RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478914.1

XRCC6-208, Transcript of X-ray repair cross complementing 6, human

TSL 2

Gene XRCC6, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
XRCC6-208	ENST00000478914	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		13.67	□□□□□ -0.22
XRCC6-208	ENST00000478914	PTPRK	Q15262	1439 aa		13.66	□□□□□ -0.22
XRCC6-208	ENST00000478914	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
XRCC6-208	ENST00000478914	CERK	Q8TCT0	537 aa		13.66	□□□□□ -0.22
XRCC6-208	ENST00000478914	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
XRCC6-208	ENST00000478914	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
XRCC6-208	ENST00000478914	PTPRT	O14522	1441 aa		13.64	□□□□□ -0.23
XRCC6-208	ENST00000478914	NCOA1	Q15788	1441 aa		13.64	□□□□□ -0.23
XRCC6-208	ENST00000478914	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
XRCC6-208	ENST00000478914	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		13.64	□□□□□ -0.23
XRCC6-208	ENST00000478914	PZP	P20742	1482 aa		13.61	□□□□□ -0.23
XRCC6-208	ENST00000478914	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
XRCC6-208	ENST00000478914	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		13.61	□□□□□ -0.23
XRCC6-208	ENST00000478914	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
XRCC6-208	ENST00000478914	CEP152	O94986	1710 aa		13.61	□□□□□ -0.23
XRCC6-208	ENST00000478914	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		13.61	□□□□□ -0.23
XRCC6-208	ENST00000478914	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		13.61	□□□□□ -0.23
XRCC6-208	ENST00000478914	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
XRCC6-208	ENST00000478914	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		13.6	□□□□□ -0.23
XRCC6-208	ENST00000478914	PLA2R1	Q13018	1463 aa		13.6	□□□□□ -0.23
XRCC6-208	ENST00000478914	TNR	Q92752	1358 aa		13.59	□□□□□ -0.23
XRCC6-208	ENST00000478914	PKD2	Q13563	968 aa		13.58	□□□□□ -0.24
XRCC6-208	ENST00000478914	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
XRCC6-208	ENST00000478914	DAPK1	P53355	1430 aa		13.57	□□□□□ -0.24
XRCC6-208	ENST00000478914	ABCC3	O15438	1527 aa		13.57	□□□□□ -0.24
XRCC6-208	ENST00000478914	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		13.57	□□□□□ -0.24
XRCC6-208	ENST00000478914	KIF15	Q9NS87	1388 aa		13.57	□□□□□ -0.24
XRCC6-208	ENST00000478914	ABCC5	O15440	1437 aa		13.56	□□□□□ -0.24
XRCC6-208	ENST00000478914	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
XRCC6-208	ENST00000478914	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		13.56	□□□□□ -0.24
XRCC6-208	ENST00000478914	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		13.56	□□□□□ -0.24
XRCC6-208	ENST00000478914	NLRP1	Q9C000	1473 aa		13.55	□□□□□ -0.24
XRCC6-208	ENST00000478914	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		13.54	□□□□□ -0.24
XRCC6-208	ENST00000478914	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		13.54	□□□□□ -0.24
XRCC6-208	ENST00000478914	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		13.53	□□□□□ -0.24
XRCC6-208	ENST00000478914	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		13.53	□□□□□ -0.24
XRCC6-208	ENST00000478914	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		13.53	□□□□□ -0.24
XRCC6-208	ENST00000478914	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
XRCC6-208	ENST00000478914	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		13.53	□□□□□ -0.24
XRCC6-208	ENST00000478914	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
XRCC6-208	ENST00000478914	DEPDC5	O75140	1603 aa		13.52	□□□□□ -0.25
XRCC6-208	ENST00000478914	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		13.51	□□□□□ -0.25
XRCC6-208	ENST00000478914	KANK1	Q14678	1352 aa		13.51	□□□□□ -0.25
XRCC6-208	ENST00000478914	ILDR2	Q71H61	639 aa		13.51	□□□□□ -0.25
XRCC6-208	ENST00000478914	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
XRCC6-208	ENST00000478914	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		13.51	□□□□□ -0.25
XRCC6-208	ENST00000478914	ERVK-7	P63135	1459 aa		13.5	□□□□□ -0.25
XRCC6-208	ENST00000478914	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	13.49	□□□□□ -0.25	2e-10	■□□□□ 8.3
XRCC6-208	ENST00000478914	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		13.49	□□□□□ -0.25
XRCC6-208	ENST00000478914	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	13.48	□□□□□ -0.25
XRCC6-208	ENST00000478914	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
XRCC6-208	ENST00000478914	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		13.48	□□□□□ -0.25
XRCC6-208	ENST00000478914	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		13.47	□□□□□ -0.25
XRCC6-208	ENST00000478914	ADGRL2	O95490	1459 aa		13.47	□□□□□ -0.25
XRCC6-208	ENST00000478914	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		13.47	□□□□□ -0.25
XRCC6-208	ENST00000478914	IQGAP1	P46940	1657 aa		13.47	□□□□□ -0.25
XRCC6-208	ENST00000478914	SOCS7	O14512	581 aa		13.44	□□□□□ -0.26
XRCC6-208	ENST00000478914	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
XRCC6-208	ENST00000478914	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		13.43	□□□□□ -0.26
XRCC6-208	ENST00000478914	CPS1	P31327	1500 aa		13.43	□□□□□ -0.26
XRCC6-208	ENST00000478914	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		13.43	□□□□□ -0.26
XRCC6-208	ENST00000478914	PIK3C2B	O00750	1634 aa		13.42	□□□□□ -0.26
XRCC6-208	ENST00000478914	MED14	O60244	1454 aa		13.42	□□□□□ -0.26
XRCC6-208	ENST00000478914	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
XRCC6-208	ENST00000478914	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		13.41	□□□□□ -0.26
XRCC6-208	ENST00000478914	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		13.41	□□□□□ -0.26
XRCC6-208	ENST00000478914	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		13.4	□□□□□ -0.26
XRCC6-208	ENST00000478914	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		13.4	□□□□□ -0.26
XRCC6-208	ENST00000478914	TET3	O43151	1660 aa		13.4	□□□□□ -0.26
XRCC6-208	ENST00000478914	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		13.39	□□□□□ -0.27
XRCC6-208	ENST00000478914	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
XRCC6-208	ENST00000478914	UNC13B	O14795	1591 aa		13.38	□□□□□ -0.27
XRCC6-208	ENST00000478914	SLIT1	O75093	1534 aa		13.38	□□□□□ -0.27
XRCC6-208	ENST00000478914	SYNM	O15061	1565 aa		13.37	□□□□□ -0.27
XRCC6-208	ENST00000478914	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
XRCC6-208	ENST00000478914	EID1	Q9Y6B2	187 aa		13.37	□□□□□ -0.27
XRCC6-208	ENST00000478914	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
XRCC6-208	ENST00000478914	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		13.36	□□□□□ -0.27
XRCC6-208	ENST00000478914	ROCK1	Q13464	1354 aa		13.36	□□□□□ -0.27
XRCC6-208	ENST00000478914	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		13.36	□□□□□ -0.27
XRCC6-208	ENST00000478914	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		13.35	□□□□□ -0.27
XRCC6-208	ENST00000478914	ITGAE	P38570	1179 aa		13.35	□□□□□ -0.27
XRCC6-208	ENST00000478914	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		13.35	□□□□□ -0.27
XRCC6-208	ENST00000478914	ADGRB3	O60242	1522 aa		13.34	□□□□□ -0.27
XRCC6-208	ENST00000478914	NOS1	P29475	1434 aa		13.34	□□□□□ -0.27
XRCC6-208	ENST00000478914	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
XRCC6-208	ENST00000478914	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		13.33	□□□□□ -0.28
XRCC6-208	ENST00000478914	TOM1	O60784	492 aa		13.33	□□□□□ -0.28
XRCC6-208	ENST00000478914	IDI1	Q13907	227 aa		13.33	□□□□□ -0.28
XRCC6-208	ENST00000478914	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		13.32	□□□□□ -0.28
XRCC6-208	ENST00000478914		E9PCH4	1651 aa		13.32	□□□□□ -0.28
XRCC6-208	ENST00000478914	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		13.32	□□□□□ -0.28
XRCC6-208	ENST00000478914	LTK	P29376	864 aa		13.31	□□□□□ -0.28
XRCC6-208	ENST00000478914	PIP4K2B	P78356	416 aa		13.29	□□□□□ -0.28
XRCC6-208	ENST00000478914	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		13.29	□□□□□ -0.28
XRCC6-208	ENST00000478914	NUP155	O75694	1391 aa		13.28	□□□□□ -0.28
XRCC6-208	ENST00000478914	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.28
XRCC6-208	ENST00000478914	BCAN	Q96GW7	911 aa		13.27	□□□□□ -0.29
XRCC6-208	ENST00000478914	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		13.27	□□□□□ -0.29
XRCC6-208	ENST00000478914	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29

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