RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482320.5

TNPO3-204, Transcript of transportin 3, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNPO3, Length 3,585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNPO3-204	ENST00000482320	FANCA	O15360	1455 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TNPO3-204	ENST00000482320	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TNPO3-204	ENST00000482320	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TNPO3-204	ENST00000482320	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TNPO3-204	ENST00000482320	KIF3B	O15066	747 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TNPO3-204	ENST00000482320	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	11.37	□□□□□ -0.59	1e-7	■■■■■ 31.2
TNPO3-204	ENST00000482320	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TNPO3-204	ENST00000482320	FOXD1	Q16676	465 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TNPO3-204	ENST00000482320	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TNPO3-204	ENST00000482320	ABCC5	O15440	1437 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TNPO3-204	ENST00000482320	DAPK1	P53355	1430 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TNPO3-204	ENST00000482320	PTPRK	Q15262	1439 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TNPO3-204	ENST00000482320	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
TNPO3-204	ENST00000482320	ADGRL1	O94910	1474 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TNPO3-204	ENST00000482320	KIF15	Q9NS87	1388 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TNPO3-204	ENST00000482320	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
TNPO3-204	ENST00000482320	IQGAP1	P46940	1657 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TNPO3-204	ENST00000482320	USP32	Q8NFA0	1604 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TNPO3-204	ENST00000482320	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.59
TNPO3-204	ENST00000482320	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		11.33	□□□□□ -0.59
TNPO3-204	ENST00000482320	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TNPO3-204	ENST00000482320	ATP10A	O60312	1499 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TNPO3-204	ENST00000482320	NUP155	O75694	1391 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TNPO3-204	ENST00000482320	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TNPO3-204	ENST00000482320	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TNPO3-204	ENST00000482320	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TNPO3-204	ENST00000482320	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TNPO3-204	ENST00000482320	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TNPO3-204	ENST00000482320	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
TNPO3-204	ENST00000482320	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TNPO3-204	ENST00000482320	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TNPO3-204	ENST00000482320	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TNPO3-204	ENST00000482320	PKD2	Q13563	968 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TNPO3-204	ENST00000482320	IL27	Q8NEV9	243 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TNPO3-204	ENST00000482320	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TNPO3-204	ENST00000482320	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TNPO3-204	ENST00000482320	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TNPO3-204	ENST00000482320	TSPOAP1	O95153	1857 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TNPO3-204	ENST00000482320	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TNPO3-204	ENST00000482320	USP54	Q70EL1	1684 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TNPO3-204	ENST00000482320	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TNPO3-204	ENST00000482320	HFM1	A2PYH4	1435 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TNPO3-204	ENST00000482320	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TNPO3-204	ENST00000482320	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	11.28	□□□□□ -0.6
TNPO3-204	ENST00000482320	NAIP	Q13075	1403 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TNPO3-204	ENST00000482320	NCOA1	Q15788	1441 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TNPO3-204	ENST00000482320	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TNPO3-204	ENST00000482320	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TNPO3-204	ENST00000482320	PIK3C2B	O00750	1634 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TNPO3-204	ENST00000482320	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
TNPO3-204	ENST00000482320	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TNPO3-204	ENST00000482320	KDM5C	P41229	1560 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TNPO3-204	ENST00000482320	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TNPO3-204	ENST00000482320	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TNPO3-204	ENST00000482320	MYOM1	P52179	1685 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TNPO3-204	ENST00000482320	RGL3	Q3MIN7	710 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TNPO3-204	ENST00000482320	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
TNPO3-204	ENST00000482320	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TNPO3-204	ENST00000482320	INSR	P06213	1382 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TNPO3-204	ENST00000482320	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
TNPO3-204	ENST00000482320	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
TNPO3-204	ENST00000482320	KDM6B	O15054	1643 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TNPO3-204	ENST00000482320	ROCK1	Q13464	1354 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TNPO3-204	ENST00000482320	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TNPO3-204	ENST00000482320	KANK1	Q14678	1352 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TNPO3-204	ENST00000482320	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TNPO3-204	ENST00000482320	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TNPO3-204	ENST00000482320	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TNPO3-204	ENST00000482320	TONSL	Q96HA7	1378 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TNPO3-204	ENST00000482320	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TNPO3-204	ENST00000482320	SYNM	O15061	1565 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TNPO3-204	ENST00000482320	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
TNPO3-204	ENST00000482320	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TNPO3-204	ENST00000482320	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TNPO3-204	ENST00000482320	NEO1	Q92859	1461 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TNPO3-204	ENST00000482320	ANP32C	O43423	234 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TNPO3-204	ENST00000482320	RERE	Q9P2R6	1566 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TNPO3-204	ENST00000482320	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TNPO3-204	ENST00000482320	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TNPO3-204	ENST00000482320	DIP2B	Q9P265	1576 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TNPO3-204	ENST00000482320	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TNPO3-204	ENST00000482320	ABCC1	P33527	1531 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TNPO3-204	ENST00000482320	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TNPO3-204	ENST00000482320	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TNPO3-204	ENST00000482320	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TNPO3-204	ENST00000482320	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TNPO3-204	ENST00000482320	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TNPO3-204	ENST00000482320	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TNPO3-204	ENST00000482320	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TNPO3-204	ENST00000482320	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TNPO3-204	ENST00000482320	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TNPO3-204	ENST00000482320	A2M	P01023	1474 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TNPO3-204	ENST00000482320	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TNPO3-204	ENST00000482320	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TNPO3-204	ENST00000482320	ATP7A	Q04656	1500 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TNPO3-204	ENST00000482320	ARX	Q96QS3	562 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TNPO3-204	ENST00000482320	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TNPO3-204	ENST00000482320	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TNPO3-204	ENST00000482320	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TNPO3-204	ENST00000482320	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63

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