RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486441.1

SDCCAG3-211, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

TSL 5

Gene SDCCAG3, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3-211ENST00000486441 KIF3BO15066 747 aa23.05■■□□□ 1.28
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SDCCAG3-211ENST00000486441 NCOA2Q15596 1464 aa23■■□□□ 1.27
SDCCAG3-211ENST00000486441 PZPP20742 1482 aa22.99■■□□□ 1.27
SDCCAG3-211ENST00000486441 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.99■■□□□ 1.27
SDCCAG3-211ENST00000486441 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.98■■□□□ 1.27
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SDCCAG3-211ENST00000486441 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
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SDCCAG3-211ENST00000486441 TSPY10P0CW01 314 aa22.87■■□□□ 1.25
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SDCCAG3-211ENST00000486441 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.85■■□□□ 1.25
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SDCCAG3-211ENST00000486441 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
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SDCCAG3-211ENST00000486441 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.78■■□□□ 1.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.77■■□□□ 1.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 ERVK-7P63135 1459 aa22.77■■□□□ 1.24
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SDCCAG3-211ENST00000486441 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.76■■□□□ 1.23
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SDCCAG3-211ENST00000486441 IQGAP1P46940 1657 aa22.73■■□□□ 1.23
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SDCCAG3-211ENST00000486441 MAP3K1Q13233 1512 aa22.69■■□□□ 1.22
SDCCAG3-211ENST00000486441 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.69■■□□□ 1.22
SDCCAG3-211ENST00000486441 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.67■■□□□ 1.22
SDCCAG3-211ENST00000486441 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.67■■□□□ 1.22
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SDCCAG3-211ENST00000486441 ABCC5O15440 1437 aa22.65■■□□□ 1.22
SDCCAG3-211ENST00000486441 CEP152O94986 1710 aa22.65■■□□□ 1.22
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SDCCAG3-211ENST00000486441 KIF15Q9NS87 1388 aa22.62■■□□□ 1.21
SDCCAG3-211ENST00000486441 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.61■■□□□ 1.21
SDCCAG3-211ENST00000486441 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SDCCAG3-211ENST00000486441 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SDCCAG3-211ENST00000486441 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SDCCAG3-211ENST00000486441 SYNMO15061 1565 aa22.59■■□□□ 1.21
SDCCAG3-211ENST00000486441 ERBINQ96RT1 1412 aa22.57■■□□□ 1.2
SDCCAG3-211ENST00000486441 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SDCCAG3-211ENST00000486441 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.57■■□□□ 1.2
SDCCAG3-211ENST00000486441 IDI1Q13907 227 aa22.56■■□□□ 1.2
SDCCAG3-211ENST00000486441 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
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SDCCAG3-211ENST00000486441 PIK3C2BO00750 1634 aa22.53■■□□□ 1.2
SDCCAG3-211ENST00000486441 DAPK1P53355 1430 aa22.53■■□□□ 1.2
SDCCAG3-211ENST00000486441 EID1Q9Y6B2 187 aa22.52■■□□□ 1.2
SDCCAG3-211ENST00000486441 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.5■■□□□ 1.19
SDCCAG3-211ENST00000486441 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.5■■□□□ 1.19
SDCCAG3-211ENST00000486441 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.5■■□□□ 1.19
SDCCAG3-211ENST00000486441 TET3O43151 1660 aa22.5■■□□□ 1.19
SDCCAG3-211ENST00000486441 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.5■■□□□ 1.19
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SDCCAG3-211ENST00000486441 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.48■■□□□ 1.19
SDCCAG3-211ENST00000486441 TMEM94Q12767 1356 aa22.48■■□□□ 1.19
SDCCAG3-211ENST00000486441 NOS1P29475 1434 aa22.48■■□□□ 1.19
SDCCAG3-211ENST00000486441 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.48■■□□□ 1.19
SDCCAG3-211ENST00000486441 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SDCCAG3-211ENST00000486441 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.46■■□□□ 1.19
SDCCAG3-211ENST00000486441 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.45■■□□□ 1.18
SDCCAG3-211ENST00000486441 KANK1Q14678 1352 aa22.44■■□□□ 1.18
SDCCAG3-211ENST00000486441 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
SDCCAG3-211ENST00000486441 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.43■■□□□ 1.18
SDCCAG3-211ENST00000486441 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.42■■□□□ 1.18
SDCCAG3-211ENST00000486441 POTEAQ6S8J7 498 aa22.4■■□□□ 1.18
SDCCAG3-211ENST00000486441 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SDCCAG3-211ENST00000486441 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.38■■□□□ 1.17
SDCCAG3-211ENST00000486441 ADGRL2O95490 1459 aa22.36■■□□□ 1.17
SDCCAG3-211ENST00000486441 ZFYVE9O95405 1425 aa22.35■■□□□ 1.17
SDCCAG3-211ENST00000486441 ADGRB3O60242 1522 aa22.35■■□□□ 1.17
SDCCAG3-211ENST00000486441 APLP2Q06481 763 aa22.34■■□□□ 1.17
SDCCAG3-211ENST00000486441 NWD1Q149M9 1564 aa22.33■■□□□ 1.17
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