RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484918.1

MRPL23-209, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L23, human

TSL 5

Gene MRPL23, Length 232 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL23-209	ENST00000484918	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MRPL23-209	ENST00000484918	SHPRH	Q149N8	1683 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MRPL23-209	ENST00000484918	SLC34A2	O95436	690 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MRPL23-209	ENST00000484918	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
MRPL23-209	ENST00000484918	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MRPL23-209	ENST00000484918	CEP350	Q5VT06	3117 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MRPL23-209	ENST00000484918	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MRPL23-209	ENST00000484918	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MRPL23-209	ENST00000484918	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MRPL23-209	ENST00000484918	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MRPL23-209	ENST00000484918	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MRPL23-209	ENST00000484918	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
MRPL23-209	ENST00000484918	AFF2	P51816	1311 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MRPL23-209	ENST00000484918	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MRPL23-209	ENST00000484918	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MRPL23-209	ENST00000484918	NWD1	Q149M9	1564 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MRPL23-209	ENST00000484918	CCDC125	Q86Z20	511 aa		11.6	□□□□□ -0.55
MRPL23-209	ENST00000484918	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		11.6	□□□□□ -0.55
MRPL23-209	ENST00000484918	MAP3K1	Q13233	1512 aa		11.6	□□□□□ -0.55
MRPL23-209	ENST00000484918	HRC	P23327	699 aa		11.58	□□□□□ -0.56
MRPL23-209	ENST00000484918	P3H3	Q8IVL6	736 aa		11.58	□□□□□ -0.56
MRPL23-209	ENST00000484918	ATP7A	Q04656	1500 aa		11.57	□□□□□ -0.56
MRPL23-209	ENST00000484918	C1QTNF8	P60827	252 aa		11.57	□□□□□ -0.56
MRPL23-209	ENST00000484918	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	11.56	□□□□□ -0.56
MRPL23-209	ENST00000484918	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	11.56	□□□□□ -0.56
MRPL23-209	ENST00000484918	TNR	Q92752	1358 aa		11.55	□□□□□ -0.56
MRPL23-209	ENST00000484918	SAMD9	Q5K651	1589 aa		11.55	□□□□□ -0.56
MRPL23-209	ENST00000484918	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		11.55	□□□□□ -0.56
MRPL23-209	ENST00000484918	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	11.55	□□□□□ -0.56
MRPL23-209	ENST00000484918	KIF14	Q15058	1648 aa		11.55	□□□□□ -0.56
MRPL23-209	ENST00000484918	PLXNC1	O60486	1568 aa		11.54	□□□□□ -0.56
MRPL23-209	ENST00000484918	DIP2A	Q14689	1571 aa		11.54	□□□□□ -0.56
MRPL23-209	ENST00000484918	TMEM94	Q12767	1356 aa		11.54	□□□□□ -0.56
MRPL23-209	ENST00000484918	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	11.53	□□□□□ -0.56
MRPL23-209	ENST00000484918	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		11.53	□□□□□ -0.56
MRPL23-209	ENST00000484918	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
MRPL23-209	ENST00000484918	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
MRPL23-209	ENST00000484918	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		11.5	□□□□□ -0.57
MRPL23-209	ENST00000484918	NLRP1	Q9C000	1473 aa		11.5	□□□□□ -0.57
MRPL23-209	ENST00000484918	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		11.5	□□□□□ -0.57
MRPL23-209	ENST00000484918	TIAM1	Q13009	1591 aa		11.5	□□□□□ -0.57
MRPL23-209	ENST00000484918	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MRPL23-209	ENST00000484918	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MRPL23-209	ENST00000484918	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
MRPL23-209	ENST00000484918	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MRPL23-209	ENST00000484918	NGLY1	Q96IV0	654 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MRPL23-209	ENST00000484918	SLAIN2	Q9P270	581 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MRPL23-209	ENST00000484918	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
