RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482015.5

UPP1-211, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-211ENST00000482015 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
UPP1-211ENST00000482015 NCOA1Q15788 1441 aa29.23■■■□□ 2.27
UPP1-211ENST00000482015 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
UPP1-211ENST00000482015 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.22■■■□□ 2.27
UPP1-211ENST00000482015 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.22■■■□□ 2.27
UPP1-211ENST00000482015 DAPK1P53355 1430 aa29.21■■■□□ 2.27
UPP1-211ENST00000482015 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.21■■■□□ 2.27
UPP1-211ENST00000482015 CERKQ8TCT0 537 aa29.21■■■□□ 2.27
UPP1-211ENST00000482015 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.21■■■□□ 2.27
UPP1-211ENST00000482015 PTPRTO14522 1441 aa29.2■■■□□ 2.26
UPP1-211ENST00000482015 PZPP20742 1482 aa29.19■■■□□ 2.26
UPP1-211ENST00000482015 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.19■■■□□ 2.26
UPP1-211ENST00000482015 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
UPP1-211ENST00000482015 KIF15Q9NS87 1388 aa29.18■■■□□ 2.26
UPP1-211ENST00000482015 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.18■■■□□ 2.26
UPP1-211ENST00000482015 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.18■■■□□ 2.26
UPP1-211ENST00000482015 TNRQ92752 1358 aa29.17■■■□□ 2.26
UPP1-211ENST00000482015 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.17■■■□□ 2.26
UPP1-211ENST00000482015 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
UPP1-211ENST00000482015 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
UPP1-211ENST00000482015 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.15■■■□□ 2.26
UPP1-211ENST00000482015 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
UPP1-211ENST00000482015 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
UPP1-211ENST00000482015 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.13■■■□□ 2.25
UPP1-211ENST00000482015 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
UPP1-211ENST00000482015 ABCC3O15438 1527 aa29.13■■■□□ 2.25
UPP1-211ENST00000482015 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.11■■■□□ 2.25
UPP1-211ENST00000482015 PLA2R1Q13018 1463 aa29.1■■■□□ 2.25
UPP1-211ENST00000482015 PKD2Q13563 968 aa29.09■■■□□ 2.25
UPP1-211ENST00000482015 ERBINQ96RT1 1412 aa29.09■■■□□ 2.25
UPP1-211ENST00000482015 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.08■■■□□ 2.25
UPP1-211ENST00000482015 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.06■■■□□ 2.24
UPP1-211ENST00000482015 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
UPP1-211ENST00000482015 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
UPP1-211ENST00000482015 NLRP1Q9C000 1473 aa29■■■□□ 2.23
UPP1-211ENST00000482015 CEP152O94986 1710 aa29■■■□□ 2.23
UPP1-211ENST00000482015 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
UPP1-211ENST00000482015 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.98■■■□□ 2.23
UPP1-211ENST00000482015 ERVK-7P63135 1459 aa28.98■■■□□ 2.23
UPP1-211ENST00000482015 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.98■■■□□ 2.23
UPP1-211ENST00000482015 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
UPP1-211ENST00000482015 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.98■■■□□ 2.23
UPP1-211ENST00000482015 ADGRL2O95490 1459 aa28.97■■■□□ 2.23
UPP1-211ENST00000482015 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
UPP1-211ENST00000482015 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.96■■■□□ 2.23
UPP1-211ENST00000482015 KANK1Q14678 1352 aa28.94■■■□□ 2.22
UPP1-211ENST00000482015 DEPDC5O75140 1603 aa28.93■■■□□ 2.22
UPP1-211ENST00000482015 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.92■■■□□ 2.22
