RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476237.5

NMD3-208, Transcript of NMD3 ribosome export adaptor, human

TSL 5

Gene NMD3, Length 685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NMD3-208	ENST00000476237	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	33.97	■■■■□ 3.03
NMD3-208	ENST00000476237	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		33.96	■■■■□ 3.03
NMD3-208	ENST00000476237	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		33.95	■■■■□ 3.03
NMD3-208	ENST00000476237	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	33.93	■■■■□ 3.02
NMD3-208	ENST00000476237	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		33.93	■■■■□ 3.02
NMD3-208	ENST00000476237	KIF15	Q9NS87	1388 aa		33.93	■■■■□ 3.02
NMD3-208	ENST00000476237	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	33.93	■■■■□ 3.02
NMD3-208	ENST00000476237	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	33.92	■■■■□ 3.02
NMD3-208	ENST00000476237	STRC	Q7RTU9	1775 aa		33.9	■■■■□ 3.02
NMD3-208	ENST00000476237	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		33.9	■■■■□ 3.02
NMD3-208	ENST00000476237	PZP	P20742	1482 aa		33.88	■■■■□ 3.01
NMD3-208	ENST00000476237	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	33.88	■■■■□ 3.01
NMD3-208	ENST00000476237	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	33.88	■■■■□ 3.01
NMD3-208	ENST00000476237	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		33.87	■■■■□ 3.01
NMD3-208	ENST00000476237	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		33.86	■■■■□ 3.01
NMD3-208	ENST00000476237	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		33.86	■■■■□ 3.01
NMD3-208	ENST00000476237	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		33.85	■■■■□ 3.01
NMD3-208	ENST00000476237	NCOA1	Q15788	1441 aa		33.84	■■■■□ 3.01
NMD3-208	ENST00000476237	ABCC3	O15438	1527 aa		33.83	■■■■□ 3.01
NMD3-208	ENST00000476237	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		33.82	■■■■□ 3.01
NMD3-208	ENST00000476237	TNR	Q92752	1358 aa		33.82	■■■■□ 3
NMD3-208	ENST00000476237	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	33.81	■■■■□ 3
NMD3-208	ENST00000476237	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	33.81	■■■■□ 3
NMD3-208	ENST00000476237	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		33.81	■■■■□ 3
NMD3-208	ENST00000476237	PTPRT	O14522	1441 aa		33.79	■■■■□ 3
NMD3-208	ENST00000476237	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	33.78	■■■■□ 3
NMD3-208	ENST00000476237	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		33.77	■■■■□ 3
NMD3-208	ENST00000476237	ADGRL2	O95490	1459 aa		33.76	■■■■□ 3
NMD3-208	ENST00000476237	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	33.76	■■■□□ 2.99
NMD3-208	ENST00000476237	PLA2R1	Q13018	1463 aa		33.73	■■■□□ 2.99
NMD3-208	ENST00000476237	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	33.73	■■■□□ 2.99
NMD3-208	ENST00000476237	FBXO41	Q8TF61	875 aa		33.72	■■■□□ 2.99
NMD3-208	ENST00000476237	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		33.71	■■■□□ 2.99
NMD3-208	ENST00000476237	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	33.7	■■■□□ 2.99
NMD3-208	ENST00000476237	PKD2	Q13563	968 aa		33.69	■■■□□ 2.98
NMD3-208	ENST00000476237	CEP152	O94986	1710 aa		33.68	■■■□□ 2.98
NMD3-208	ENST00000476237	CERK	Q8TCT0	537 aa		33.68	■■■□□ 2.98
NMD3-208	ENST00000476237	NLRP1	Q9C000	1473 aa		33.67	■■■□□ 2.98
NMD3-208	ENST00000476237	DEPDC5	O75140	1603 aa		33.67	■■■□□ 2.98
NMD3-208	ENST00000476237	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		33.66	■■■□□ 2.98
NMD3-208	ENST00000476237	ERVK-7	P63135	1459 aa		33.64	■■■□□ 2.98
NMD3-208	ENST00000476237	KANK1	Q14678	1352 aa		33.64	■■■□□ 2.98
NMD3-208	ENST00000476237	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		33.63	■■■□□ 2.97
NMD3-208	ENST00000476237	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		33.61	■■■□□ 2.97
NMD3-208	ENST00000476237	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	33.6	■■■□□ 2.97
NMD3-208	ENST00000476237	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	33.59	■■■□□ 2.97
NMD3-208	ENST00000476237	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		33.58	■■■□□ 2.97
NMD3-208	ENST00000476237	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		33.57	■■■□□ 2.96
