RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478473.1

C9orf3-215, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 895 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-215ENST00000478473 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.48■■■■□ 3.43
C9orf3-215ENST00000478473 DAPK1P53355 1430 aa36.48■■■■□ 3.43
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C9orf3-215ENST00000478473 DUOX2Q9NRD8 1548 aa36.46■■■■□ 3.43
C9orf3-215ENST00000478473 STRCQ7RTU9 1775 aa36.43■■■■□ 3.42
C9orf3-215ENST00000478473 PZPP20742 1482 aa36.4■■■■□ 3.42
C9orf3-215ENST00000478473 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa36.39■■■■□ 3.42
C9orf3-215ENST00000478473 KIF15Q9NS87 1388 aa36.39■■■■□ 3.42
C9orf3-215ENST00000478473 DMRT2Q9Y5R5 561 aa36.38■■■■□ 3.41
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP36.38■■■■□ 3.41
C9orf3-215ENST00000478473 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.37■■■■□ 3.41
C9orf3-215ENST00000478473 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36.37■■■■□ 3.41
C9orf3-215ENST00000478473 ERBINQ96RT1 1412 aa36.36■■■■□ 3.41
C9orf3-215ENST00000478473 NCOA1Q15788 1441 aa36.34■■■■□ 3.41
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C9orf3-215ENST00000478473 ABCC3O15438 1527 aa36.32■■■■□ 3.4
C9orf3-215ENST00000478473 PTPRTO14522 1441 aa36.32■■■■□ 3.4
C9orf3-215ENST00000478473 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP36.32■■■■□ 3.4
C9orf3-215ENST00000478473 ADGRL2O95490 1459 aa36.3■■■■□ 3.4
C9orf3-215ENST00000478473 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.29■■■■□ 3.4
C9orf3-215ENST00000478473 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.29■■■■□ 3.4
C9orf3-215ENST00000478473 PLA2R1Q13018 1463 aa36.27■■■■□ 3.4
C9orf3-215ENST00000478473 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
C9orf3-215ENST00000478473 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa36.26■■■■□ 3.4
C9orf3-215ENST00000478473 A2ML1A8K2U0 1454 aa36.26■■■■□ 3.4
C9orf3-215ENST00000478473 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.4
C9orf3-215ENST00000478473 TNRQ92752 1358 aa36.26■■■■□ 3.39
C9orf3-215ENST00000478473 DEPDC5O75140 1603 aa36.23■■■■□ 3.39
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C9orf3-215ENST00000478473 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.19■■■■□ 3.38
C9orf3-215ENST00000478473 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.18■■■■□ 3.38
C9orf3-215ENST00000478473 NLRP1Q9C000 1473 aa36.18■■■■□ 3.38
C9orf3-215ENST00000478473 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.17■■■■□ 3.38
C9orf3-215ENST00000478473 FBXO41Q8TF61 875 aa36.17■■■■□ 3.38
C9orf3-215ENST00000478473 PKD2Q13563 968 aa36.16■■■■□ 3.38
C9orf3-215ENST00000478473 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.15■■■■□ 3.382e-9■■■■■ 67.4
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C9orf3-215ENST00000478473 CEP152O94986 1710 aa36.12■■■■□ 3.37
C9orf3-215ENST00000478473 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.12■■■■□ 3.37
C9orf3-215ENST00000478473 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.1■■■■□ 3.37
C9orf3-215ENST00000478473 CERKQ8TCT0 537 aa36.1■■■■□ 3.37
C9orf3-215ENST00000478473 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa36.07■■■■□ 3.36
C9orf3-215ENST00000478473 ROCK1Q13464 1354 aa36.06■■■■□ 3.36
C9orf3-215ENST00000478473 KANK1Q14678 1352 aa36.06■■■■□ 3.36
C9orf3-215ENST00000478473 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.05■■■■□ 3.36
C9orf3-215ENST00000478473 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
C9orf3-215ENST00000478473 UGGT1Q9NYU2 1555 aa36.02■■■■□ 3.36
C9orf3-215ENST00000478473 LTBP4Q8N2S1 1624 aa36.01■■■■□ 3.35
C9orf3-215ENST00000478473 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.99■■■■□ 3.351e-6■■□□□ 11.7
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C9orf3-215ENST00000478473 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.82■■■■□ 3.32
C9orf3-215ENST00000478473 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.81■■■■□ 3.32
C9orf3-215ENST00000478473 SLIT1O75093 1534 aa35.79■■■■□ 3.32
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C9orf3-215ENST00000478473 TET3O43151 1660 aa35.78■■■■□ 3.32
C9orf3-215ENST00000478473 SYNMO15061 1565 aa35.78■■■■□ 3.32
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C9orf3-215ENST00000478473 ITGAEP38570 1179 aa35.73■■■■□ 3.31
C9orf3-215ENST00000478473 SLC52A1Q9NWF4 448 aa35.73■■■■□ 3.31
C9orf3-215ENST00000478473 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.72■■■■□ 3.31
C9orf3-215ENST00000478473 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.71■■■■□ 3.31
C9orf3-215ENST00000478473 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
C9orf3-215ENST00000478473 IQGAP1P46940 1657 aa35.69■■■■□ 3.3
C9orf3-215ENST00000478473 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.68■■■■□ 3.3
C9orf3-215ENST00000478473 LTKP29376 864 aa35.66■■■■□ 3.3
C9orf3-215ENST00000478473 CPS1P31327 1500 aa35.65■■■■□ 3.3
C9orf3-215ENST00000478473 NUP155O75694 1391 aa35.63■■■■□ 3.29
C9orf3-215ENST00000478473 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.62■■■■□ 3.29
C9orf3-215ENST00000478473 ADGRB3O60242 1522 aa35.62■■■■□ 3.29
C9orf3-215ENST00000478473 NAIPQ13075 1403 aa35.6■■■■□ 3.29
C9orf3-215ENST00000478473 E9PCH4 1651 aa35.6■■■■□ 3.29
C9orf3-215ENST00000478473 STAG3Q9UJ98 1225 aa35.58■■■■□ 3.29
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C9orf3-215ENST00000478473 HFM1A2PYH4 1435 aa35.53■■■■□ 3.28
C9orf3-215ENST00000478473 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa35.5■■■■□ 3.27
C9orf3-215ENST00000478473 ZFYVE9O95405 1425 aa35.47■■■■□ 3.27
C9orf3-215ENST00000478473 STRCP1A6NGW2 1772 aa35.45■■■■□ 3.27
C9orf3-215ENST00000478473 UBAP1LF5GYI3 381 aa35.4■■■■□ 3.26
C9orf3-215ENST00000478473 LRRC7Q96NW7 1537 aa35.4■■■■□ 3.26
C9orf3-215ENST00000478473 MYO5BQ9ULV0 1848 aa35.38■■■■□ 3.25
C9orf3-215ENST00000478473 HDGFP51858 240 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
C9orf3-215ENST00000478473 RIMS2Q9UQ26 1411 aa35.36■■■■□ 3.25
C9orf3-215ENST00000478473 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa35.35■■■■□ 3.25
C9orf3-215ENST00000478473 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa35.34■■■■□ 3.25
C9orf3-215ENST00000478473 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP35.31■■■■□ 3.24
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