RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492897.3

HOXB-AS3-214, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXB-AS3, Length 309 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-214ENST00000492897 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-214ENST00000492897 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PZPP20742 1482 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-214ENST00000492897 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-214ENST00000492897 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-214ENST00000492897 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PKD2Q13563 968 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ABCC5O15440 1437 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TNRQ92752 1358 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-214ENST00000492897 APLP2Q06481 763 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-214ENST00000492897 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.43■■□□□ 1.34
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HOXB-AS3-214ENST00000492897 ABCC3O15438 1527 aa23.43■■□□□ 1.34
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HOXB-AS3-214ENST00000492897 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-214ENST00000492897 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-214ENST00000492897 KIF15Q9NS87 1388 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NLRP1Q9C000 1473 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-214ENST00000492897 DAPK1P53355 1430 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ERBINQ96RT1 1412 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-214ENST00000492897 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ERVK-7P63135 1459 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-214ENST00000492897 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.3■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-214ENST00000492897 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MED14O60244 1454 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-214ENST00000492897 DEPDC5O75140 1603 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ADGRL2O95490 1459 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-214ENST00000492897 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-214ENST00000492897 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CEP152O94986 1710 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-214ENST00000492897 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
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HOXB-AS3-214ENST00000492897 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SLIT1O75093 1534 aa23.13■■□□□ 1.29
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HOXB-AS3-214ENST00000492897 LTKP29376 864 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NOS1P29475 1434 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-214ENST00000492897 IDI1Q13907 227 aa23.09■■□□□ 1.29
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HOXB-AS3-214ENST00000492897 IQGAP1P46940 1657 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-214ENST00000492897 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.08■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ROCK1Q13464 1354 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SYNMO15061 1565 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PIK3C2BO00750 1634 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-214ENST00000492897 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-214ENST00000492897 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.01■■□□□ 1.27
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HOXB-AS3-214ENST00000492897 TOM1O60784 492 aa23■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-214ENST00000492897 EID1Q9Y6B2 187 aa23■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-214ENST00000492897 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-214ENST00000492897 UNC13BO14795 1591 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-214ENST00000492897 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TET3O43151 1660 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-214ENST00000492897 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ADGRB3O60242 1522 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-214ENST00000492897 HSPA1LP34931 641 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PIP4K2BP78356 416 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ILDR2Q71H61 639 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ZFYVE9O95405 1425 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-214ENST00000492897 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-214ENST00000492897 KCNA6P17658 529 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-214ENST00000492897 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NUP155O75694 1391 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ITGAEP38570 1179 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-214ENST00000492897 E9PCH4 1651 aa22.84■■□□□ 1.25
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