RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488684.5

POLR2F-211, Transcript of RNA polymerase II subunit F, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR2F, Length 564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2F-211ENST00000488684 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP35.45■■■■□ 3.27
POLR2F-211ENST00000488684 PLA2R1Q13018 1463 aa35.42■■■■□ 3.26
POLR2F-211ENST00000488684 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.4■■■■□ 3.26
POLR2F-211ENST00000488684 PKD2Q13563 968 aa35.4■■■■□ 3.26
POLR2F-211ENST00000488684 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.4■■■■□ 3.26
POLR2F-211ENST00000488684 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.4■■■■□ 3.26
POLR2F-211ENST00000488684 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.39■■■■□ 3.26
POLR2F-211ENST00000488684 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.38■■■■□ 3.25
POLR2F-211ENST00000488684 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.37■■■■□ 3.25
POLR2F-211ENST00000488684 PZPP20742 1482 aa35.36■■■■□ 3.25
POLR2F-211ENST00000488684 MIA2Q96PC5 1412 aa35.36■■■■□ 3.25
POLR2F-211ENST00000488684 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.36■■■■□ 3.25
POLR2F-211ENST00000488684 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
POLR2F-211ENST00000488684 TNRQ92752 1358 aa35.35■■■■□ 3.25
POLR2F-211ENST00000488684 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
POLR2F-211ENST00000488684 IQSEC2Q5JU85 1478 aa35.28■■■■□ 3.24
POLR2F-211ENST00000488684 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.24
POLR2F-211ENST00000488684 APLP2Q06481 763 aa35.21■■■■□ 3.23
POLR2F-211ENST00000488684 ABCC3O15438 1527 aa35.21■■■■□ 3.23
POLR2F-211ENST00000488684 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.2■■■■□ 3.23
POLR2F-211ENST00000488684 MROH1Q8NDA8 1641 aa35.17■■■■□ 3.22
POLR2F-211ENST00000488684 NLRP1Q9C000 1473 aa35.17■■■■□ 3.22
POLR2F-211ENST00000488684 ABCC5O15440 1437 aa35.16■■■■□ 3.22
POLR2F-211ENST00000488684 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.16■■■■□ 3.229e-6■□□□□ 9.6
POLR2F-211ENST00000488684 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.16■■■■□ 3.22
POLR2F-211ENST00000488684 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.15■■■■□ 3.22
POLR2F-211ENST00000488684 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.15■■■■□ 3.22
POLR2F-211ENST00000488684 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.14■■■■□ 3.22
POLR2F-211ENST00000488684 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.14■■■■□ 3.22
POLR2F-211ENST00000488684 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP35.14■■■■□ 3.22
POLR2F-211ENST00000488684 ANKLE2Q86XL3 938 aa35.12■■■■□ 3.21
POLR2F-211ENST00000488684 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.12■■■■□ 3.21
POLR2F-211ENST00000488684 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa35.1■■■■□ 3.21
POLR2F-211ENST00000488684 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.1■■■■□ 3.21
POLR2F-211ENST00000488684 KIF15Q9NS87 1388 aa35.1■■■■□ 3.21
POLR2F-211ENST00000488684 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.09■■■■□ 3.21
POLR2F-211ENST00000488684 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.09■■■■□ 3.21
POLR2F-211ENST00000488684 CEP152O94986 1710 aa35.08■■■■□ 3.21
POLR2F-211ENST00000488684 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.07■■■■□ 3.21
POLR2F-211ENST00000488684 ERVK-7P63135 1459 aa35.07■■■■□ 3.2
POLR2F-211ENST00000488684 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
POLR2F-211ENST00000488684 UBAP1LF5GYI3 381 aa35.06■■■■□ 3.2
POLR2F-211ENST00000488684 DAPK1P53355 1430 aa35.06■■■■□ 3.2
POLR2F-211ENST00000488684 ERBINQ96RT1 1412 aa35.02■■■■□ 3.2
POLR2F-211ENST00000488684 MED14O60244 1454 aa35■■■■□ 3.19
POLR2F-211ENST00000488684 DEPDC5O75140 1603 aa34.99■■■■□ 3.19
