RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486418.5

TIMMDC1-205, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene TIMMDC1, Length 551 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-205ENST00000486418 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.36■■□□□ 1.33
TIMMDC1-205ENST00000486418 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
TIMMDC1-205ENST00000486418 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.35■■□□□ 1.33
TIMMDC1-205ENST00000486418 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.34■■□□□ 1.33
TIMMDC1-205ENST00000486418 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
TIMMDC1-205ENST00000486418 KIF15Q9NS87 1388 aa23.32■■□□□ 1.32
TIMMDC1-205ENST00000486418 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.32■■□□□ 1.32
TIMMDC1-205ENST00000486418 PTPRKQ15262 1439 aa23.32■■□□□ 1.32
TIMMDC1-205ENST00000486418 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.31■■□□□ 1.32
TIMMDC1-205ENST00000486418 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.3■■□□□ 1.32
TIMMDC1-205ENST00000486418 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
TIMMDC1-205ENST00000486418 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
TIMMDC1-205ENST00000486418 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.27■■□□□ 1.32
TIMMDC1-205ENST00000486418 STRCQ7RTU9 1775 aa23.27■■□□□ 1.32
TIMMDC1-205ENST00000486418 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
TIMMDC1-205ENST00000486418 NCOA1Q15788 1441 aa23.25■■□□□ 1.31
TIMMDC1-205ENST00000486418 ERBINQ96RT1 1412 aa23.25■■□□□ 1.31
TIMMDC1-205ENST00000486418 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
TIMMDC1-205ENST00000486418 PZPP20742 1482 aa23.23■■□□□ 1.31
TIMMDC1-205ENST00000486418 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.22■■□□□ 1.31
TIMMDC1-205ENST00000486418 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.21■■□□□ 1.31
TIMMDC1-205ENST00000486418 CEP152O94986 1710 aa23.21■■□□□ 1.31
TIMMDC1-205ENST00000486418 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.2■■□□□ 1.3
TIMMDC1-205ENST00000486418 ABCC3O15438 1527 aa23.2■■□□□ 1.3
TIMMDC1-205ENST00000486418 ADGRL2O95490 1459 aa23.2■■□□□ 1.3
TIMMDC1-205ENST00000486418 TNRQ92752 1358 aa23.19■■□□□ 1.3
TIMMDC1-205ENST00000486418 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
TIMMDC1-205ENST00000486418 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.18■■□□□ 1.3
TIMMDC1-205ENST00000486418 KANK1Q14678 1352 aa23.17■■□□□ 1.3
TIMMDC1-205ENST00000486418 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
TIMMDC1-205ENST00000486418 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.15■■□□□ 1.3
TIMMDC1-205ENST00000486418 ITGAEP38570 1179 aa23.15■■□□□ 1.3
TIMMDC1-205ENST00000486418 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.15■■□□□ 1.3
TIMMDC1-205ENST00000486418 DEPDC5O75140 1603 aa23.15■■□□□ 1.3
TIMMDC1-205ENST00000486418 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
TIMMDC1-205ENST00000486418 PTPRTO14522 1441 aa23.13■■□□□ 1.29
TIMMDC1-205ENST00000486418 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.12■■□□□ 1.29
TIMMDC1-205ENST00000486418 PKD2Q13563 968 aa23.12■■□□□ 1.29
TIMMDC1-205ENST00000486418 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.11■■□□□ 1.29
TIMMDC1-205ENST00000486418 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
TIMMDC1-205ENST00000486418 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
TIMMDC1-205ENST00000486418 ROCK1Q13464 1354 aa23.09■■□□□ 1.29
TIMMDC1-205ENST00000486418 NLRP1Q9C000 1473 aa23.09■■□□□ 1.29
TIMMDC1-205ENST00000486418 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.08■■□□□ 1.29
TIMMDC1-205ENST00000486418 PLA2R1Q13018 1463 aa23.08■■□□□ 1.29
TIMMDC1-205ENST00000486418 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.08■■□□□ 1.29
TIMMDC1-205ENST00000486418 ERVK-7P63135 1459 aa23.06■■□□□ 1.28
TIMMDC1-205ENST00000486418 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.05■■□□□ 1.28
TIMMDC1-205ENST00000486418 CERKQ8TCT0 537 aa23.04■■□□□ 1.28
