RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485941.2

NBPF3-211, Transcript of NBPF member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NBPF3, Length 921 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3-211ENST00000485941 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP37.2■■■■□ 3.55
NBPF3-211ENST00000485941 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa37.2■■■■□ 3.54
NBPF3-211ENST00000485941 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.19■■■■□ 3.54
NBPF3-211ENST00000485941 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP37.18■■■■□ 3.54
NBPF3-211ENST00000485941 KDM5DQ9BY66 1539 aa37.17■■■■□ 3.54
NBPF3-211ENST00000485941 PZPP20742 1482 aa37.17■■■■□ 3.54
NBPF3-211ENST00000485941 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.15■■■■□ 3.54
NBPF3-211ENST00000485941 TNRQ92752 1358 aa37.13■■■■□ 3.53
NBPF3-211ENST00000485941 MAP3K1Q13233 1512 aa37.1■■■■□ 3.53
NBPF3-211ENST00000485941 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa37.09■■■■□ 3.53
NBPF3-211ENST00000485941 TSPY4P0CV99 314 aa37.08■■■■□ 3.53
NBPF3-211ENST00000485941 TSPY10P0CW01 314 aa37.08■■■■□ 3.53
NBPF3-211ENST00000485941 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP37.08■■■■□ 3.53
NBPF3-211ENST00000485941 MAST1Q9Y2H9 1570 aa37.08■■■■□ 3.53
NBPF3-211ENST00000485941 NEURL4Q96JN8 1562 aa37.05■■■■□ 3.52
NBPF3-211ENST00000485941 MIA2Q96PC5 1412 aa37.04■■■■□ 3.52
NBPF3-211ENST00000485941 DISP3Q9P2K9 1392 aa37.04■■■■□ 3.52
NBPF3-211ENST00000485941 ILDR2Q71H61 639 aa37.03■■■■□ 3.52
NBPF3-211ENST00000485941 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP37.02■■■■□ 3.52
NBPF3-211ENST00000485941 NLRP1Q9C000 1473 aa36.98■■■■□ 3.51
NBPF3-211ENST00000485941 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP36.97■■■■□ 3.51
NBPF3-211ENST00000485941 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.97■■■■□ 3.51
NBPF3-211ENST00000485941 ABCC3O15438 1527 aa36.95■■■■□ 3.5
NBPF3-211ENST00000485941 UBAP1LF5GYI3 381 aa36.94■■■■□ 3.5
NBPF3-211ENST00000485941 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.93■■■■□ 3.5
NBPF3-211ENST00000485941 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.93■■■■□ 3.5
NBPF3-211ENST00000485941 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP36.92■■■■□ 3.5
NBPF3-211ENST00000485941 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP36.91■■■■□ 3.5
NBPF3-211ENST00000485941 MED14O60244 1454 aa36.9■■■■□ 3.5
NBPF3-211ENST00000485941 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.9■■■■□ 3.5
NBPF3-211ENST00000485941 UGGT1Q9NYU2 1555 aa36.9■■■■□ 3.5
NBPF3-211ENST00000485941 ANKLE2Q86XL3 938 aa36.88■■■■□ 3.49
NBPF3-211ENST00000485941 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.49
NBPF3-211ENST00000485941 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.88■■■■□ 3.49
NBPF3-211ENST00000485941 DEPDC5O75140 1603 aa36.86■■■■□ 3.49
NBPF3-211ENST00000485941 CPS1P31327 1500 aa36.85■■■■□ 3.49
NBPF3-211ENST00000485941 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.85■■■■□ 3.49
NBPF3-211ENST00000485941 ERVK-7P63135 1459 aa36.82■■■■□ 3.49
NBPF3-211ENST00000485941 DUOX2Q9NRD8 1548 aa36.81■■■■□ 3.48
NBPF3-211ENST00000485941 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP36.8■■■■□ 3.48
NBPF3-211ENST00000485941 ABCC5O15440 1437 aa36.77■■■■□ 3.48
NBPF3-211ENST00000485941 SOCS7O14512 581 aa36.77■■■■□ 3.48
NBPF3-211ENST00000485941 CEP152O94986 1710 aa36.73■■■■□ 3.47
NBPF3-211ENST00000485941 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.71■■■■□ 3.47
NBPF3-211ENST00000485941 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.71■■■■□ 3.47
NBPF3-211ENST00000485941 KIF15Q9NS87 1388 aa36.71■■■■□ 3.47
NBPF3-211ENST00000485941 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.7■■■■□ 3.47
