RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491075.1

CLIP2-208, Transcript of CAP-Gly domain containing linker protein 2, human

TSL 1 (best)

Gene CLIP2, Length 551 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLIP2-208	ENST00000491075	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		33.25	■■■□□ 2.91
CLIP2-208	ENST00000491075	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		33.24	■■■□□ 2.91
CLIP2-208	ENST00000491075	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		33.24	■■■□□ 2.91
CLIP2-208	ENST00000491075	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		33.21	■■■□□ 2.91
CLIP2-208	ENST00000491075	PZP	P20742	1482 aa		33.2	■■■□□ 2.91
CLIP2-208	ENST00000491075	NCOA2	Q15596	1464 aa		33.18	■■■□□ 2.9
CLIP2-208	ENST00000491075	TNR	Q92752	1358 aa		33.18	■■■□□ 2.9
CLIP2-208	ENST00000491075	KIF3B	O15066	747 aa		33.17	■■■□□ 2.9
CLIP2-208	ENST00000491075	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		33.17	■■■□□ 2.9
CLIP2-208	ENST00000491075	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		33.15	■■■□□ 2.9
CLIP2-208	ENST00000491075	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		33.13	■■■□□ 2.89
CLIP2-208	ENST00000491075	CPS1	P31327	1500 aa		33.12	■■■□□ 2.89
CLIP2-208	ENST00000491075	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
CLIP2-208	ENST00000491075	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		33.08	■■■□□ 2.89
CLIP2-208	ENST00000491075	NLRP1	Q9C000	1473 aa		33.08	■■■□□ 2.89
CLIP2-208	ENST00000491075	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		33.05	■■■□□ 2.88
CLIP2-208	ENST00000491075	MIA2	Q96PC5	1412 aa		33.03	■■■□□ 2.88
CLIP2-208	ENST00000491075	DEPDC5	O75140	1603 aa		33.03	■■■□□ 2.88
CLIP2-208	ENST00000491075	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
CLIP2-208	ENST00000491075	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		33.03	■■■□□ 2.88
CLIP2-208	ENST00000491075	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
CLIP2-208	ENST00000491075	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	33	■■■□□ 2.87
CLIP2-208	ENST00000491075	TSPY4	P0CV99	314 aa		33	■■■□□ 2.87
CLIP2-208	ENST00000491075	TSPY10	P0CW01	314 aa		33	■■■□□ 2.87
CLIP2-208	ENST00000491075	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		33	■■■□□ 2.87
CLIP2-208	ENST00000491075	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	33	■■■□□ 2.87
CLIP2-208	ENST00000491075	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		32.99	■■■□□ 2.87
CLIP2-208	ENST00000491075	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		32.99	■■■□□ 2.87
CLIP2-208	ENST00000491075	MED14	O60244	1454 aa		32.98	■■■□□ 2.87
CLIP2-208	ENST00000491075	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	32.97	■■■□□ 2.87
CLIP2-208	ENST00000491075	TOM1	O60784	492 aa		32.96	■■■□□ 2.87
CLIP2-208	ENST00000491075	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.86
CLIP2-208	ENST00000491075	IQGAP1	P46940	1657 aa		32.94	■■■□□ 2.86
CLIP2-208	ENST00000491075	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	32.94	■■■□□ 2.86
CLIP2-208	ENST00000491075	ABCC3	O15438	1527 aa		32.94	■■■□□ 2.86
CLIP2-208	ENST00000491075	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		32.93	■■■□□ 2.86
CLIP2-208	ENST00000491075	PIP4K2B	P78356	416 aa		32.91	■■■□□ 2.86
CLIP2-208	ENST00000491075	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	32.9	■■■□□ 2.86
CLIP2-208	ENST00000491075	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		32.89	■■■□□ 2.86
CLIP2-208	ENST00000491075	HSPA1L	P34931	641 aa		32.89	■■■□□ 2.86
CLIP2-208	ENST00000491075	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		32.87	■■■□□ 2.85
CLIP2-208	ENST00000491075	ERVK-7	P63135	1459 aa		32.86	■■■□□ 2.85
CLIP2-208	ENST00000491075	CEP152	O94986	1710 aa		32.85	■■■□□ 2.85
CLIP2-208	ENST00000491075	SYNM	O15061	1565 aa		32.83	■■■□□ 2.85
CLIP2-208	ENST00000491075	ALK	Q9UM73	1620 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CLIP2-208	ENST00000491075	MAP3K1	Q13233	1512 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CLIP2-208	ENST00000491075	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		32.81	■■■□□ 2.84
CLIP2-208	ENST00000491075	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		32.8	■■■□□ 2.84
CLIP2-208	ENST00000491075	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		32.78	■■■□□ 2.84
