RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 KIF3BO15066 747 aa18.86■□□□□ 0.61
RABGEF1-207ENST00000484547 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
RABGEF1-207ENST00000484547 CCDC141Q6ZP82 1450 aa18.85■□□□□ 0.61
RABGEF1-207ENST00000484547 TNRQ92752 1358 aa18.85■□□□□ 0.61
RABGEF1-207ENST00000484547 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa18.84■□□□□ 0.61
RABGEF1-207ENST00000484547 KDM5DQ9BY66 1539 aa18.84■□□□□ 0.61
RABGEF1-207ENST00000484547 NEURL4Q96JN8 1562 aa18.83■□□□□ 0.61
RABGEF1-207ENST00000484547 PZPP20742 1482 aa18.82■□□□□ 0.6
RABGEF1-207ENST00000484547 NCOA2Q15596 1464 aa18.82■□□□□ 0.6
RABGEF1-207ENST00000484547 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
RABGEF1-207ENST00000484547 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa18.8■□□□□ 0.6
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM135AQ9P2D6 1515 aa18.8■□□□□ 0.6
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RABGEF1-207ENST00000484547 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP18.77■□□□□ 0.6
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RABGEF1-207ENST00000484547 UGGT1Q9NYU2 1555 aa18.75■□□□□ 0.59
RABGEF1-207ENST00000484547 TOM1O60784 492 aa18.74■□□□□ 0.59
RABGEF1-207ENST00000484547 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
RABGEF1-207ENST00000484547 NLRP1Q9C000 1473 aa18.74■□□□□ 0.59
RABGEF1-207ENST00000484547 VWDEQ8N2E2 1590 aa18.74■□□□□ 0.59
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RABGEF1-207ENST00000484547 TSPY10P0CW01 314 aa18.73■□□□□ 0.59
RABGEF1-207ENST00000484547 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
RABGEF1-207ENST00000484547 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
RABGEF1-207ENST00000484547 DEPDC5O75140 1603 aa18.71■□□□□ 0.59
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RABGEF1-207ENST00000484547 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
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RABGEF1-207ENST00000484547 ABCC3O15438 1527 aa18.69■□□□□ 0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 STRCP1A6NGW2 1772 aa18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 MAST1Q9Y2H9 1570 aa18.66■□□□□ 0.58
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RABGEF1-207ENST00000484547 ALKQ9UM73 1620 aa18.66■□□□□ 0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 CEP152O94986 1710 aa18.66■□□□□ 0.58
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RABGEF1-207ENST00000484547 ERVK-7P63135 1459 aa18.64■□□□□ 0.57
RABGEF1-207ENST00000484547 MROH1Q8NDA8 1641 aa18.64■□□□□ 0.57
RABGEF1-207ENST00000484547 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
RABGEF1-207ENST00000484547 VPS8Q8N3P4 1428 aa18.61■□□□□ 0.57
RABGEF1-207ENST00000484547 UBR1Q8IWV7 1749 aa18.61■□□□□ 0.57
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RABGEF1-207ENST00000484547 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
RABGEF1-207ENST00000484547 MYOM3Q5VTT5 1437 aa18.58■□□□□ 0.56
RABGEF1-207ENST00000484547 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
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RABGEF1-207ENST00000484547 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
RABGEF1-207ENST00000484547 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1-207ENST00000484547 MAP3K1Q13233 1512 aa18.53■□□□□ 0.56
RABGEF1-207ENST00000484547 LTKP29376 864 aa18.53■□□□□ 0.56
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RABGEF1-207ENST00000484547 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
RABGEF1-207ENST00000484547 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
RABGEF1-207ENST00000484547 KIF15Q9NS87 1388 aa18.52■□□□□ 0.56
RABGEF1-207ENST00000484547 ARHGAP23Q9P227 1491 aa18.52■□□□□ 0.55
RABGEF1-207ENST00000484547 TXNDC2Q86VQ3 553 aa18.51■□□□□ 0.55
RABGEF1-207ENST00000484547 SLIT1O75093 1534 aa18.51■□□□□ 0.55
RABGEF1-207ENST00000484547 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa18.5■□□□□ 0.55
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RABGEF1-207ENST00000484547 PIK3C2BO00750 1634 aa18.5■□□□□ 0.55
RABGEF1-207ENST00000484547 ABCC5O15440 1437 aa18.48■□□□□ 0.55
RABGEF1-207ENST00000484547 ERBINQ96RT1 1412 aa18.48■□□□□ 0.55
RABGEF1-207ENST00000484547 EID1Q9Y6B2 187 aa18.48■□□□□ 0.55
RABGEF1-207ENST00000484547 PTPN23Q9H3S7 1636 aa18.48■□□□□ 0.55
RABGEF1-207ENST00000484547 STAG3Q9UJ98 1225 aa18.45■□□□□ 0.54
RABGEF1-207ENST00000484547 KANK1Q14678 1352 aa18.44■□□□□ 0.54
RABGEF1-207ENST00000484547 TMEM2Q9UHN6 1383 aa18.44■□□□□ 0.54
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RABGEF1-207ENST00000484547 EFCAB6Q5THR3 1501 aa18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1-207ENST00000484547 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
RABGEF1-207ENST00000484547 CHIC2Q9UKJ5 165 aa18.4■□□□□ 0.54
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RABGEF1-207ENST00000484547 TMEM94Q12767 1356 aa18.39■□□□□ 0.53
RABGEF1-207ENST00000484547 APLP2Q06481 763 aa18.38■□□□□ 0.53
RABGEF1-207ENST00000484547 FGD6Q6ZV73 1430 aa18.38■□□□□ 0.53
RABGEF1-207ENST00000484547 LMTK2Q8IWU2 1503 aa18.38■□□□□ 0.53
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RABGEF1-207ENST00000484547 SLC26A8Q96RN1 970 aa18.37■□□□□ 0.53
RABGEF1-207ENST00000484547 KCNA6P17658 529 aa18.36■□□□□ 0.53
RABGEF1-207ENST00000484547 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
RABGEF1-207ENST00000484547 TET3O43151 1660 aa18.36■□□□□ 0.53
RABGEF1-207ENST00000484547 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa18.36■□□□□ 0.53
RABGEF1-207ENST00000484547 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
RABGEF1-207ENST00000484547 ADGRB3O60242 1522 aa18.35■□□□□ 0.53
RABGEF1-207ENST00000484547 NOS1P29475 1434 aa18.33■□□□□ 0.53
RABGEF1-207ENST00000484547 MYO5BQ9ULV0 1848 aa18.32■□□□□ 0.52
RABGEF1-207ENST00000484547 BCANQ96GW7 911 aa18.32■□□□□ 0.52
RABGEF1-207ENST00000484547 NWD1Q149M9 1564 aa18.31■□□□□ 0.52
RABGEF1-207ENST00000484547 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
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