NBPF3-211ENST00000485941 IQGAP1P46940 1657 aa36.7■■■■□ 3.47
NBPF3-211ENST00000485941 ALKQ9UM73 1620 aa36.7■■■■□ 3.47
NBPF3-211ENST00000485941 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.69■■■■□ 3.46
NBPF3-211ENST00000485941 ERBINQ96RT1 1412 aa36.68■■■■□ 3.46
NBPF3-211ENST00000485941 UBR1Q8IWV7 1749 aa36.66■■■■□ 3.46
NBPF3-211ENST00000485941 TOM1O60784 492 aa36.65■■■■□ 3.46
NBPF3-211ENST00000485941 DAPK1P53355 1430 aa36.65■■■■□ 3.46
NBPF3-211ENST00000485941 STRCP1A6NGW2 1772 aa36.64■■■■□ 3.46
NBPF3-211ENST00000485941 HSPA1LP34931 641 aa36.63■■■■□ 3.45
NBPF3-211ENST00000485941 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.63■■■■□ 3.45
NBPF3-211ENST00000485941 ARHGAP23Q9P227 1491 aa36.62■■■■□ 3.45
NBPF3-211ENST00000485941 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.62■■■■□ 3.45
NBPF3-211ENST00000485941 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
NBPF3-211ENST00000485941 SLIT1O75093 1534 aa36.59■■■■□ 3.45
NBPF3-211ENST00000485941 PIP4K2BP78356 416 aa36.58■■■■□ 3.45
NBPF3-211ENST00000485941 LRRC7Q96NW7 1537 aa36.58■■■■□ 3.45
NBPF3-211ENST00000485941 LTKP29376 864 aa36.57■■■■□ 3.44
NBPF3-211ENST00000485941 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP36.56■■■■□ 3.44
NBPF3-211ENST00000485941 APLP2Q06481 763 aa36.52■■■■□ 3.44
NBPF3-211ENST00000485941 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.52■■■■□ 3.44
NBPF3-211ENST00000485941 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP36.51■■■■□ 3.43
NBPF3-211ENST00000485941 SYNMO15061 1565 aa36.49■■■■□ 3.43
NBPF3-211ENST00000485941 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP36.48■■■■□ 3.43
NBPF3-211ENST00000485941 TXNDC2Q86VQ3 553 aa36.47■■■■□ 3.43
NBPF3-211ENST00000485941 PIK3C2BO00750 1634 aa36.46■■■■□ 3.43
NBPF3-211ENST00000485941 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.46■■■■□ 3.43
NBPF3-211ENST00000485941 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.44■■■■□ 3.42
NBPF3-211ENST00000485941 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP36.44■■■■□ 3.42
NBPF3-211ENST00000485941 TMEM2Q9UHN6 1383 aa36.43■■■■□ 3.42
NBPF3-211ENST00000485941 KANK1Q14678 1352 aa36.42■■■■□ 3.42
NBPF3-211ENST00000485941 ADGRL2O95490 1459 aa36.42■■■■□ 3.42
NBPF3-211ENST00000485941 IDI1Q13907 227 aa36.4■■■■□ 3.42
NBPF3-211ENST00000485941 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
NBPF3-211ENST00000485941 NOS1P29475 1434 aa36.39■■■■□ 3.42
NBPF3-211ENST00000485941 EID1Q9Y6B2 187 aa36.35■■■■□ 3.41
NBPF3-211ENST00000485941 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
NBPF3-211ENST00000485941 EFCAB6Q5THR3 1501 aa36.34■■■■□ 3.41
NBPF3-211ENST00000485941 TET3O43151 1660 aa36.3■■■■□ 3.4
NBPF3-211ENST00000485941 STAG3Q9UJ98 1225 aa36.24■■■■□ 3.39
NBPF3-211ENST00000485941 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.24■■■■□ 3.39
NBPF3-211ENST00000485941 ADGRB3O60242 1522 aa36.23■■■■□ 3.39
NBPF3-211ENST00000485941 SLC52A1Q9NWF4 448 aa36.22■■■■□ 3.39
NBPF3-211ENST00000485941 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
NBPF3-211ENST00000485941 KCNA6P17658 529 aa36.19■■■■□ 3.38
NBPF3-211ENST00000485941 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
NBPF3-211ENST00000485941 SLC26A8Q96RN1 970 aa36.16■■■■□ 3.38
NBPF3-211ENST00000485941 TMEM94Q12767 1356 aa36.15■■■■□ 3.38
NBPF3-211ENST00000485941 FAM135BQ49AJ0 1406 aa36.14■■■■□ 3.38
NBPF3-211ENST00000485941 ZFYVE9O95405 1425 aa36.13■■■■□ 3.37
NBPF3-211ENST00000485941 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
NBPF3-211ENST00000485941 NWD1Q149M9 1564 aa36.1■■■■□ 3.37
NBPF3-211ENST00000485941 UNC13BO14795 1591 aa36.07■■■■□ 3.37
NBPF3-211ENST00000485941 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
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