RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479433.5

FBXO18-211, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

TSL 3

Gene FBXO18, Length 527 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18-211ENST00000479433 GGT6Q6P531 493 aa10.26□□□□□ -0.77
FBXO18-211ENST00000479433 PPP6R1Q9UPN7 881 aa10.26□□□□□ -0.77
FBXO18-211ENST00000479433 KDM5DQ9BY66 1539 aa10.26□□□□□ -0.77
FBXO18-211ENST00000479433 ABCC5O15440 1437 aa10.25□□□□□ -0.77
FBXO18-211ENST00000479433 ABCC3O15438 1527 aa10.25□□□□□ -0.77
FBXO18-211ENST00000479433 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
FBXO18-211ENST00000479433 NEURL4Q96JN8 1562 aa10.25□□□□□ -0.77
FBXO18-211ENST00000479433 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
FBXO18-211ENST00000479433 RSPH4AQ5TD94 716 aa10.24□□□□□ -0.77
FBXO18-211ENST00000479433 A2ML1A8K2U0 1454 aa10.23□□□□□ -0.77
FBXO18-211ENST00000479433 KIF3BO15066 747 aa10.23□□□□□ -0.77
FBXO18-211ENST00000479433 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa10.23□□□□□ -0.77
FBXO18-211ENST00000479433 SHANK2Q9UPX8 1470 aa10.23□□□□□ -0.77
FBXO18-211ENST00000479433 FGD6Q6ZV73 1430 aa10.22□□□□□ -0.77
FBXO18-211ENST00000479433 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa10.22□□□□□ -0.77
FBXO18-211ENST00000479433 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
FBXO18-211ENST00000479433 CROCC2H7BZ55 1655 aa10.22□□□□□ -0.77
FBXO18-211ENST00000479433 TNRQ92752 1358 aa10.21□□□□□ -0.78
FBXO18-211ENST00000479433 PTPN23Q9H3S7 1636 aa10.21□□□□□ -0.78
FBXO18-211ENST00000479433 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
FBXO18-211ENST00000479433 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
FBXO18-211ENST00000479433 DMRT2Q9Y5R5 561 aa10.2□□□□□ -0.78
FBXO18-211ENST00000479433 DEPDC5O75140 1603 aa10.19□□□□□ -0.78
FBXO18-211ENST00000479433 VWDEQ8N2E2 1590 aa10.19□□□□□ -0.78
FBXO18-211ENST00000479433 ERVK-7P63135 1459 aa10.19□□□□□ -0.78
FBXO18-211ENST00000479433 DAPK1P53355 1430 aa10.19□□□□□ -0.78
FBXO18-211ENST00000479433 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
FBXO18-211ENST00000479433 DUOX2Q9NRD8 1548 aa10.18□□□□□ -0.78
FBXO18-211ENST00000479433 IQSEC2Q5JU85 1478 aa10.18□□□□□ -0.78
FBXO18-211ENST00000479433 KIF15Q9NS87 1388 aa10.18□□□□□ -0.78
FBXO18-211ENST00000479433 NLRP1Q9C000 1473 aa10.17□□□□□ -0.78
FBXO18-211ENST00000479433 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
FBXO18-211ENST00000479433 ALKQ9UM73 1620 aa10.17□□□□□ -0.78
FBXO18-211ENST00000479433 MED14O60244 1454 aa10.17□□□□□ -0.78
FBXO18-211ENST00000479433 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa10.16□□□□□ -0.78
FBXO18-211ENST00000479433 CEP152O94986 1710 aa10.16□□□□□ -0.78
FBXO18-211ENST00000479433 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa10.16□□□□□ -0.78
FBXO18-211ENST00000479433 TSPY4P0CV99 314 aa10.16□□□□□ -0.78
FBXO18-211ENST00000479433 TSPY10P0CW01 314 aa10.16□□□□□ -0.78
FBXO18-211ENST00000479433 PKD2Q13563 968 aa10.16□□□□□ -0.78
FBXO18-211ENST00000479433 ADGRL2O95490 1459 aa10.16□□□□□ -0.78
FBXO18-211ENST00000479433 ERBINQ96RT1 1412 aa10.16□□□□□ -0.78
FBXO18-211ENST00000479433 LMTK2Q8IWU2 1503 aa10.15□□□□□ -0.78
FBXO18-211ENST00000479433 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP10.14□□□□□ -0.79
FBXO18-211ENST00000479433 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
FBXO18-211ENST00000479433 ARHGAP23Q9P227 1491 aa10.14□□□□□ -0.79
FBXO18-211ENST00000479433 UGGT1Q9NYU2 1555 aa10.13□□□□□ -0.79
FBXO18-211ENST00000479433 UBR1Q8IWV7 1749 aa10.13□□□□□ -0.79
FBXO18-211ENST00000479433 STRCP1A6NGW2 1772 aa10.12□□□□□ -0.79
