RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483873.6

GTF3C4-202, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GTF3C4, Length 1,417 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4-202ENST00000483873 CNTLNQ9NXG0 1405 aa40.63■■■■■ 4.09
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GTF3C4-202ENST00000483873 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.61■■■■■ 4.09
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GTF3C4-202ENST00000483873 MROH1Q8NDA8 1641 aa40.55■■■■■ 4.08
GTF3C4-202ENST00000483873 ITGAEP38570 1179 aa40.53■■■■■ 4.08
GTF3C4-202ENST00000483873 PPP6R1Q9UPN7 881 aa40.51■■■■■ 4.08
GTF3C4-202ENST00000483873 KDM5DQ9BY66 1539 aa40.51■■■■■ 4.08
GTF3C4-202ENST00000483873 ZMYM3Q14202 1370 aa40.5■■■■■ 4.07
GTF3C4-202ENST00000483873 FAM135AQ9P2D6 1515 aa40.48■■■■■ 4.07
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GTF3C4-202ENST00000483873 PREX1Q8TCU6 1659 aa40.45■■■■■ 4.07
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GTF3C4-202ENST00000483873 CEP152O94986 1710 aa40.44■■■■■ 4.06
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GTF3C4-202ENST00000483873 ROCK1Q13464 1354 aa40.41■■■■■ 4.06
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GTF3C4-202ENST00000483873 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa40.32■■■■■ 4.04
GTF3C4-202ENST00000483873 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.31■■■■■ 4.04
GTF3C4-202ENST00000483873 PZPP20742 1482 aa40.3■■■■■ 4.04
GTF3C4-202ENST00000483873 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa40.28■■■■■ 4.04
GTF3C4-202ENST00000483873 VWDEQ8N2E2 1590 aa40.26■■■■■ 4.04
GTF3C4-202ENST00000483873 MYO3AQ8NEV4 1616 aa40.24■■■■■ 4.03
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GTF3C4-202ENST00000483873 LMTK2Q8IWU2 1503 aa40.16■■■■■ 4.02
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP40.15■■■■■ 4.02
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GTF3C4-202ENST00000483873 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa40.11■■■■■ 4.01
GTF3C4-202ENST00000483873 ERVK-7P63135 1459 aa40.1■■■■■ 4.01
GTF3C4-202ENST00000483873 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
GTF3C4-202ENST00000483873 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa40.09■■■■■ 4.01
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GTF3C4-202ENST00000483873 NUP155O75694 1391 aa39.96■■■■□ 3.99
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GTF3C4-202ENST00000483873 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP39.7■■■■□ 3.95
GTF3C4-202ENST00000483873 SETD5Q9C0A6 1442 aa39.7■■■■□ 3.95
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GTF3C4-202ENST00000483873 NEURL4Q96JN8 1562 aa39.65■■■■□ 3.94
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GTF3C4-202ENST00000483873 DMRT2Q9Y5R5 561 aa39.64■■■■□ 3.94
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GTF3C4-202ENST00000483873 MED14O60244 1454 aa39.48■■■■□ 3.91
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GTF3C4-202ENST00000483873 TXNDC2Q86VQ3 553 aa39.41■■■■□ 3.9
GTF3C4-202ENST00000483873 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP39.39■■■■□ 3.9
GTF3C4-202ENST00000483873 EID1Q9Y6B2 187 aa39.37■■■■□ 3.89
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GTF3C4-202ENST00000483873 LTBP4Q8N2S1 1624 aa39.34■■■■□ 3.89
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