RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491917.1

PIEZO1-210, Transcript of piezo type mechanosensitive ion channel component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PIEZO1, Length 406 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIEZO1-210ENST00000491917 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.67■■■■□ 3.3
PIEZO1-210ENST00000491917 MIA2Q96PC5 1412 aa35.66■■■■□ 3.3
PIEZO1-210ENST00000491917 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.64■■■■□ 3.3
PIEZO1-210ENST00000491917 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.6■■■■□ 3.29
PIEZO1-210ENST00000491917 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.59■■■■□ 3.29
PIEZO1-210ENST00000491917 PZPP20742 1482 aa35.59■■■■□ 3.29
PIEZO1-210ENST00000491917 PLA2R1Q13018 1463 aa35.59■■■■□ 3.29
PIEZO1-210ENST00000491917 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
PIEZO1-210ENST00000491917 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.57■■■■□ 3.28
PIEZO1-210ENST00000491917 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.28
PIEZO1-210ENST00000491917 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.57■■■■□ 3.28
PIEZO1-210ENST00000491917 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.55■■■■□ 3.28
PIEZO1-210ENST00000491917 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.55■■■■□ 3.28
PIEZO1-210ENST00000491917 TNRQ92752 1358 aa35.54■■■■□ 3.28
PIEZO1-210ENST00000491917 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
PIEZO1-210ENST00000491917 APLP2Q06481 763 aa35.52■■■■□ 3.28
PIEZO1-210ENST00000491917 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.51■■■■□ 3.28
PIEZO1-210ENST00000491917 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.5■■■■□ 3.27
PIEZO1-210ENST00000491917 ABCC3O15438 1527 aa35.48■■■■□ 3.27
PIEZO1-210ENST00000491917 MROH1Q8NDA8 1641 aa35.48■■■■□ 3.27
PIEZO1-210ENST00000491917 PKD2Q13563 968 aa35.48■■■■□ 3.27
PIEZO1-210ENST00000491917 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
PIEZO1-210ENST00000491917 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.44■■■■□ 3.26
PIEZO1-210ENST00000491917 ABCC5O15440 1437 aa35.44■■■■□ 3.26
PIEZO1-210ENST00000491917 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.43■■■■□ 3.26
PIEZO1-210ENST00000491917 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.42■■■■□ 3.26
PIEZO1-210ENST00000491917 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.41■■■■□ 3.26
PIEZO1-210ENST00000491917 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
PIEZO1-210ENST00000491917 CEP152O94986 1710 aa35.4■■■■□ 3.26
PIEZO1-210ENST00000491917 KIF15Q9NS87 1388 aa35.38■■■■□ 3.26
PIEZO1-210ENST00000491917 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.38■■■■□ 3.25
PIEZO1-210ENST00000491917 IQSEC2Q5JU85 1478 aa35.37■■■■□ 3.25
PIEZO1-210ENST00000491917 NLRP1Q9C000 1473 aa35.37■■■■□ 3.25
PIEZO1-210ENST00000491917 DAPK1P53355 1430 aa35.37■■■■□ 3.25
PIEZO1-210ENST00000491917 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa35.34■■■■□ 3.25
PIEZO1-210ENST00000491917 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.33■■■■□ 3.25
PIEZO1-210ENST00000491917 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.32■■■■□ 3.24
PIEZO1-210ENST00000491917 ERVK-7P63135 1459 aa35.32■■■■□ 3.24
PIEZO1-210ENST00000491917 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
PIEZO1-210ENST00000491917 ERBINQ96RT1 1412 aa35.31■■■■□ 3.24
PIEZO1-210ENST00000491917 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.3■■■■□ 3.24
PIEZO1-210ENST00000491917 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
PIEZO1-210ENST00000491917 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
PIEZO1-210ENST00000491917 DEPDC5O75140 1603 aa35.24■■■■□ 3.23
PIEZO1-210ENST00000491917 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.22■■■■□ 3.23