FBXO18-211ENST00000479433 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa10.12□□□□□ -0.79
FBXO18-211ENST00000479433 SYNMO15061 1565 aa10.12□□□□□ -0.79
FBXO18-211ENST00000479433 NOS1P29475 1434 aa10.11□□□□□ -0.79
FBXO18-211ENST00000479433 SLIT1O75093 1534 aa10.11□□□□□ -0.79
FBXO18-211ENST00000479433 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
FBXO18-211ENST00000479433 EFCAB6Q5THR3 1501 aa10.09□□□□□ -0.79
FBXO18-211ENST00000479433 LTKP29376 864 aa10.09□□□□□ -0.79
FBXO18-211ENST00000479433 CHIC2Q9UKJ5 165 aa10.08□□□□□ -0.8
FBXO18-211ENST00000479433 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa10.08□□□□□ -0.8
FBXO18-211ENST00000479433 IQGAP1P46940 1657 aa10.08□□□□□ -0.8
FBXO18-211ENST00000479433 PIK3C2BO00750 1634 aa10.07□□□□□ -0.8
FBXO18-211ENST00000479433 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
FBXO18-211ENST00000479433 CPS1P31327 1500 aa10.07□□□□□ -0.8
FBXO18-211ENST00000479433 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
FBXO18-211ENST00000479433 ANKLE2Q86XL3 938 aa10.06□□□□□ -0.8
FBXO18-211ENST00000479433 LRRC7Q96NW7 1537 aa10.06□□□□□ -0.8
FBXO18-211ENST00000479433 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa10.06□□□□□ -0.8
FBXO18-211ENST00000479433 TET3O43151 1660 aa10.06□□□□□ -0.8
FBXO18-211ENST00000479433 UNC13BO14795 1591 aa10.05□□□□□ -0.8
FBXO18-211ENST00000479433 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
FBXO18-211ENST00000479433 TMEM2Q9UHN6 1383 aa10.05□□□□□ -0.8
FBXO18-211ENST00000479433 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
FBXO18-211ENST00000479433 IDI1Q13907 227 aa10.04□□□□□ -0.8
FBXO18-211ENST00000479433 ILDR2Q71H61 639 aa10.04□□□□□ -0.8
FBXO18-211ENST00000479433 ROCK1Q13464 1354 aa10.03□□□□□ -0.8
FBXO18-211ENST00000479433 ZFYVE9O95405 1425 aa10.03□□□□□ -0.8
FBXO18-211ENST00000479433 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP10.03□□□□□ -0.8
FBXO18-211ENST00000479433 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
FBXO18-211ENST00000479433 ADGRB3O60242 1522 aa10.02□□□□□ -0.8
FBXO18-211ENST00000479433 UBAP1LF5GYI3 381 aa10.02□□□□□ -0.81
FBXO18-211ENST00000479433 APLP2Q06481 763 aa10.02□□□□□ -0.81
FBXO18-211ENST00000479433 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
FBXO18-211ENST00000479433 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa10□□□□□ -0.81
FBXO18-211ENST00000479433 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
FBXO18-211ENST00000479433 IQGAP3Q86VI3 1631 aa10□□□□□ -0.81
FBXO18-211ENST00000479433 E9PCH4 1651 aa9.99□□□□□ -0.81
FBXO18-211ENST00000479433 TXNDC2Q86VQ3 553 aa9.99□□□□□ -0.81
FBXO18-211ENST00000479433 KANK1Q14678 1352 aa9.99□□□□□ -0.81
FBXO18-211ENST00000479433 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
FBXO18-211ENST00000479433 NWD1Q149M9 1564 aa9.98□□□□□ -0.81
FBXO18-211ENST00000479433 HSPA1LP34931 641 aa9.98□□□□□ -0.81
FBXO18-211ENST00000479433 GCC2Q8IWJ2 1684 aa9.97□□□□□ -0.81
FBXO18-211ENST00000479433 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
FBXO18-211ENST00000479433 MYO5BQ9ULV0 1848 aa9.97□□□□□ -0.81
FBXO18-211ENST00000479433 DISP3Q9P2K9 1392 aa9.96□□□□□ -0.82
FBXO18-211ENST00000479433 SLC52A1Q9NWF4 448 aa9.95□□□□□ -0.82
FBXO18-211ENST00000479433 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa9.95□□□□□ -0.82
FBXO18-211ENST00000479433 NAIPQ13075 1403 aa9.94□□□□□ -0.82
FBXO18-211ENST00000479433 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
FBXO18-211ENST00000479433 RIMS2Q9UQ26 1411 aa9.93□□□□□ -0.82
FBXO18-211ENST00000479433 TMEM94Q12767 1356 aa9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.3 ms