RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492536.5

RUSC1-215, Transcript of RUN and SH3 domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene RUSC1, Length 1,069 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1-215ENST00000492536 KDM5DQ9BY66 1539 aa37.08■■■■□ 3.53
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RUSC1-215ENST00000492536 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa37.06■■■■□ 3.52
RUSC1-215ENST00000492536 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP37.04■■■■□ 3.52
RUSC1-215ENST00000492536 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa37.01■■■■□ 3.52
RUSC1-215ENST00000492536 PZPP20742 1482 aa36.99■■■■□ 3.51
RUSC1-215ENST00000492536 PLA2R1Q13018 1463 aa36.99■■■■□ 3.51
RUSC1-215ENST00000492536 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP36.95■■■■□ 3.51
RUSC1-215ENST00000492536 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP36.95■■■■□ 3.51
RUSC1-215ENST00000492536 A2ML1A8K2U0 1454 aa36.94■■■■□ 3.5
RUSC1-215ENST00000492536 PKD2Q13563 968 aa36.92■■■■□ 3.5
RUSC1-215ENST00000492536 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.92■■■■□ 3.5
RUSC1-215ENST00000492536 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.92■■■■□ 3.5
RUSC1-215ENST00000492536 TNRQ92752 1358 aa36.91■■■■□ 3.5
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RUSC1-215ENST00000492536 DUOX2Q9NRD8 1548 aa36.89■■■■□ 3.5
RUSC1-215ENST00000492536 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.88■■■■□ 3.49
RUSC1-215ENST00000492536 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa36.87■■■■□ 3.49
RUSC1-215ENST00000492536 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.87■■■■□ 3.49
RUSC1-215ENST00000492536 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36.86■■■■□ 3.49
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RUSC1-215ENST00000492536 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.85■■■■□ 3.49
RUSC1-215ENST00000492536 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.85■■■■□ 3.49
RUSC1-215ENST00000492536 ABCC3O15438 1527 aa36.83■■■■□ 3.49
RUSC1-215ENST00000492536 LTBP4Q8N2S1 1624 aa36.82■■■■□ 3.49
RUSC1-215ENST00000492536 KIF15Q9NS87 1388 aa36.81■■■■□ 3.48
RUSC1-215ENST00000492536 DAPK1P53355 1430 aa36.81■■■■□ 3.48
RUSC1-215ENST00000492536 NLRP1Q9C000 1473 aa36.8■■■■□ 3.48
RUSC1-215ENST00000492536 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.78■■■■□ 3.48
RUSC1-215ENST00000492536 ERBINQ96RT1 1412 aa36.78■■■■□ 3.48
RUSC1-215ENST00000492536 IQSEC2Q5JU85 1478 aa36.76■■■■□ 3.48
RUSC1-215ENST00000492536 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.72■■■■□ 3.47
RUSC1-215ENST00000492536 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.71■■■■□ 3.47
RUSC1-215ENST00000492536 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.47
RUSC1-215ENST00000492536 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP36.69■■■■□ 3.46
RUSC1-215ENST00000492536 UGGT1Q9NYU2 1555 aa36.69■■■■□ 3.46
RUSC1-215ENST00000492536 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.68■■■■□ 3.46
RUSC1-215ENST00000492536 ERVK-7P63135 1459 aa36.68■■■■□ 3.46
RUSC1-215ENST00000492536 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP36.67■■■■□ 3.46
RUSC1-215ENST00000492536 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP36.66■■■■□ 3.46
RUSC1-215ENST00000492536 CEP152O94986 1710 aa36.65■■■■□ 3.46
RUSC1-215ENST00000492536 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.63■■■■□ 3.455e-6■■■■■ 46.2
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RUSC1-215ENST00000492536 DEPDC5O75140 1603 aa36.62■■■■□ 3.45
RUSC1-215ENST00000492536 NEURL4Q96JN8 1562 aa36.61■■■■□ 3.45
