01■■■□□ 2.23
SSC4D-202ENST00000492979 CEP152O94986 1710 aa28.97■■■□□ 2.23
SSC4D-202ENST00000492979 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.97■■■□□ 2.23
SSC4D-202ENST00000492979 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.95■■■□□ 2.22
SSC4D-202ENST00000492979 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
SSC4D-202ENST00000492979 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.92■■■□□ 2.22
SSC4D-202ENST00000492979 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.91■■■□□ 2.22
SSC4D-202ENST00000492979 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.91■■■□□ 2.22
SSC4D-202ENST00000492979 MED14O60244 1454 aa28.91■■■□□ 2.22
SSC4D-202ENST00000492979 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.9■■■□□ 2.22
SSC4D-202ENST00000492979 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
SSC4D-202ENST00000492979 NOS1P29475 1434 aa28.86■■■□□ 2.21
SSC4D-202ENST00000492979 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.85■■■□□ 2.21
SSC4D-202ENST00000492979 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.84■■■□□ 2.21
SSC4D-202ENST00000492979 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
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SSC4D-202ENST00000492979 UNC13BO14795 1591 aa28.82■■■□□ 2.2
SSC4D-202ENST00000492979 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
SSC4D-202ENST00000492979 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
SSC4D-202ENST00000492979 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.81■■■□□ 2.2
SSC4D-202ENST00000492979 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.81■■■□□ 2.2
SSC4D-202ENST00000492979 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.8■■■□□ 2.2
SSC4D-202ENST00000492979 SLIT1O75093 1534 aa28.79■■■□□ 2.2
SSC4D-202ENST00000492979 TET3O43151 1660 aa28.77■■■□□ 2.2
SSC4D-202ENST00000492979 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
SSC4D-202ENST00000492979 IDI1Q13907 227 aa28.76■■■□□ 2.19
SSC4D-202ENST00000492979 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
SSC4D-202ENST00000492979 SYNMO15061 1565 aa28.73■■■□□ 2.19
SSC4D-202ENST00000492979 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.71■■■□□ 2.19
SSC4D-202ENST00000492979 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.71■■■□□ 2.19
SSC4D-202ENST00000492979 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.7■■■□□ 2.19
SSC4D-202ENST00000492979 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
SSC4D-202ENST00000492979 PIK3C2BO00750 1634 aa28.69■■■□□ 2.18
SSC4D-202ENST00000492979 LTKP29376 864 aa28.68■■■□□ 2.18
SSC4D-202ENST00000492979 ITGAEP38570 1179 aa28.68■■■□□ 2.18
SSC4D-202ENST00000492979 CPS1P31327 1500 aa28.68■■■□□ 2.18
SSC4D-202ENST00000492979 IQGAP1P46940 1657 aa28.67■■■□□ 2.18
SSC4D-202ENST00000492979 NUP155O75694 1391 aa28.66■■■□□ 2.18
SSC4D-202ENST00000492979 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.66■■■□□ 2.18
SSC4D-202ENST00000492979 EID1Q9Y6B2 187 aa28.66■■■□□ 2.18
SSC4D-202ENST00000492979 NAIPQ13075 1403 aa28.64■■■□□ 2.18
SSC4D-202ENST00000492979 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.62■■■□□ 2.17
SSC4D-202ENST00000492979 ADGRB3O60242 1522 aa28.61■■■□□ 2.17
SSC4D-202ENST00000492979 HFM1A2PYH4 1435 aa28.6■■■□□ 2.17
SSC4D-202ENST00000492979 E9PCH4 1651 aa28.6■■■□□ 2.17
SSC4D-202ENST00000492979 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
SSC4D-202ENST00000492979 ZFYVE9O95405 1425 aa28.52■■■□□ 2.16
SSC4D-202ENST00000492979 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.52■■■□□ 2.16
SSC4D-202ENST00000492979 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.47■■■□□ 2.15
SSC4D-202ENST00000492979 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.15
SSC4D-202ENST00000492979 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.45■■■□□ 2.15
SSC4D-202ENST00000492979 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.45■■■□□ 2.14
SSC4D-202ENST00000492979 UBAP1LF5GYI3 381 aa28.44■■■□□ 2.14
SSC4D-202ENST00000492979 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.44■■■□□ 2.14
SSC4D-202ENST00000492979 TOM1O60784 492 aa28.43■■■□□ 2.14
SSC4D-202ENST00000492979 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.43■■■□□ 2.14
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