MRPL23-209	ENST00000484918	PZP	P20742	1482 aa		11.46	□□□□□ -0.57
MRPL23-209	ENST00000484918	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
MRPL23-209	ENST00000484918	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		11.45	□□□□□ -0.58
MRPL23-209	ENST00000484918	MIA2	Q96PC5	1412 aa		11.44	□□□□□ -0.58
MRPL23-209	ENST00000484918	GGT6	Q6P531	493 aa		11.44	□□□□□ -0.58
MRPL23-209	ENST00000484918	ABCC3	O15438	1527 aa		11.43	□□□□□ -0.58
MRPL23-209	ENST00000484918	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
MRPL23-209	ENST00000484918	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
MRPL23-209	ENST00000484918	C8orf37	Q96NL8	207 aa		11.42	□□□□□ -0.58
MRPL23-209	ENST00000484918	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		11.41	□□□□□ -0.58
MRPL23-209	ENST00000484918	A2M	P01023	1474 aa		11.41	□□□□□ -0.58
MRPL23-209	ENST00000484918	MSH6	P52701	1360 aa		11.4	□□□□□ -0.59
MRPL23-209	ENST00000484918	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		11.39	□□□□□ -0.59
MRPL23-209	ENST00000484918	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		11.39	□□□□□ -0.59
MRPL23-209	ENST00000484918	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
MRPL23-209	ENST00000484918	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		11.38	□□□□□ -0.59
MRPL23-209	ENST00000484918	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
MRPL23-209	ENST00000484918	ATRN	O75882	1429 aa		11.37	□□□□□ -0.59
MRPL23-209	ENST00000484918	LTK	P29376	864 aa		11.37	□□□□□ -0.59
MRPL23-209	ENST00000484918	PREX2	Q70Z35	1606 aa		11.37	□□□□□ -0.59
MRPL23-209	ENST00000484918	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
MRPL23-209	ENST00000484918	UNC13B	O14795	1591 aa		11.37	□□□□□ -0.59
MRPL23-209	ENST00000484918	KCNA6	P17658	529 aa		11.36	□□□□□ -0.59
MRPL23-209	ENST00000484918	CHD4	Q14839	1912 aa		11.36	□□□□□ -0.59
MRPL23-209	ENST00000484918	NCOA2	Q15596	1464 aa		11.36	□□□□□ -0.59
MRPL23-209	ENST00000484918	UTRN	P46939	3433 aa		11.36	□□□□□ -0.59
MRPL23-209	ENST00000484918	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		11.36	□□□□□ -0.59
MRPL23-209	ENST00000484918	SLIT1	O75093	1534 aa		11.35	□□□□□ -0.59
MRPL23-209	ENST00000484918	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		11.35	□□□□□ -0.59
MRPL23-209	ENST00000484918	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		11.35	□□□□□ -0.59
MRPL23-209	ENST00000484918	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
MRPL23-209	ENST00000484918	PRX	Q9BXM0	1461 aa		11.32	□□□□□ -0.6
MRPL23-209	ENST00000484918	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		11.32	□□□□□ -0.6
MRPL23-209	ENST00000484918	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
MRPL23-209	ENST00000484918	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
MRPL23-209	ENST00000484918	USP21	Q9UK80	565 aa		11.3	□□□□□ -0.6
MRPL23-209	ENST00000484918	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		11.29	□□□□□ -0.6
MRPL23-209	ENST00000484918	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		11.29	□□□□□ -0.6
MRPL23-209	ENST00000484918	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		11.29	□□□□□ -0.6
MRPL23-209	ENST00000484918	TET3	O43151	1660 aa		11.29	□□□□□ -0.6
MRPL23-209	ENST00000484918	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		11.28	□□□□□ -0.6
MRPL23-209	ENST00000484918	CAPN15	O75808	1086 aa		11.28	□□□□□ -0.6
MRPL23-209	ENST00000484918	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
MRPL23-209	ENST00000484918	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
MRPL23-209	ENST00000484918	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
MRPL23-209	ENST00000484918	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.6
MRPL23-209	ENST00000484918	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		11.27	□□□□□ -0.61
MRPL23-209	ENST00000484918	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		11.27	□□□□□ -0.61
MRPL23-209	ENST00000484918	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		11.26	□□□□□ -0.61
MRPL23-209	ENST00000484918	PRELP	P51888	382 aa		11.26	□□□□□ -0.61
MRPL23-209	ENST00000484918	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
MRPL23-209	ENST00000484918	BRINP3	Q76B58	766 aa		11.25	□□□□□ -0.61

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