RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 NCOA1Q15788 1441 aa29.03■■■□□ 2.24
SYF2-203ENST00000474160 NPATQ14207 1427 aa29.02■■■□□ 2.24
SYF2-203ENST00000474160 KDM5DQ9BY66 1539 aa29■■■□□ 2.23
SYF2-203ENST00000474160 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
SYF2-203ENST00000474160 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
SYF2-203ENST00000474160 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.99■■■□□ 2.23
SYF2-203ENST00000474160 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
SYF2-203ENST00000474160 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.99■■■□□ 2.23
SYF2-203ENST00000474160 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
SYF2-203ENST00000474160 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.98■■■□□ 2.23
SYF2-203ENST00000474160 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.96■■■□□ 2.23
SYF2-203ENST00000474160 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.96■■■□□ 2.23
SYF2-203ENST00000474160 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.95■■■□□ 2.23
SYF2-203ENST00000474160 ROCK1Q13464 1354 aa28.95■■■□□ 2.22
SYF2-203ENST00000474160 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.94■■■□□ 2.22
SYF2-203ENST00000474160 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
SYF2-203ENST00000474160 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
SYF2-203ENST00000474160 PTPRKQ15262 1439 aa28.89■■■□□ 2.22
SYF2-203ENST00000474160 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.88■■■□□ 2.21
SYF2-203ENST00000474160 PZPP20742 1482 aa28.88■■■□□ 2.21
SYF2-203ENST00000474160 ABCC3O15438 1527 aa28.87■■■□□ 2.21
SYF2-203ENST00000474160 DEPDC5O75140 1603 aa28.87■■■□□ 2.21
SYF2-203ENST00000474160 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.86■■■□□ 2.21
SYF2-203ENST00000474160 KANK1Q14678 1352 aa28.85■■■□□ 2.21
SYF2-203ENST00000474160 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.78■■■□□ 2.2
SYF2-203ENST00000474160 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.77■■■□□ 2.2
SYF2-203ENST00000474160 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.77■■■□□ 2.2
SYF2-203ENST00000474160 TNRQ92752 1358 aa28.75■■■□□ 2.19
SYF2-203ENST00000474160 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.74■■■□□ 2.19
SYF2-203ENST00000474160 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.74■■■□□ 2.19
SYF2-203ENST00000474160 ITGAEP38570 1179 aa28.74■■■□□ 2.19
SYF2-203ENST00000474160 HSPA2P54652 639 aa28.74■■■□□ 2.19
SYF2-203ENST00000474160 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
SYF2-203ENST00000474160 CEP152O94986 1710 aa28.73■■■□□ 2.19
SYF2-203ENST00000474160 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.72■■■□□ 2.19
SYF2-203ENST00000474160 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.71■■■□□ 2.19
SYF2-203ENST00000474160 NLRP1Q9C000 1473 aa28.71■■■□□ 2.19
SYF2-203ENST00000474160 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
SYF2-203ENST00000474160 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
SYF2-203ENST00000474160 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.69■■■□□ 2.18
SYF2-203ENST00000474160 UNC13BO14795 1591 aa28.68■■■□□ 2.18
SYF2-203ENST00000474160 ERVK-7P63135 1459 aa28.68■■■□□ 2.18
SYF2-203ENST00000474160 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.65■■■□□ 2.18
SYF2-203ENST00000474160 PLA2R1Q13018 1463 aa28.64■■■□□ 2.17
SYF2-203ENST00000474160 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
SYF2-203ENST00000474160 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.62■■■□□ 2.17
SYF2-203ENST00000474160 HFM1A2PYH4 1435 aa28.6■■■□□ 2.17
SYF2-203ENST00000474160 NAIPQ13075 1403 aa28.6■■■□□ 2.17
SYF2-203ENST00000474160 TET3O43151 1660 aa28.58■■■□□ 2.17
SYF2-203ENST00000474160 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.58■■■□□ 2.16