CLIP2-208	ENST00000491075	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		32.78	■■■□□ 2.84
CLIP2-208	ENST00000491075	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	32.77	■■■□□ 2.84
CLIP2-208	ENST00000491075	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		32.74	■■■□□ 2.83
CLIP2-208	ENST00000491075	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		32.72	■■■□□ 2.83
CLIP2-208	ENST00000491075	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	32.72	■■■□□ 2.83
CLIP2-208	ENST00000491075	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	32.71	■■■□□ 2.83
CLIP2-208	ENST00000491075	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
CLIP2-208	ENST00000491075	SLIT1	O75093	1534 aa		32.67	■■■□□ 2.82
CLIP2-208	ENST00000491075	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		32.67	■■■□□ 2.82
CLIP2-208	ENST00000491075	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		32.66	■■■□□ 2.82
CLIP2-208	ENST00000491075	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		32.66	■■■□□ 2.82
CLIP2-208	ENST00000491075	KIF15	Q9NS87	1388 aa		32.65	■■■□□ 2.82
CLIP2-208	ENST00000491075	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		32.6	■■■□□ 2.81
CLIP2-208	ENST00000491075	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	32.6	■■■□□ 2.81
CLIP2-208	ENST00000491075	PIK3C2B	O00750	1634 aa		32.59	■■■□□ 2.81
CLIP2-208	ENST00000491075	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	32.57	■■■□□ 2.8
CLIP2-208	ENST00000491075	ABCC5	O15440	1437 aa		32.57	■■■□□ 2.8
CLIP2-208	ENST00000491075	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
CLIP2-208	ENST00000491075	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		32.56	■■■□□ 2.8
CLIP2-208	ENST00000491075	LTK	P29376	864 aa		32.56	■■■□□ 2.8
CLIP2-208	ENST00000491075	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		32.56	■■■□□ 2.8
CLIP2-208	ENST00000491075	EID1	Q9Y6B2	187 aa		32.53	■■■□□ 2.8
CLIP2-208	ENST00000491075	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		32.52	■■■□□ 2.8
CLIP2-208	ENST00000491075	DAPK1	P53355	1430 aa		32.51	■■■□□ 2.8
CLIP2-208	ENST00000491075	KANK1	Q14678	1352 aa		32.51	■■■□□ 2.79
CLIP2-208	ENST00000491075	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
CLIP2-208	ENST00000491075	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		32.48	■■■□□ 2.79
CLIP2-208	ENST00000491075	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		32.48	■■■□□ 2.79
CLIP2-208	ENST00000491075	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		32.47	■■■□□ 2.79
CLIP2-208	ENST00000491075	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	32.47	■■■□□ 2.79
CLIP2-208	ENST00000491075	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		32.44	■■■□□ 2.78
CLIP2-208	ENST00000491075	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		32.43	■■■□□ 2.78
CLIP2-208	ENST00000491075	APLP2	Q06481	763 aa		32.41	■■■□□ 2.78
CLIP2-208	ENST00000491075	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		32.41	■■■□□ 2.78
CLIP2-208	ENST00000491075	ADGRB3	O60242	1522 aa		32.36	■■■□□ 2.77
CLIP2-208	ENST00000491075	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		32.36	■■■□□ 2.77
CLIP2-208	ENST00000491075	TET3	O43151	1660 aa		32.36	■■■□□ 2.77
CLIP2-208	ENST00000491075	IDI1	Q13907	227 aa		32.35	■■■□□ 2.77
CLIP2-208	ENST00000491075	NOS1	P29475	1434 aa		32.34	■■■□□ 2.77
CLIP2-208	ENST00000491075	TMEM94	Q12767	1356 aa		32.33	■■■□□ 2.77
CLIP2-208	ENST00000491075	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		32.31	■■■□□ 2.76
CLIP2-208	ENST00000491075	NWD1	Q149M9	1564 aa		32.31	■■■□□ 2.76
CLIP2-208	ENST00000491075	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	32.3	■■■□□ 2.76
CLIP2-208	ENST00000491075	KCNA6	P17658	529 aa		32.3	■■■□□ 2.76
CLIP2-208	ENST00000491075	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		32.3	■■■□□ 2.76
CLIP2-208	ENST00000491075	ADGRL2	O95490	1459 aa		32.29	■■■□□ 2.76
CLIP2-208	ENST00000491075	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.75
CLIP2-208	ENST00000491075	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		32.25	■■■□□ 2.75
CLIP2-208	ENST00000491075	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
CLIP2-208	ENST00000491075	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		32.24	■■■□□ 2.75
CLIP2-208	ENST00000491075	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	32.23	■■■□□ 2.75

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