NMD3-208	ENST00000476237	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		33.56	■■■□□ 2.96
NMD3-208	ENST00000476237	ROCK1	Q13464	1354 aa		33.56	■■■□□ 2.96
NMD3-208	ENST00000476237	ITGAE	P38570	1179 aa		33.51	■■■□□ 2.95
NMD3-208	ENST00000476237	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	33.51	■■■□□ 2.95
NMD3-208	ENST00000476237	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		33.5	■■■□□ 2.95
NMD3-208	ENST00000476237	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		33.5	■■■□□ 2.95
NMD3-208	ENST00000476237	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	33.45	■■■□□ 2.95
NMD3-208	ENST00000476237	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	33.45	■■■□□ 2.95
NMD3-208	ENST00000476237	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		33.44	■■■□□ 2.94
NMD3-208	ENST00000476237	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
NMD3-208	ENST00000476237	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		33.42	■■■□□ 2.94
NMD3-208	ENST00000476237	MED14	O60244	1454 aa		33.38	■■■□□ 2.93
NMD3-208	ENST00000476237	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		33.38	■■■□□ 2.93
NMD3-208	ENST00000476237	NOS1	P29475	1434 aa		33.37	■■■□□ 2.93
NMD3-208	ENST00000476237	UNC13B	O14795	1591 aa		33.37	■■■□□ 2.93
NMD3-208	ENST00000476237	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	33.36	■■■□□ 2.93
NMD3-208	ENST00000476237	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
NMD3-208	ENST00000476237	IDI1	Q13907	227 aa		33.34	■■■□□ 2.93
NMD3-208	ENST00000476237	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		33.32	■■■□□ 2.92
NMD3-208	ENST00000476237	SYNM	O15061	1565 aa		33.32	■■■□□ 2.92
NMD3-208	ENST00000476237	PIK3C2B	O00750	1634 aa		33.31	■■■□□ 2.92
NMD3-208	ENST00000476237	TET3	O43151	1660 aa		33.31	■■■□□ 2.92
NMD3-208	ENST00000476237	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		33.31	■■■□□ 2.92
NMD3-208	ENST00000476237	SLIT1	O75093	1534 aa		33.29	■■■□□ 2.92
NMD3-208	ENST00000476237	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		33.29	■■■□□ 2.92
NMD3-208	ENST00000476237	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		33.28	■■■□□ 2.92
NMD3-208	ENST00000476237	LTK	P29376	864 aa		33.27	■■■□□ 2.92
NMD3-208	ENST00000476237	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	33.26	■■■□□ 2.92
NMD3-208	ENST00000476237	NUP155	O75694	1391 aa		33.26	■■■□□ 2.92
NMD3-208	ENST00000476237	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		33.26	■■■□□ 2.91
NMD3-208	ENST00000476237	IQGAP1	P46940	1657 aa		33.25	■■■□□ 2.91
NMD3-208	ENST00000476237	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		33.24	■■■□□ 2.91
NMD3-208	ENST00000476237	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		33.24	■■■□□ 2.91
NMD3-208	ENST00000476237	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		33.23	■■■□□ 2.91
NMD3-208	ENST00000476237	EID1	Q9Y6B2	187 aa		33.23	■■■□□ 2.91
NMD3-208	ENST00000476237	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	33.23	■■■□□ 2.91
NMD3-208	ENST00000476237	CPS1	P31327	1500 aa		33.18	■■■□□ 2.9
NMD3-208	ENST00000476237	NAIP	Q13075	1403 aa		33.17	■■■□□ 2.9
NMD3-208	ENST00000476237	ADGRB3	O60242	1522 aa		33.17	■■■□□ 2.9
NMD3-208	ENST00000476237		E9PCH4	1651 aa		33.17	■■■□□ 2.9
NMD3-208	ENST00000476237	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		33.08	■■■□□ 2.89
NMD3-208	ENST00000476237	HFM1	A2PYH4	1435 aa		33.08	■■■□□ 2.89
NMD3-208	ENST00000476237	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		33.04	■■■□□ 2.88
NMD3-208	ENST00000476237	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
NMD3-208	ENST00000476237	ZFYVE9	O95405	1425 aa		33.02	■■■□□ 2.88
NMD3-208	ENST00000476237	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		33.01	■■■□□ 2.88
NMD3-208	ENST00000476237	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
NMD3-208	ENST00000476237	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		32.99	■■■□□ 2.87
NMD3-208	ENST00000476237	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		32.98	■■■□□ 2.87
NMD3-208	ENST00000476237	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		32.97	■■■□□ 2.87
NMD3-208	ENST00000476237	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		32.96	■■■□□ 2.87
NMD3-208	ENST00000476237	TRIM52	Q96A61	297 aa		32.95	■■■□□ 2.87

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