SYF2-203ENST00000474160 PKD2Q13563 968 aa28.57■■■□□ 2.16
SYF2-203ENST00000474160 STRCQ7RTU9 1775 aa28.57■■■□□ 2.16
SYF2-203ENST00000474160 PTPRTO14522 1441 aa28.56■■■□□ 2.16
SYF2-203ENST00000474160 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.56■■■□□ 2.16
SYF2-203ENST00000474160 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
SYF2-203ENST00000474160 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.54■■■□□ 2.16
SYF2-203ENST00000474160 NOS1P29475 1434 aa28.53■■■□□ 2.16
SYF2-203ENST00000474160 NUP155O75694 1391 aa28.53■■■□□ 2.16
SYF2-203ENST00000474160 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
SYF2-203ENST00000474160 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
SYF2-203ENST00000474160 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.48■■■□□ 2.15
SYF2-203ENST00000474160 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.15
SYF2-203ENST00000474160 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.43■■■□□ 2.14
SYF2-203ENST00000474160 SYNMO15061 1565 aa28.42■■■□□ 2.14
SYF2-203ENST00000474160 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.41■■■□□ 2.14
SYF2-203ENST00000474160 E9PCH4 1651 aa28.41■■■□□ 2.14
SYF2-203ENST00000474160 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.41■■■□□ 2.14
SYF2-203ENST00000474160 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
SYF2-203ENST00000474160 IDI1Q13907 227 aa28.38■■■□□ 2.13
SYF2-203ENST00000474160 PIK3C2BO00750 1634 aa28.37■■■□□ 2.13
SYF2-203ENST00000474160 SLIT1O75093 1534 aa28.37■■■□□ 2.13
SYF2-203ENST00000474160 MED14O60244 1454 aa28.36■■■□□ 2.13
SYF2-203ENST00000474160 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.36■■■□□ 2.13
SYF2-203ENST00000474160 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.35■■■□□ 2.13
SYF2-203ENST00000474160 ADGRB3O60242 1522 aa28.33■■■□□ 2.13
SYF2-203ENST00000474160 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.32■■■□□ 2.12
SYF2-203ENST00000474160 TRIM52Q96A61 297 aa28.31■■■□□ 2.12
SYF2-203ENST00000474160 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.31■■■□□ 2.12
SYF2-203ENST00000474160 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
SYF2-203ENST00000474160 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.29■■■□□ 2.12
SYF2-203ENST00000474160 EID1Q9Y6B2 187 aa28.29■■■□□ 2.12
SYF2-203ENST00000474160 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
SYF2-203ENST00000474160 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
SYF2-203ENST00000474160 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.25■■■□□ 2.11
SYF2-203ENST00000474160 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
SYF2-203ENST00000474160 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.24■■■□□ 2.11
SYF2-203ENST00000474160 IQGAP1P46940 1657 aa28.23■■■□□ 2.11
SYF2-203ENST00000474160 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.22■■■□□ 2.11
SYF2-203ENST00000474160 CERKQ8TCT0 537 aa28.21■■■□□ 2.11
SYF2-203ENST00000474160 TRPM2O94759 1503 aa28.21■■■□□ 2.11
SYF2-203ENST00000474160 LTKP29376 864 aa28.2■■■□□ 2.1
SYF2-203ENST00000474160 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.2■■■□□ 2.1
SYF2-203ENST00000474160 HRCP23327 699 aa28.19■■■□□ 2.1
SYF2-203ENST00000474160 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.17■■■□□ 2.1
SYF2-203ENST00000474160 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.16■■■□□ 2.1
SYF2-203ENST00000474160 ZFYVE9O95405 1425 aa28.16■■■□□ 2.1
SYF2-203ENST00000474160 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.15■■■□□ 2.1
SYF2-203ENST00000474160 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.14■■■□□ 2.1
SYF2-203ENST00000474160 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.09
SYF2-203ENST00000474160 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.7 ms