TIMMDC1-205ENST00000486418 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
TIMMDC1-205ENST00000486418 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.03■■□□□ 1.28
TIMMDC1-205ENST00000486418 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.03■■□□□ 1.28
TIMMDC1-205ENST00000486418 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.02■■□□□ 1.28
TIMMDC1-205ENST00000486418 FBXO41Q8TF61 875 aa23.02■■□□□ 1.28
TIMMDC1-205ENST00000486418 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
TIMMDC1-205ENST00000486418 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.96■■□□□ 1.27
TIMMDC1-205ENST00000486418 UNC13BO14795 1591 aa22.95■■□□□ 1.26
TIMMDC1-205ENST00000486418 TET3O43151 1660 aa22.94■■□□□ 1.26
TIMMDC1-205ENST00000486418 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.94■■□□□ 1.26
TIMMDC1-205ENST00000486418 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.94■■□□□ 1.26
TIMMDC1-205ENST00000486418 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.93■■□□□ 1.26
TIMMDC1-205ENST00000486418 IDI1Q13907 227 aa22.92■■□□□ 1.26
TIMMDC1-205ENST00000486418 NUP155O75694 1391 aa22.91■■□□□ 1.26
TIMMDC1-205ENST00000486418 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TIMMDC1-205ENST00000486418 PIK3C2BO00750 1634 aa22.9■■□□□ 1.26
TIMMDC1-205ENST00000486418 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.9■■□□□ 1.26
TIMMDC1-205ENST00000486418 NOS1P29475 1434 aa22.9■■□□□ 1.26
TIMMDC1-205ENST00000486418 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.89■■□□□ 1.25
TIMMDC1-205ENST00000486418 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.89■■□□□ 1.25
TIMMDC1-205ENST00000486418 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
TIMMDC1-205ENST00000486418 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.88■■□□□ 1.25
TIMMDC1-205ENST00000486418 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.87■■□□□ 1.25
TIMMDC1-205ENST00000486418 SYNMO15061 1565 aa22.87■■□□□ 1.25
TIMMDC1-205ENST00000486418 MED14O60244 1454 aa22.86■■□□□ 1.25
TIMMDC1-205ENST00000486418 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
TIMMDC1-205ENST00000486418 EID1Q9Y6B2 187 aa22.86■■□□□ 1.25
TIMMDC1-205ENST00000486418 E9PCH4 1651 aa22.86■■□□□ 1.25
TIMMDC1-205ENST00000486418 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
TIMMDC1-205ENST00000486418 IQGAP1P46940 1657 aa22.84■■□□□ 1.25
TIMMDC1-205ENST00000486418 NAIPQ13075 1403 aa22.83■■□□□ 1.25
TIMMDC1-205ENST00000486418 LTKP29376 864 aa22.83■■□□□ 1.25
TIMMDC1-205ENST00000486418 SLIT1O75093 1534 aa22.82■■□□□ 1.24
TIMMDC1-205ENST00000486418 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.82■■□□□ 1.24
TIMMDC1-205ENST00000486418 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
TIMMDC1-205ENST00000486418 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.8■■□□□ 1.24
TIMMDC1-205ENST00000486418 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.8■■□□□ 1.24
TIMMDC1-205ENST00000486418 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.79■■□□□ 1.24
TIMMDC1-205ENST00000486418 TRIM52Q96A61 297 aa22.78■■□□□ 1.24
TIMMDC1-205ENST00000486418 HFM1A2PYH4 1435 aa22.77■■□□□ 1.24
TIMMDC1-205ENST00000486418 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
TIMMDC1-205ENST00000486418 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
TIMMDC1-205ENST00000486418 ADGRB3O60242 1522 aa22.76■■□□□ 1.23
TIMMDC1-205ENST00000486418 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.72■■□□□ 1.23
TIMMDC1-205ENST00000486418 CPS1P31327 1500 aa22.72■■□□□ 1.23
TIMMDC1-205ENST00000486418 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.71■■□□□ 1.23
TIMMDC1-205ENST00000486418 BCANQ96GW7 911 aa22.69■■□□□ 1.22
TIMMDC1-205ENST00000486418 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.68■■□□□ 1.22
TIMMDC1-205ENST00000486418 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.67■■□□□ 1.22
TIMMDC1-205ENST00000486418 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
TIMMDC1-205ENST00000486418 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
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