RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473263.1

FADS1-208, Transcript of fatty acid desaturase 1, human

TSL 4

Gene FADS1, Length 574 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FADS1-208	ENST00000473263	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		32.35	■■■□□ 2.77
FADS1-208	ENST00000473263	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		32.35	■■■□□ 2.77
FADS1-208	ENST00000473263	KIF15	Q9NS87	1388 aa		32.34	■■■□□ 2.77
FADS1-208	ENST00000473263	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
FADS1-208	ENST00000473263	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		32.33	■■■□□ 2.77
FADS1-208	ENST00000473263	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		32.33	■■■□□ 2.77
FADS1-208	ENST00000473263	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	32.32	■■■□□ 2.76
FADS1-208	ENST00000473263	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		32.31	■■■□□ 2.76
FADS1-208	ENST00000473263	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	32.3	■■■□□ 2.76
FADS1-208	ENST00000473263	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
FADS1-208	ENST00000473263	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		32.28	■■■□□ 2.76
FADS1-208	ENST00000473263	NCOA1	Q15788	1441 aa		32.26	■■■□□ 2.76
FADS1-208	ENST00000473263	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	32.26	■■■□□ 2.75
FADS1-208	ENST00000473263	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		32.26	■■■□□ 2.75
FADS1-208	ENST00000473263	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
FADS1-208	ENST00000473263	PZP	P20742	1482 aa		32.23	■■■□□ 2.75
FADS1-208	ENST00000473263	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		32.22	■■■□□ 2.75
FADS1-208	ENST00000473263	ADGRL2	O95490	1459 aa		32.21	■■■□□ 2.75
FADS1-208	ENST00000473263	ABCC3	O15438	1527 aa		32.2	■■■□□ 2.74
FADS1-208	ENST00000473263	STRC	Q7RTU9	1775 aa		32.19	■■■□□ 2.74
FADS1-208	ENST00000473263	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		32.16	■■■□□ 2.74
FADS1-208	ENST00000473263	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		32.16	■■■□□ 2.74
FADS1-208	ENST00000473263	TNR	Q92752	1358 aa		32.16	■■■□□ 2.74
FADS1-208	ENST00000473263	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	32.14	■■■□□ 2.74
FADS1-208	ENST00000473263	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
FADS1-208	ENST00000473263	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	32.11	■■■□□ 2.73	2e-9	■■■■■ 48.3
FADS1-208	ENST00000473263	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	32.11	■■■□□ 2.73	3e-6	■□□□□ 8.5
FADS1-208	ENST00000473263	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
FADS1-208	ENST00000473263	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
FADS1-208	ENST00000473263	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		32.1	■■■□□ 2.73
FADS1-208	ENST00000473263	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		32.1	■■■□□ 2.73
FADS1-208	ENST00000473263	DEPDC5	O75140	1603 aa		32.08	■■■□□ 2.73
FADS1-208	ENST00000473263	CEP152	O94986	1710 aa		32.06	■■■□□ 2.72
FADS1-208	ENST00000473263	PTPRT	O14522	1441 aa		32.06	■■■□□ 2.72
FADS1-208	ENST00000473263	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		32.05	■■■□□ 2.72
FADS1-208	ENST00000473263	ROCK1	Q13464	1354 aa		32.04	■■■□□ 2.72
FADS1-208	ENST00000473263	KANK1	Q14678	1352 aa		32.04	■■■□□ 2.72
FADS1-208	ENST00000473263	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		32.03	■■■□□ 2.72
FADS1-208	ENST00000473263	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		32.03	■■■□□ 2.72
FADS1-208	ENST00000473263	PLA2R1	Q13018	1463 aa		32.03	■■■□□ 2.72
FADS1-208	ENST00000473263	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		32.02	■■■□□ 2.72
FADS1-208	ENST00000473263	ERVK-7	P63135	1459 aa		32.01	■■■□□ 2.71
FADS1-208	ENST00000473263	NLRP1	Q9C000	1473 aa		32.01	■■■□□ 2.71
FADS1-208	ENST00000473263	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		32	■■■□□ 2.71
FADS1-208	ENST00000473263	ITGAE	P38570	1179 aa		32	■■■□□ 2.71
FADS1-208	ENST00000473263	PKD2	Q13563	968 aa		31.99	■■■□□ 2.71
FADS1-208	ENST00000473263	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
FADS1-208	ENST00000473263	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		31.97	■■■□□ 2.71
FADS1-208	ENST00000473263	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	31.95	■■■□□ 2.71