UPP1-211ENST00000482015 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.92■■■□□ 2.22
UPP1-211ENST00000482015 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.88■■■□□ 2.21
UPP1-211ENST00000482015 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.87■■■□□ 2.21
UPP1-211ENST00000482015 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
UPP1-211ENST00000482015 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.84■■■□□ 2.21
UPP1-211ENST00000482015 ITGAEP38570 1179 aa28.84■■■□□ 2.21
UPP1-211ENST00000482015 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.84■■■□□ 2.21
UPP1-211ENST00000482015 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
UPP1-211ENST00000482015 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
UPP1-211ENST00000482015 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.78■■■□□ 2.2
UPP1-211ENST00000482015 MED14O60244 1454 aa28.78■■■□□ 2.2
UPP1-211ENST00000482015 ROCK1Q13464 1354 aa28.77■■■□□ 2.2
UPP1-211ENST00000482015 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.76■■■□□ 2.19
UPP1-211ENST00000482015 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.74■■■□□ 2.19
UPP1-211ENST00000482015 IDI1Q13907 227 aa28.74■■■□□ 2.19
UPP1-211ENST00000482015 LTKP29376 864 aa28.72■■■□□ 2.19
UPP1-211ENST00000482015 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.72■■■□□ 2.19
UPP1-211ENST00000482015 NOS1P29475 1434 aa28.71■■■□□ 2.19
UPP1-211ENST00000482015 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.71■■■□□ 2.19
UPP1-211ENST00000482015 PIK3C2BO00750 1634 aa28.7■■■□□ 2.19
UPP1-211ENST00000482015 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.69■■■□□ 2.18
UPP1-211ENST00000482015 SYNMO15061 1565 aa28.69■■■□□ 2.18
UPP1-211ENST00000482015 IQGAP1P46940 1657 aa28.68■■■□□ 2.18
UPP1-211ENST00000482015 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
UPP1-211ENST00000482015 UBAP1LF5GYI3 381 aa28.68■■■□□ 2.18
UPP1-211ENST00000482015 SLIT1O75093 1534 aa28.68■■■□□ 2.18
UPP1-211ENST00000482015 EID1Q9Y6B2 187 aa28.66■■■□□ 2.18
UPP1-211ENST00000482015 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.65■■■□□ 2.18
UPP1-211ENST00000482015 UNC13BO14795 1591 aa28.65■■■□□ 2.18
UPP1-211ENST00000482015 CPS1P31327 1500 aa28.64■■■□□ 2.18
UPP1-211ENST00000482015 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.64■■■□□ 2.18
UPP1-211ENST00000482015 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.17
UPP1-211ENST00000482015 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
UPP1-211ENST00000482015 TET3O43151 1660 aa28.61■■■□□ 2.17
UPP1-211ENST00000482015 NUP155O75694 1391 aa28.6■■■□□ 2.17
UPP1-211ENST00000482015 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
UPP1-211ENST00000482015 ADGRB3O60242 1522 aa28.55■■■□□ 2.16
UPP1-211ENST00000482015 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.54■■■□□ 2.16
UPP1-211ENST00000482015 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.54■■■□□ 2.16
UPP1-211ENST00000482015 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.52■■■□□ 2.16
UPP1-211ENST00000482015 E9PCH4 1651 aa28.51■■■□□ 2.16
UPP1-211ENST00000482015 TOM1O60784 492 aa28.5■■■□□ 2.15
UPP1-211ENST00000482015 PIP4K2BP78356 416 aa28.5■■■□□ 2.15
UPP1-211ENST00000482015 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.49■■■□□ 2.15
UPP1-211ENST00000482015 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
UPP1-211ENST00000482015 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
UPP1-211ENST00000482015 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.48■■■□□ 2.15
UPP1-211ENST00000482015 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
UPP1-211ENST00000482015 NAIPQ13075 1403 aa28.45■■■□□ 2.15
UPP1-211ENST00000482015 BCANQ96GW7 911 aa28.45■■■□□ 2.14
UPP1-211ENST00000482015 ZFYVE9O95405 1425 aa28.43■■■□□ 2.14
UPP1-211ENST00000482015 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms