RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 CDHR5Q9HBB8 845 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRC-212ENST00000491302 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRC-212ENST00000491302 DOK7Q18PE1 504 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRC-212ENST00000491302 CERKQ8TCT0 537 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRC-212ENST00000491302 RIMBP2O15034 1052 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRC-212ENST00000491302 FOSBP53539 338 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRC-212ENST00000491302 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
PTPRC-212ENST00000491302 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRC-212ENST00000491302 ZDHHC16Q969W1 377 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRC-212ENST00000491302 PLEKHG3A1L390 1219 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRC-212ENST00000491302 CLCN1P35523 988 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRC-212ENST00000491302 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRC-212ENST00000491302 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF454Q8N9F8 522 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRC-212ENST00000491302 MAMSTRQ6ZN01 415 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRC-212ENST00000491302 OATP04181 439 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRC-212ENST00000491302 SCUBE2Q9NQ36 999 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRC-212ENST00000491302 NUDT7P0C024 238 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRC-212ENST00000491302 OTUD5Q96G74 571 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRC-212ENST00000491302 GOPCQ9HD26 462 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRC-212ENST00000491302 ARSIQ5FYB1 569 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRC-212ENST00000491302 LHX8Q68G74 356 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRC-212ENST00000491302 GPCPD1Q9NPB8 672 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRC-212ENST00000491302 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
PTPRC-212ENST00000491302 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF710Q8N1W2 664 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRC-212ENST00000491302 MS4A1P11836 297 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRC-212ENST00000491302 GPR153Q6NV75 609 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRC-212ENST00000491302 TMUB1Q9BVT8 246 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRC-212ENST00000491302 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
PTPRC-212ENST00000491302 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
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PTPRC-212ENST00000491302 PADI6Q6TGC4 694 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRC-212ENST00000491302 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
PTPRC-212ENST00000491302 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP15.12■□□□□ 0.01
PTPRC-212ENST00000491302 ADAM33Q9BZ11 813 aa15.12■□□□□ 0.01
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PTPRC-212ENST00000491302 PHOX2BQ99453 314 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRC-212ENST00000491302 ADGRG1Q9Y653 693 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRC-212ENST00000491302 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
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PTPRC-212ENST00000491302 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa15.09■□□□□ 0.01
PTPRC-212ENST00000491302 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
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PTPRC-212ENST00000491302 LHX6Q9UPM6 363 aa15.06■□□□□ 0
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PTPRC-212ENST00000491302 ZMYND15Q9H091 742 aa15.04■□□□□ -0
PTPRC-212ENST00000491302 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
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PTPRC-212ENST00000491302 ARXQ96QS3 562 aa15.03■□□□□ -0
PTPRC-212ENST00000491302 BCL2L12Q9HB09 334 aa15.03■□□□□ -0
PTPRC-212ENST00000491302 BEGAINQ9BUH8 593 aa15.02■□□□□ -0
PTPRC-212ENST00000491302 PTPREP23469 700 aa15□□□□□ -0.01
PTPRC-212ENST00000491302 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PTPRC-212ENST00000491302 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PTPRC-212ENST00000491302 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRC-212ENST00000491302 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRC-212ENST00000491302 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRC-212ENST00000491302 DIXDC1Q155Q3 683 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRC-212ENST00000491302 NLRP7Q8WX94 980 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRC-212ENST00000491302 COL9A1P20849 921 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRC-212ENST00000491302 KCNH8Q96L42 1107 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRC-212ENST00000491302 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PTPRC-212ENST00000491302 RCCD1A6NED2 376 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRC-212ENST00000491302 NBPF26B4DH59 902 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRC-212ENST00000491302 PACS2Q86VP3 889 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRC-212ENST00000491302 EYA1Q99502 592 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRC-212ENST00000491302 FAM198AQ9UFP1 575 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRC-212ENST00000491302 SULF1Q8IWU6 871 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRC-212ENST00000491302 TSKSQ9UJT2 592 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRC-212ENST00000491302 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRC-212ENST00000491302 DNAJB2P25686 324 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRC-212ENST00000491302 NUDT18Q6ZVK8 323 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRC-212ENST00000491302 MYSM1Q5VVJ2 828 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRC-212ENST00000491302 TATDN2Q93075 761 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRC-212ENST00000491302 POLR3EQ9NVU0 708 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRC-212ENST00000491302 PNMA3Q9UL41 463 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRC-212ENST00000491302 TBC1D2Q9BYX2 928 aa14.84□□□□□ -0.03
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PTPRC-212ENST00000491302 HOMEZQ8IX15 550 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRC-212ENST00000491302 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
PTPRC-212ENST00000491302 CD46P15529 392 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRC-212ENST00000491302 KCNK17Q96T54 332 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRC-212ENST00000491302 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM134Q9H6X4 195 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRC-212ENST00000491302 DDX11L8A8MPP1 907 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRC-212ENST00000491302 NUTM1Q86Y26 1132 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRC-212ENST00000491302 UBTFP17480 764 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRC-212ENST00000491302 SPIRE2Q8WWL2 714 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRC-212ENST00000491302 MCM6Q14566 821 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRC-212ENST00000491302 A6NJR5 290 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRC-212ENST00000491302 PROX2Q3B8N5 592 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRC-212ENST00000491302 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRC-212ENST00000491302 RSPH4AQ5TD94 716 aa14.74□□□□□ -0.05
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