FADS1-208	ENST00000473263	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	31.94	■■■□□ 2.7
FADS1-208	ENST00000473263	CERK	Q8TCT0	537 aa		31.91	■■■□□ 2.7
FADS1-208	ENST00000473263	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		31.9	■■■□□ 2.7
FADS1-208	ENST00000473263	FBXO41	Q8TF61	875 aa		31.88	■■■□□ 2.69
FADS1-208	ENST00000473263	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		31.84	■■■□□ 2.69
FADS1-208	ENST00000473263	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		31.83	■■■□□ 2.69
FADS1-208	ENST00000473263	UNC13B	O14795	1591 aa		31.81	■■■□□ 2.68
FADS1-208	ENST00000473263	NOS1	P29475	1434 aa		31.79	■■■□□ 2.68
FADS1-208	ENST00000473263	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		31.78	■■■□□ 2.68
FADS1-208	ENST00000473263	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		31.77	■■■□□ 2.68
FADS1-208	ENST00000473263	IDI1	Q13907	227 aa		31.77	■■■□□ 2.68
FADS1-208	ENST00000473263	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		31.75	■■■□□ 2.67
FADS1-208	ENST00000473263	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
FADS1-208	ENST00000473263	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	31.75	■■■□□ 2.67
FADS1-208	ENST00000473263	TET3	O43151	1660 aa		31.74	■■■□□ 2.67
FADS1-208	ENST00000473263	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	31.74	■■■□□ 2.67
FADS1-208	ENST00000473263	MED14	O60244	1454 aa		31.73	■■■□□ 2.67
FADS1-208	ENST00000473263	NUP155	O75694	1391 aa		31.73	■■■□□ 2.67
FADS1-208	ENST00000473263	SYNM	O15061	1565 aa		31.73	■■■□□ 2.67
FADS1-208	ENST00000473263	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		31.71	■■■□□ 2.67
FADS1-208	ENST00000473263	PIK3C2B	O00750	1634 aa		31.7	■■■□□ 2.66
FADS1-208	ENST00000473263	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	31.69	■■■□□ 2.66
FADS1-208	ENST00000473263	NAIP	Q13075	1403 aa		31.69	■■■□□ 2.66
FADS1-208	ENST00000473263	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		31.69	■■■□□ 2.66
FADS1-208	ENST00000473263	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		31.68	■■■□□ 2.66
FADS1-208	ENST00000473263	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		31.67	■■■□□ 2.66
FADS1-208	ENST00000473263	LTK	P29376	864 aa		31.67	■■■□□ 2.66
FADS1-208	ENST00000473263	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		31.67	■■■□□ 2.66
FADS1-208	ENST00000473263	SLIT1	O75093	1534 aa		31.66	■■■□□ 2.66
FADS1-208	ENST00000473263	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		31.65	■■■□□ 2.66
FADS1-208	ENST00000473263	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		31.63	■■■□□ 2.65
FADS1-208	ENST00000473263		E9PCH4	1651 aa		31.62	■■■□□ 2.65
FADS1-208	ENST00000473263	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	31.62	■■■□□ 2.65
FADS1-208	ENST00000473263	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	31.61	■■■□□ 2.65
FADS1-208	ENST00000473263	HFM1	A2PYH4	1435 aa		31.61	■■■□□ 2.65
FADS1-208	ENST00000473263	EID1	Q9Y6B2	187 aa		31.6	■■■□□ 2.65
FADS1-208	ENST00000473263	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		31.59	■■■□□ 2.65
FADS1-208	ENST00000473263	IQGAP1	P46940	1657 aa		31.58	■■■□□ 2.65
FADS1-208	ENST00000473263	ADGRB3	O60242	1522 aa		31.55	■■■□□ 2.64
FADS1-208	ENST00000473263	CPS1	P31327	1500 aa		31.48	■■■□□ 2.63
FADS1-208	ENST00000473263	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		31.46	■■■□□ 2.63
FADS1-208	ENST00000473263	TRIM52	Q96A61	297 aa		31.46	■■■□□ 2.63
FADS1-208	ENST00000473263	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	31.44	■■■□□ 2.62
FADS1-208	ENST00000473263	ZFYVE9	O95405	1425 aa		31.43	■■■□□ 2.62
FADS1-208	ENST00000473263	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		31.42	■■■□□ 2.62
FADS1-208	ENST00000473263	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	31.41	■■■□□ 2.62
FADS1-208	ENST00000473263	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		31.41	■■■□□ 2.62
FADS1-208	ENST00000473263	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		31.38	■■■□□ 2.61
FADS1-208	ENST00000473263	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		31.37	■■■□□ 2.61
FADS1-208	ENST00000473263	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		31.37	■■■□□ 2.61
FADS1-208	ENST00000473263	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		31.37	■■■□□ 2.61

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