POLR2F-211ENST00000488684 DISP3Q9P2K9 1392 aa34.99■■■■□ 3.19
POLR2F-211ENST00000488684 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP34.98■■■■□ 3.19
POLR2F-211ENST00000488684 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP34.98■■■■□ 3.19
POLR2F-211ENST00000488684 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.98■■■■□ 3.19
POLR2F-211ENST00000488684 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP34.96■■■■□ 3.194e-8■■□□□ 13.2
POLR2F-211ENST00000488684 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa34.95■■■■□ 3.19
POLR2F-211ENST00000488684 VWDEQ8N2E2 1590 aa34.95■■■■□ 3.18
POLR2F-211ENST00000488684 CPS1P31327 1500 aa34.94■■■■□ 3.18
POLR2F-211ENST00000488684 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa34.91■■■■□ 3.18
POLR2F-211ENST00000488684 UBR1Q8IWV7 1749 aa34.9■■■■□ 3.18
POLR2F-211ENST00000488684 IQGAP1P46940 1657 aa34.89■■■■□ 3.18
POLR2F-211ENST00000488684 ILDR2Q71H61 639 aa34.88■■■■□ 3.17
POLR2F-211ENST00000488684 KANK1Q14678 1352 aa34.85■■■■□ 3.17
POLR2F-211ENST00000488684 LTKP29376 864 aa34.82■■■■□ 3.16
POLR2F-211ENST00000488684 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP34.81■■■■□ 3.16
POLR2F-211ENST00000488684 TOM1O60784 492 aa34.8■■■■□ 3.16
POLR2F-211ENST00000488684 STRCP1A6NGW2 1772 aa34.79■■■■□ 3.16
POLR2F-211ENST00000488684 ADGRL2O95490 1459 aa34.79■■■■□ 3.16
POLR2F-211ENST00000488684 ARHGAP23Q9P227 1491 aa34.79■■■■□ 3.16
POLR2F-211ENST00000488684 PIP4K2BP78356 416 aa34.79■■■■□ 3.16
POLR2F-211ENST00000488684 LMTK2Q8IWU2 1503 aa34.79■■■■□ 3.16
POLR2F-211ENST00000488684 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP34.78■■■■□ 3.16
POLR2F-211ENST00000488684 SLIT1O75093 1534 aa34.77■■■■□ 3.16
POLR2F-211ENST00000488684 TXNDC2Q86VQ3 553 aa34.77■■■■□ 3.16
POLR2F-211ENST00000488684 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
POLR2F-211ENST00000488684 PIK3C2BO00750 1634 aa34.75■■■■□ 3.15
POLR2F-211ENST00000488684 HSPA1LP34931 641 aa34.72■■■■□ 3.15
POLR2F-211ENST00000488684 IDI1Q13907 227 aa34.72■■■■□ 3.15
POLR2F-211ENST00000488684 LRRC7Q96NW7 1537 aa34.71■■■■□ 3.15
POLR2F-211ENST00000488684 ALKQ9UM73 1620 aa34.7■■■■□ 3.15
POLR2F-211ENST00000488684 TMEM2Q9UHN6 1383 aa34.68■■■■□ 3.14
POLR2F-211ENST00000488684 STAG3Q9UJ98 1225 aa34.68■■■■□ 3.14
POLR2F-211ENST00000488684 EID1Q9Y6B2 187 aa34.68■■■■□ 3.14
POLR2F-211ENST00000488684 SYNMO15061 1565 aa34.67■■■■□ 3.14
POLR2F-211ENST00000488684 EFCAB6Q5THR3 1501 aa34.66■■■■□ 3.14
POLR2F-211ENST00000488684 NOS1P29475 1434 aa34.66■■■■□ 3.14
POLR2F-211ENST00000488684 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa34.66■■■■□ 3.14
POLR2F-211ENST00000488684 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
POLR2F-211ENST00000488684 SOCS7O14512 581 aa34.58■■■■□ 3.13
POLR2F-211ENST00000488684 SLC52A1Q9NWF4 448 aa34.56■■■■□ 3.12
POLR2F-211ENST00000488684 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP34.52■■■■□ 3.12
POLR2F-211ENST00000488684 ADGRB3O60242 1522 aa34.52■■■■□ 3.12
POLR2F-211ENST00000488684 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP34.51■■■■□ 3.11
POLR2F-211ENST00000488684 TET3O43151 1660 aa34.5■■■■□ 3.11
POLR2F-211ENST00000488684 SLC26A8Q96RN1 970 aa34.49■■■■□ 3.11
POLR2F-211ENST00000488684 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
POLR2F-211ENST00000488684 UNC13BO14795 1591 aa34.47■■■■□ 3.11
POLR2F-211ENST00000488684 ROCK1Q13464 1354 aa34.47■■■■□ 3.11
POLR2F-211ENST00000488684 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.11
POLR2F-211ENST00000488684 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP34.44■■■■□ 3.1
POLR2F-211ENST00000488684 KCNA6P17658 529 aa34.43■■■■□ 3.1
POLR2F-211ENST00000488684 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.42■■■■□ 3.1
POLR2F-211ENST00000488684 MYO5BQ9ULV0 1848 aa34.41■■■■□ 3.1
POLR2F-211ENST00000488684 ITGAEP38570 1179 aa34.4■■■■□ 3.1
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