RUSC1-215ENST00000492536 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.61■■■■□ 3.45
RUSC1-215ENST00000492536 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.59■■■■□ 3.45
RUSC1-215ENST00000492536 KANK1Q14678 1352 aa36.58■■■■□ 3.45
RUSC1-215ENST00000492536 ADGRL2O95490 1459 aa36.57■■■■□ 3.45
RUSC1-215ENST00000492536 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
RUSC1-215ENST00000492536 MED14O60244 1454 aa36.54■■■■□ 3.44
RUSC1-215ENST00000492536 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP36.53■■■■□ 3.44
RUSC1-215ENST00000492536 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP36.49■■■■□ 3.43
RUSC1-215ENST00000492536 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.49■■■■□ 3.43
RUSC1-215ENST00000492536 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.47■■■■□ 3.43
RUSC1-215ENST00000492536 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP36.46■■■■□ 3.43
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RUSC1-215ENST00000492536 IQGAP1P46940 1657 aa36.41■■■■□ 3.42
RUSC1-215ENST00000492536 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.41■■■■□ 3.42
RUSC1-215ENST00000492536 UBAP1LF5GYI3 381 aa36.38■■■■□ 3.41
RUSC1-215ENST00000492536 SLIT1O75093 1534 aa36.36■■■■□ 3.41
RUSC1-215ENST00000492536 EFCAB6Q5THR3 1501 aa36.35■■■■□ 3.41
RUSC1-215ENST00000492536 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
RUSC1-215ENST00000492536 ARHGAP23Q9P227 1491 aa36.35■■■■□ 3.41
RUSC1-215ENST00000492536 PIK3C2BO00750 1634 aa36.3■■■■□ 3.4
RUSC1-215ENST00000492536 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
RUSC1-215ENST00000492536 ROCK1Q13464 1354 aa36.29■■■■□ 3.4
RUSC1-215ENST00000492536 NOS1P29475 1434 aa36.28■■■■□ 3.4
RUSC1-215ENST00000492536 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
RUSC1-215ENST00000492536 TXNDC2Q86VQ3 553 aa36.27■■■■□ 3.4
RUSC1-215ENST00000492536 STAG3Q9UJ98 1225 aa36.27■■■■□ 3.4
RUSC1-215ENST00000492536 EID1Q9Y6B2 187 aa36.27■■■■□ 3.4
RUSC1-215ENST00000492536 SYNMO15061 1565 aa36.25■■■■□ 3.39
RUSC1-215ENST00000492536 TMEM2Q9UHN6 1383 aa36.25■■■■□ 3.39
RUSC1-215ENST00000492536 LTKP29376 864 aa36.24■■■■□ 3.39
RUSC1-215ENST00000492536 IDI1Q13907 227 aa36.24■■■■□ 3.39
RUSC1-215ENST00000492536 TOM1O60784 492 aa36.21■■■■□ 3.39
RUSC1-215ENST00000492536 SLC52A1Q9NWF4 448 aa36.21■■■■□ 3.39
RUSC1-215ENST00000492536 UNC13BO14795 1591 aa36.19■■■■□ 3.38
RUSC1-215ENST00000492536 TET3O43151 1660 aa36.19■■■■□ 3.38
RUSC1-215ENST00000492536 ADGRB3O60242 1522 aa36.16■■■■□ 3.38
RUSC1-215ENST00000492536 STRCP1A6NGW2 1772 aa36.13■■■■□ 3.37
RUSC1-215ENST00000492536 GCC2Q8IWJ2 1684 aa36.12■■■■□ 3.37
RUSC1-215ENST00000492536 LRRC7Q96NW7 1537 aa36.12■■■■□ 3.37
RUSC1-215ENST00000492536 DISP3Q9P2K9 1392 aa36.12■■■■□ 3.37
RUSC1-215ENST00000492536 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
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RUSC1-215ENST00000492536 PIP4K2BP78356 416 aa36.06■■■■□ 3.36
RUSC1-215ENST00000492536 IQGAP3Q86VI3 1631 aa36.05■■■■□ 3.36
RUSC1-215ENST00000492536 NUP155O75694 1391 aa36■■■■□ 3.35
RUSC1-215ENST00000492536 ALKQ9UM73 1620 aa35.99■■■■□ 3.35
RUSC1-215ENST00000492536 E9PCH4 1651 aa35.99■■■■□ 3.35
RUSC1-215ENST00000492536 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
RUSC1-215ENST00000492536 HSPA1LP34931 641 aa35.96■■■■□ 3.35
RUSC1-215ENST00000492536 HDGFP51858 240 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
RUSC1-215ENST00000492536 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa35.95■■■■□ 3.35
RUSC1-215ENST00000492536 ZFYVE9O95405 1425 aa35.95■■■■□ 3.35
RUSC1-215ENST00000492536 KCNA6P17658 529 aa35.92■■■■□ 3.34
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