RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490299.5

RPS6KC1-204, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, human

TSL 1 (best)

Gene RPS6KC1, Length 5,154 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS6KC1-204	ENST00000490299	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	FGD1	P98174	961 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	FAM161A	Q3B820	660 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	KIF16B	Q96L93	1317 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	MAP7D2	Q96T17	732 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	MORC1	Q86VD1	984 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	IFT140	Q96RY7	1462 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	ST18	O60284	1047 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	NLRP13	Q86W25	1043 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	GPATCH3	Q96I76	525 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	HMMR	O75330	724 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	UACA	Q9BZF9	1416 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	GPS2	Q13227	327 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	RGL3	Q3MIN7	710 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	KIF3A	Q9Y496	699 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	POGK	Q9P215	609 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	WDR62	O43379	1518 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	TPM2	P07951	284 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	TPM3	P06753	285 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	PDE4A	P27815	886 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	MLEC	Q14165	292 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	TEX35	Q5T0J7	233 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	PBRM1	Q86U86	1689 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	ROCK1	Q13464	1354 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	HECW1	Q76N89	1606 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299		E9PSI1	815 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299		G3V3G9	751 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299	IQGAP2	Q13576	1575 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS6KC1-204	ENST00000490299		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
RPS6KC1-204	ENST00000490299	AKNA	Q7Z591	1439 aa		4.59	□□□□□ -1.68
RPS6KC1-204	ENST00000490299	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		4.59	□□□□□ -1.68
RPS6KC1-204	ENST00000490299	MIA2	Q96PC5	1412 aa		4.59	□□□□□ -1.68
RPS6KC1-204	ENST00000490299	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
RPS6KC1-204	ENST00000490299	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		4.59	□□□□□ -1.68
RPS6KC1-204	ENST00000490299	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		4.59	□□□□□ -1.68
RPS6KC1-204	ENST00000490299	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
RPS6KC1-204	ENST00000490299	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS6KC1-204	ENST00000490299	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS6KC1-204	ENST00000490299	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS6KC1-204	ENST00000490299	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS6KC1-204	ENST00000490299	PKD2	Q13563	968 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS6KC1-204	ENST00000490299	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS6KC1-204	ENST00000490299	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS6KC1-204	ENST00000490299	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS6KC1-204	ENST00000490299	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS6KC1-204	ENST00000490299	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS6KC1-204	ENST00000490299	NES	P48681	1621 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS6KC1-204	ENST00000490299	SYNJ1	O43426	1573 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS6KC1-204	ENST00000490299	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS6KC1-204	ENST00000490299	MRE11	P49959	708 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS6KC1-204	ENST00000490299	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS6KC1-204	ENST00000490299	PRX	Q9BXM0	1461 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS6KC1-204	ENST00000490299	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS6KC1-204	ENST00000490299	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68

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