RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa31.63■■■□□ 2.65
ACTB-212ENST00000484841 FAM135AQ9P2D6 1515 aa31.62■■■□□ 2.65
ACTB-212ENST00000484841 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
ACTB-212ENST00000484841 KDM5DQ9BY66 1539 aa31.61■■■□□ 2.65
ACTB-212ENST00000484841 MAST1Q9Y2H9 1570 aa31.59■■■□□ 2.65
ACTB-212ENST00000484841 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa31.56■■■□□ 2.64
ACTB-212ENST00000484841 PKD2Q13563 968 aa31.55■■■□□ 2.64
ACTB-212ENST00000484841 PLA2R1Q13018 1463 aa31.54■■■□□ 2.64
ACTB-212ENST00000484841 PZPP20742 1482 aa31.52■■■□□ 2.64
ACTB-212ENST00000484841 TNRQ92752 1358 aa31.52■■■□□ 2.64
ACTB-212ENST00000484841 A2ML1A8K2U0 1454 aa31.52■■■□□ 2.64
ACTB-212ENST00000484841 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP31.5■■■□□ 2.63
ACTB-212ENST00000484841 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
ACTB-212ENST00000484841 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
ACTB-212ENST00000484841 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP31.46■■■□□ 2.63
ACTB-212ENST00000484841 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.46■■■□□ 2.63
ACTB-212ENST00000484841 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.63
ACTB-212ENST00000484841 LTBP4Q8N2S1 1624 aa31.44■■■□□ 2.62
ACTB-212ENST00000484841 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
ACTB-212ENST00000484841 DUOX2Q9NRD8 1548 aa31.43■■■□□ 2.62
ACTB-212ENST00000484841 CROCC2H7BZ55 1655 aa31.41■■■□□ 2.62
ACTB-212ENST00000484841 IQSEC2Q5JU85 1478 aa31.4■■■□□ 2.62
ACTB-212ENST00000484841 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
ACTB-212ENST00000484841 NLRP1Q9C000 1473 aa31.38■■■□□ 2.61
ACTB-212ENST00000484841 SHANK2Q9UPX8 1470 aa31.38■■■□□ 2.61
ACTB-212ENST00000484841 ABCC3O15438 1527 aa31.38■■■□□ 2.61
ACTB-212ENST00000484841 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
ACTB-212ENST00000484841 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
ACTB-212ENST00000484841 ABCC5O15440 1437 aa31.35■■■□□ 2.61
ACTB-212ENST00000484841 FGD6Q6ZV73 1430 aa31.35■■■□□ 2.61
ACTB-212ENST00000484841 KIF15Q9NS87 1388 aa31.35■■■□□ 2.61
ACTB-212ENST00000484841 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa31.35■■■□□ 2.61
ACTB-212ENST00000484841 CEP152O94986 1710 aa31.35■■■□□ 2.61
ACTB-212ENST00000484841 DAPK1P53355 1430 aa31.33■■■□□ 2.61
ACTB-212ENST00000484841 ANKLE2Q86XL3 938 aa31.33■■■□□ 2.61
ACTB-212ENST00000484841 UGGT1Q9NYU2 1555 aa31.33■■■□□ 2.61
ACTB-212ENST00000484841 ERBINQ96RT1 1412 aa31.31■■■□□ 2.6
ACTB-212ENST00000484841 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP31.3■■■□□ 2.6
ACTB-212ENST00000484841 MROH1Q8NDA8 1641 aa31.3■■■□□ 2.6
ACTB-212ENST00000484841 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.3■■■□□ 2.64e-28■■□□□ 12.2
ACTB-212ENST00000484841 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa31.27■■■□□ 2.6
ACTB-212ENST00000484841 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa31.27■■■□□ 2.6
ACTB-212ENST00000484841 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP31.26■■■□□ 2.592e-37■□□□□ 8.4
ACTB-212ENST00000484841 CHIC2Q9UKJ5 165 aa31.25■■■□□ 2.59
ACTB-212ENST00000484841 KANK1Q14678 1352 aa31.25■■■□□ 2.59
ACTB-212ENST00000484841 ERVK-7P63135 1459 aa31.25■■■□□ 2.59
ACTB-212ENST00000484841 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP31.23■■■□□ 2.59
ACTB-212ENST00000484841 NEURL4Q96JN8 1562 aa31.22■■■□□ 2.59