PIEZO1-210ENST00000491917 ANKLE2Q86XL3 938 aa35.21■■■■□ 3.23
PIEZO1-210ENST00000491917 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.18■■■■□ 3.22
PIEZO1-210ENST00000491917 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.17■■■■□ 3.22
PIEZO1-210ENST00000491917 UBR1Q8IWV7 1749 aa35.16■■■■□ 3.22
PIEZO1-210ENST00000491917 MED14O60244 1454 aa35.16■■■■□ 3.22
PIEZO1-210ENST00000491917 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa35.15■■■■□ 3.22
PIEZO1-210ENST00000491917 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP35.15■■■■□ 3.22
PIEZO1-210ENST00000491917 IQGAP1P46940 1657 aa35.14■■■■□ 3.22
PIEZO1-210ENST00000491917 VWDEQ8N2E2 1590 aa35.13■■■■□ 3.21
PIEZO1-210ENST00000491917 ADGRL2O95490 1459 aa35.11■■■■□ 3.21
PIEZO1-210ENST00000491917 UBAP1LF5GYI3 381 aa35.11■■■■□ 3.21
PIEZO1-210ENST00000491917 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.11■■■■□ 3.21
PIEZO1-210ENST00000491917 CPS1P31327 1500 aa35.09■■■■□ 3.21
PIEZO1-210ENST00000491917 KANK1Q14678 1352 aa35.09■■■■□ 3.21
PIEZO1-210ENST00000491917 LMTK2Q8IWU2 1503 aa35.06■■■■□ 3.2
PIEZO1-210ENST00000491917 PIK3C2BO00750 1634 aa35.03■■■■□ 3.2
PIEZO1-210ENST00000491917 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP34.99■■■■□ 3.19
PIEZO1-210ENST00000491917 ARHGAP23Q9P227 1491 aa34.99■■■■□ 3.19
PIEZO1-210ENST00000491917 EFCAB6Q5THR3 1501 aa34.99■■■■□ 3.19
PIEZO1-210ENST00000491917 STRCP1A6NGW2 1772 aa34.99■■■■□ 3.19
PIEZO1-210ENST00000491917 SLIT1O75093 1534 aa34.98■■■■□ 3.19
PIEZO1-210ENST00000491917 SYNMO15061 1565 aa34.96■■■■□ 3.19
PIEZO1-210ENST00000491917 DISP3Q9P2K9 1392 aa34.96■■■■□ 3.19
PIEZO1-210ENST00000491917 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa34.95■■■■□ 3.19
PIEZO1-210ENST00000491917 LTKP29376 864 aa34.93■■■■□ 3.18
PIEZO1-210ENST00000491917 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP34.89■■■■□ 3.18
PIEZO1-210ENST00000491917 TXNDC2Q86VQ3 553 aa34.89■■■■□ 3.18
PIEZO1-210ENST00000491917 NOS1P29475 1434 aa34.89■■■■□ 3.18
PIEZO1-210ENST00000491917 TMEM2Q9UHN6 1383 aa34.87■■■■□ 3.17
PIEZO1-210ENST00000491917 IDI1Q13907 227 aa34.86■■■■□ 3.17
PIEZO1-210ENST00000491917 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP34.85■■■■□ 3.17
PIEZO1-210ENST00000491917 PIP4K2BP78356 416 aa34.85■■■■□ 3.17
PIEZO1-210ENST00000491917 LRRC7Q96NW7 1537 aa34.85■■■■□ 3.17
PIEZO1-210ENST00000491917 ALKQ9UM73 1620 aa34.84■■■■□ 3.17
PIEZO1-210ENST00000491917 STAG3Q9UJ98 1225 aa34.84■■■■□ 3.17
PIEZO1-210ENST00000491917 TET3O43151 1660 aa34.83■■■■□ 3.17
PIEZO1-210ENST00000491917 TOM1O60784 492 aa34.83■■■■□ 3.17
PIEZO1-210ENST00000491917 UNC13BO14795 1591 aa34.83■■■■□ 3.17
PIEZO1-210ENST00000491917 ADGRB3O60242 1522 aa34.82■■■■□ 3.16
PIEZO1-210ENST00000491917 EID1Q9Y6B2 187 aa34.82■■■■□ 3.16
PIEZO1-210ENST00000491917 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.81■■■■□ 3.16
PIEZO1-210ENST00000491917 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
PIEZO1-210ENST00000491917 ROCK1Q13464 1354 aa34.77■■■■□ 3.16
PIEZO1-210ENST00000491917 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.77■■■■□ 3.16
PIEZO1-210ENST00000491917 ILDR2Q71H61 639 aa34.77■■■■□ 3.16
PIEZO1-210ENST00000491917 HSPA1LP34931 641 aa34.75■■■■□ 3.15
PIEZO1-210ENST00000491917 MYO5BQ9ULV0 1848 aa34.71■■■■□ 3.15
PIEZO1-210ENST00000491917 ITGAEP38570 1179 aa34.71■■■■□ 3.15
PIEZO1-210ENST00000491917 SLC52A1Q9NWF4 448 aa34.71■■■■□ 3.15
PIEZO1-210ENST00000491917 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP34.7■■■■□ 3.15
PIEZO1-210ENST00000491917 E9PCH4 1651 aa34.69■■■■□ 3.14
PIEZO1-210ENST00000491917 IQGAP3Q86VI3 1631 aa34.68■■■■□ 3.14
PIEZO1-210ENST00000491917 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa34.63■■■■□ 3.13
PIEZO1-210ENST00000491917 SLC26A8Q96RN1 970 aa34.62■■■■□ 3.13
PIEZO1-210ENST00000491917 ZFYVE9O95405 1425 aa34.61■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms