RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486790.2

RCC1-212, Transcript of regulator of chromosome condensation 1, humanhuman

TSL 5

Gene RCC1, Length 481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1-212ENST00000486790 MAP3K1Q13233 1512 aa41.87■■■■■ 4.29
RCC1-212ENST00000486790 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa41.86■■■■■ 4.29
RCC1-212ENST00000486790 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.86■■■■■ 4.29
RCC1-212ENST00000486790 KDM5DQ9BY66 1539 aa41.85■■■■■ 4.29
RCC1-212ENST00000486790 LTBP4Q8N2S1 1624 aa41.81■■■■■ 4.28
RCC1-212ENST00000486790 A2ML1A8K2U0 1454 aa41.81■■■■■ 4.28
RCC1-212ENST00000486790 PZPP20742 1482 aa41.77■■■■■ 4.28
RCC1-212ENST00000486790 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
RCC1-212ENST00000486790 TNRQ92752 1358 aa41.76■■■■■ 4.28
RCC1-212ENST00000486790 MIA2Q96PC5 1412 aa41.76■■■■■ 4.28
RCC1-212ENST00000486790 APLP2Q06481 763 aa41.75■■■■■ 4.27
RCC1-212ENST00000486790 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.71■■■■■ 4.27
RCC1-212ENST00000486790 MAST1Q9Y2H9 1570 aa41.71■■■■■ 4.27
RCC1-212ENST00000486790 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.7■■■■■ 4.27
RCC1-212ENST00000486790 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.67■■■■■ 4.26
RCC1-212ENST00000486790 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41.66■■■■■ 4.26
RCC1-212ENST00000486790 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP41.65■■■■■ 4.26
RCC1-212ENST00000486790 NLRP1Q9C000 1473 aa41.62■■■■■ 4.25
RCC1-212ENST00000486790 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP41.62■■■■■ 4.25
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RCC1-212ENST00000486790 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
RCC1-212ENST00000486790 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
RCC1-212ENST00000486790 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP41.58■■■■■ 4.25
RCC1-212ENST00000486790 ANKLE2Q86XL3 938 aa41.57■■■■■ 4.25
RCC1-212ENST00000486790 DUOX2Q9NRD8 1548 aa41.52■■■■■ 4.24
RCC1-212ENST00000486790 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.51■■■■■ 4.24
RCC1-212ENST00000486790 UBAP1LF5GYI3 381 aa41.5■■■■■ 4.23
RCC1-212ENST00000486790 ABCC3O15438 1527 aa41.49■■■■■ 4.23
RCC1-212ENST00000486790 DISP3Q9P2K9 1392 aa41.48■■■■■ 4.23
RCC1-212ENST00000486790 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.46■■■■■ 4.23
RCC1-212ENST00000486790 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.44■■■■■ 4.22
RCC1-212ENST00000486790 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.42■■■■■ 4.22
RCC1-212ENST00000486790 CPS1P31327 1500 aa41.42■■■■■ 4.22
RCC1-212ENST00000486790 KIF15Q9NS87 1388 aa41.41■■■■■ 4.22
RCC1-212ENST00000486790 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.41■■■■■ 4.22
RCC1-212ENST00000486790 NEURL4Q96JN8 1562 aa41.41■■■■■ 4.22
RCC1-212ENST00000486790 DEPDC5O75140 1603 aa41.39■■■■■ 4.22
RCC1-212ENST00000486790 ERBINQ96RT1 1412 aa41.38■■■■■ 4.22
RCC1-212ENST00000486790 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.38■■■■■ 4.21
RCC1-212ENST00000486790 ERVK-7P63135 1459 aa41.36■■■■■ 4.21
RCC1-212ENST00000486790 ABCC5O15440 1437 aa41.35■■■■■ 4.21
RCC1-212ENST00000486790 MED14O60244 1454 aa41.34■■■■■ 4.21
RCC1-212ENST00000486790 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.34■■■■■ 4.21
RCC1-212ENST00000486790 CEP152O94986 1710 aa41.34■■■■■ 4.21
RCC1-212ENST00000486790 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP41.34■■■■■ 4.21
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RCC1-212ENST00000486790 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.32■■■■■ 4.2
RCC1-212ENST00000486790 DAPK1P53355 1430 aa41.3■■■■■ 4.2
RCC1-212ENST00000486790 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.3■■■■■ 4.2
RCC1-212ENST00000486790 KANK1Q14678 1352 aa41.3■■■■■ 4.2
RCC1-212ENST00000486790 TOM1O60784 492 aa41.3■■■■■ 4.2
RCC1-212ENST00000486790 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.28■■■■■ 4.2
RCC1-212ENST00000486790 IQGAP1P46940 1657 aa41.26■■■■■ 4.2
RCC1-212ENST00000486790 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.26■■■■■ 4.2
RCC1-212ENST00000486790 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.26■■■■■ 4.19
RCC1-212ENST00000486790 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.22■■■■■ 4.19
RCC1-212ENST00000486790 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
RCC1-212ENST00000486790 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.2■■■■■ 4.19
RCC1-212ENST00000486790 UBR1Q8IWV7 1749 aa41.17■■■■■ 4.18
RCC1-212ENST00000486790 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.14■■■■■ 4.18
RCC1-212ENST00000486790 PIP4K2BP78356 416 aa41.13■■■■■ 4.17
RCC1-212ENST00000486790 EID1Q9Y6B2 187 aa41.13■■■■■ 4.17
RCC1-212ENST00000486790 STAG3Q9UJ98 1225 aa41.12■■■■■ 4.17
RCC1-212ENST00000486790 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP41.11■■■■■ 4.17
RCC1-212ENST00000486790 TXNDC2Q86VQ3 553 aa41.07■■■■■ 4.17
RCC1-212ENST00000486790 ILDR2Q71H61 639 aa41.06■■■■■ 4.16
RCC1-212ENST00000486790 SLIT1O75093 1534 aa41.05■■■■■ 4.16
RCC1-212ENST00000486790 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.04■■■■■ 4.16
RCC1-212ENST00000486790 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.03■■■■■ 4.16
RCC1-212ENST00000486790 SYNMO15061 1565 aa41.03■■■■■ 4.16
RCC1-212ENST00000486790 SOCS7O14512 581 aa41.02■■■■■ 4.16
RCC1-212ENST00000486790 ARHGAP23Q9P227 1491 aa41.02■■■■■ 4.16
RCC1-212ENST00000486790 ADGRL2O95490 1459 aa41■■■■■ 4.15
RCC1-212ENST00000486790 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
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RCC1-212ENST00000486790 PIK3C2BO00750 1634 aa40.96■■■■■ 4.15
RCC1-212ENST00000486790 LTKP29376 864 aa40.95■■■■■ 4.15
RCC1-212ENST00000486790 TMEM2Q9UHN6 1383 aa40.94■■■■■ 4.14
RCC1-212ENST00000486790 LRRC7Q96NW7 1537 aa40.93■■■■■ 4.14
RCC1-212ENST00000486790 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.91■■■■■ 4.14
RCC1-212ENST00000486790 STRCP1A6NGW2 1772 aa40.91■■■■■ 4.14
RCC1-212ENST00000486790 IDI1Q13907 227 aa40.89■■■■■ 4.14
RCC1-212ENST00000486790 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.89■■■■■ 4.14
RCC1-212ENST00000486790 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.89■■■■■ 4.14
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RCC1-212ENST00000486790 ALKQ9UM73 1620 aa40.75■■■■■ 4.11
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RCC1-212ENST00000486790 TET3O43151 1660 aa40.72■■■■■ 4.11
RCC1-212ENST00000486790 BCANQ96GW7 911 aa40.71■■■■■ 4.11
RCC1-212ENST00000486790 KCNA6P17658 529 aa40.69■■■■■ 4.1
RCC1-212ENST00000486790 ROCK1Q13464 1354 aa40.68■■■■■ 4.1
RCC1-212ENST00000486790 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.66■■■■■ 4.1
RCC1-212ENST00000486790 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
RCC1-212ENST00000486790 SLC26A8Q96RN1 970 aa40.63■■■■■ 4.09
RCC1-212ENST00000486790 UNC13BO14795 1591 aa40.62■■■■■ 4.09
RCC1-212ENST00000486790 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP40.62■■■■■ 4.09
RCC1-212ENST00000486790 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
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