RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 PKD2Q13563 968 aa26.46■■□□□ 1.83
ATG4B-217ENST00000475693 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.44■■□□□ 1.82
ATG4B-217ENST00000475693 GGT6Q6P531 493 aa26.43■■□□□ 1.82
ATG4B-217ENST00000475693 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.39■■□□□ 1.82
ATG4B-217ENST00000475693 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.39■■□□□ 1.82
ATG4B-217ENST00000475693 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.38■■□□□ 1.81
ATG4B-217ENST00000475693 UNC13BO14795 1591 aa26.37■■□□□ 1.81
ATG4B-217ENST00000475693 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.33■■□□□ 1.81
ATG4B-217ENST00000475693 ATP10AO60312 1499 aa26.32■■□□□ 1.8
ATG4B-217ENST00000475693 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.32■■□□□ 1.8
ATG4B-217ENST00000475693 MLECQ14165 292 aa26.31■■□□□ 1.8
ATG4B-217ENST00000475693 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.31■■□□□ 1.8
ATG4B-217ENST00000475693 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
ATG4B-217ENST00000475693 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.31■■□□□ 1.8
ATG4B-217ENST00000475693 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.31■■□□□ 1.8
ATG4B-217ENST00000475693 DEPDC5O75140 1603 aa26.28■■□□□ 1.8
ATG4B-217ENST00000475693 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.28■■□□□ 1.8
ATG4B-217ENST00000475693 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
ATG4B-217ENST00000475693 KANK1Q14678 1352 aa26.24■■□□□ 1.79
ATG4B-217ENST00000475693 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.23■■□□□ 1.79
ATG4B-217ENST00000475693 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.23■■□□□ 1.79
ATG4B-217ENST00000475693 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
ATG4B-217ENST00000475693 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
ATG4B-217ENST00000475693 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.2■■□□□ 1.78
ATG4B-217ENST00000475693 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
ATG4B-217ENST00000475693 PLA2R1Q13018 1463 aa26.19■■□□□ 1.78
ATG4B-217ENST00000475693 CEP152O94986 1710 aa26.18■■□□□ 1.78
ATG4B-217ENST00000475693 E9PCH4 1651 aa26.16■■□□□ 1.78
ATG4B-217ENST00000475693 TONSLQ96HA7 1378 aa26.14■■□□□ 1.78
ATG4B-217ENST00000475693 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.14■■□□□ 1.78
ATG4B-217ENST00000475693 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
ATG4B-217ENST00000475693 ABCC3O15438 1527 aa26.12■■□□□ 1.77
ATG4B-217ENST00000475693 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.12■■□□□ 1.77
ATG4B-217ENST00000475693 TET3O43151 1660 aa26.11■■□□□ 1.77
ATG4B-217ENST00000475693 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
ATG4B-217ENST00000475693 REREQ9P2R6 1566 aa26.11■■□□□ 1.77
ATG4B-217ENST00000475693 AGLP35573 1532 aa26.09■■□□□ 1.77
ATG4B-217ENST00000475693 RGL3Q3MIN7 710 aa26.08■■□□□ 1.77
ATG4B-217ENST00000475693 NPATQ14207 1427 aa26.08■■□□□ 1.76
ATG4B-217ENST00000475693 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.07■■□□□ 1.76
ATG4B-217ENST00000475693 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
ATG4B-217ENST00000475693 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
ATG4B-217ENST00000475693 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.05■■□□□ 1.76
ATG4B-217ENST00000475693 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.05■■□□□ 1.76
ATG4B-217ENST00000475693 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.04■■□□□ 1.76
ATG4B-217ENST00000475693 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.01■■□□□ 1.75
ATG4B-217ENST00000475693 PTPRTO14522 1441 aa26■■□□□ 1.75
ATG4B-217ENST00000475693 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26■■□□□ 1.75
ATG4B-217ENST00000475693 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26■■□□□ 1.75
ATG4B-217ENST00000475693 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26■■□□□ 1.75
ATG4B-217ENST00000475693 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
ATG4B-217ENST00000475693 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.98■■□□□ 1.75
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
ATG4B-217ENST00000475693 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
ATG4B-217ENST00000475693 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.95■■□□□ 1.75
ATG4B-217ENST00000475693 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.95■■□□□ 1.75
ATG4B-217ENST00000475693 TRPM2O94759 1503 aa25.95■■□□□ 1.74
ATG4B-217ENST00000475693 CLTCL1P53675 1640 aa25.95■■□□□ 1.74
ATG4B-217ENST00000475693 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
ATG4B-217ENST00000475693 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
ATG4B-217ENST00000475693 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.92■■□□□ 1.74
ATG4B-217ENST00000475693 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
ATG4B-217ENST00000475693 ZMYM3Q14202 1370 aa25.91■■□□□ 1.74
ATG4B-217ENST00000475693 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.9■■□□□ 1.74
ATG4B-217ENST00000475693 NOS1P29475 1434 aa25.89■■□□□ 1.73
ATG4B-217ENST00000475693 IDI1Q13907 227 aa25.88■■□□□ 1.73
ATG4B-217ENST00000475693 SYNMO15061 1565 aa25.87■■□□□ 1.73
ATG4B-217ENST00000475693 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.86■■□□□ 1.73
ATG4B-217ENST00000475693 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
ATG4B-217ENST00000475693 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.84■■□□□ 1.73
ATG4B-217ENST00000475693 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.83■■□□□ 1.73
ATG4B-217ENST00000475693 ERVK-7P63135 1459 aa25.82■■□□□ 1.72
ATG4B-217ENST00000475693 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
ATG4B-217ENST00000475693 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
ATG4B-217ENST00000475693 MROH2AA6NES4 1674 aa25.77■■□□□ 1.72
ATG4B-217ENST00000475693 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.75■■□□□ 1.71
ATG4B-217ENST00000475693 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.75■■□□□ 1.71
ATG4B-217ENST00000475693 KIF1BO60333 1816 aa25.74■■□□□ 1.71
ATG4B-217ENST00000475693 MADDQ8WXG6 1647 aa25.73■■□□□ 1.71
ATG4B-217ENST00000475693 PIK3C2BO00750 1634 aa25.73■■□□□ 1.71
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
ATG4B-217ENST00000475693 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.71■■□□□ 1.71
ATG4B-217ENST00000475693 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.71■■□□□ 1.71
ATG4B-217ENST00000475693 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.71■■□□□ 1.71
ATG4B-217ENST00000475693 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.7■■□□□ 1.7
ATG4B-217ENST00000475693 ADGRB3O60242 1522 aa25.69■■□□□ 1.7
ATG4B-217ENST00000475693 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.69■■□□□ 1.7
ATG4B-217ENST00000475693 C3P01024 1663 aa25.68■■□□□ 1.7
ATG4B-217ENST00000475693 TNRQ92752 1358 aa25.68■■□□□ 1.7
ATG4B-217ENST00000475693 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
ATG4B-217ENST00000475693 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.67■■□□□ 1.7
ATG4B-217ENST00000475693 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.67■■□□□ 1.7
ATG4B-217ENST00000475693 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.63■■□□□ 1.69
ATG4B-217ENST00000475693 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
ATG4B-217ENST00000475693 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.63■■□□□ 1.69
ATG4B-217ENST00000475693 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
ATG4B-217ENST00000475693 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.61■■□□□ 1.69
ATG4B-217ENST00000475693 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.6■■□□□ 1.69
ATG4B-217ENST00000475693 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
ATG4B-217ENST00000475693 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.2 ms