ACTB-212ENST00000484841 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
ACTB-212ENST00000484841 UBAP1LF5GYI3 381 aa31.2■■■□□ 2.59
ACTB-212ENST00000484841 DEPDC5O75140 1603 aa31.2■■■□□ 2.58
ACTB-212ENST00000484841 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP31.17■■■□□ 2.58
ACTB-212ENST00000484841 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa31.15■■■□□ 2.58
ACTB-212ENST00000484841 CPS1P31327 1500 aa31.15■■■□□ 2.58
ACTB-212ENST00000484841 IQGAP1P46940 1657 aa31.13■■■□□ 2.57
ACTB-212ENST00000484841 MED14O60244 1454 aa31.13■■■□□ 2.57
ACTB-212ENST00000484841 UBR1Q8IWV7 1749 aa31.12■■■□□ 2.57
ACTB-212ENST00000484841 STAG3Q9UJ98 1225 aa31.09■■■□□ 2.57
ACTB-212ENST00000484841 ADGRL2O95490 1459 aa31.07■■■□□ 2.56
ACTB-212ENST00000484841 DISP3Q9P2K9 1392 aa31.05■■■□□ 2.56
ACTB-212ENST00000484841 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
ACTB-212ENST00000484841 TOM1O60784 492 aa31.04■■■□□ 2.56
ACTB-212ENST00000484841 EID1Q9Y6B2 187 aa31.04■■■□□ 2.56
ACTB-212ENST00000484841 VWDEQ8N2E2 1590 aa31.04■■■□□ 2.56
ACTB-212ENST00000484841 LMTK2Q8IWU2 1503 aa31.03■■■□□ 2.56
ACTB-212ENST00000484841 TXNDC2Q86VQ3 553 aa31.02■■■□□ 2.56
ACTB-212ENST00000484841 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.56
ACTB-212ENST00000484841 PIK3C2BO00750 1634 aa31.01■■■□□ 2.55
ACTB-212ENST00000484841 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.99■■■□□ 2.55
ACTB-212ENST00000484841 PIP4K2BP78356 416 aa30.97■■■□□ 2.55
ACTB-212ENST00000484841 SLIT1O75093 1534 aa30.97■■■□□ 2.55
ACTB-212ENST00000484841 EFCAB6Q5THR3 1501 aa30.95■■■□□ 2.55
ACTB-212ENST00000484841 ARHGAP23Q9P227 1491 aa30.95■■■□□ 2.54
ACTB-212ENST00000484841 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
ACTB-212ENST00000484841 LTKP29376 864 aa30.92■■■□□ 2.54
ACTB-212ENST00000484841 IDI1Q13907 227 aa30.92■■■□□ 2.54
ACTB-212ENST00000484841 TMEM2Q9UHN6 1383 aa30.91■■■□□ 2.54
ACTB-212ENST00000484841 SYNMO15061 1565 aa30.9■■■□□ 2.54
ACTB-212ENST00000484841 STRCP1A6NGW2 1772 aa30.89■■■□□ 2.54
ACTB-212ENST00000484841 SLC52A1Q9NWF4 448 aa30.88■■■□□ 2.53
ACTB-212ENST00000484841 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
ACTB-212ENST00000484841 NOS1P29475 1434 aa30.86■■■□□ 2.53
ACTB-212ENST00000484841 TET3O43151 1660 aa30.85■■■□□ 2.53
ACTB-212ENST00000484841 ITGAEP38570 1179 aa30.85■■■□□ 2.53
ACTB-212ENST00000484841 LRRC7Q96NW7 1537 aa30.84■■■□□ 2.53
ACTB-212ENST00000484841 ROCK1Q13464 1354 aa30.83■■■□□ 2.53
ACTB-212ENST00000484841 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
ACTB-212ENST00000484841 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.82■■■□□ 2.52
ACTB-212ENST00000484841 ADGRB3O60242 1522 aa30.82■■■□□ 2.52
ACTB-212ENST00000484841 UNC13BO14795 1591 aa30.81■■■□□ 2.52
ACTB-212ENST00000484841 HSPA1LP34931 641 aa30.8■■■□□ 2.52
ACTB-212ENST00000484841 BCANQ96GW7 911 aa30.8■■■□□ 2.52
ACTB-212ENST00000484841 HDGFP51858 240 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.51
ACTB-212ENST00000484841 ILDR2Q71H61 639 aa30.73■■■□□ 2.51
ACTB-212ENST00000484841 MYO5BQ9ULV0 1848 aa30.71■■■□□ 2.51
ACTB-212ENST00000484841 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
ACTB-212ENST00000484841 CHGAP10645 457 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
ACTB-212ENST00000484841 SLC26A8Q96RN1 970 aa30.71■■■□□ 2.51
ACTB-212ENST00000484841 IQGAP3Q86VI3 1631 aa30.7■■■□□ 2.51
ACTB-212ENST00000484841 E9PCH4 1651 aa30.7■■■□□ 2.5
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