RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471274.1

PTPRD-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRD, Length 1,205 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-208ENST00000471274 RAPGEF3O95398 923 aa15.01□□□□□ -0.01
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PTPRD-208ENST00000471274 AFAP1Q8N556 730 aa15□□□□□ -0.01
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PTPRD-208ENST00000471274 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRD-208ENST00000471274 KIF1BO60333 1816 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRD-208ENST00000471274 CCDC144AA2RUR9 1427 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRD-208ENST00000471274 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRD-208ENST00000471274 SLC52A1Q9NWF4 448 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRD-208ENST00000471274 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
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