RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468148.5

RAB23-202, Transcript of RAB23, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB23, Length 4,837 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23-202ENST00000468148 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
RAB23-202ENST00000468148 POGKQ9P215 609 aa21.43■■□□□ 1.02
RAB23-202ENST00000468148 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.43■■□□□ 1.02
RAB23-202ENST00000468148 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.42■■□□□ 1.02
RAB23-202ENST00000468148 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
RAB23-202ENST00000468148 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.41■■□□□ 1.02
RAB23-202ENST00000468148 TIAM1Q13009 1591 aa21.4■■□□□ 1.02
RAB23-202ENST00000468148 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
RAB23-202ENST00000468148 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
RAB23-202ENST00000468148 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
RAB23-202ENST00000468148 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
RAB23-202ENST00000468148 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
RAB23-202ENST00000468148 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.38■■□□□ 1.01
RAB23-202ENST00000468148 CGNL1Q0VF96 1302 aa21.38■■□□□ 1.01
RAB23-202ENST00000468148 HFM1A2PYH4 1435 aa21.38■■□□□ 1.01
RAB23-202ENST00000468148 E9PSI1 815 aa21.37■■□□□ 1.01
RAB23-202ENST00000468148 CFTRP13569 1480 aa21.37■■□□□ 1.01
RAB23-202ENST00000468148 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.36■■□□□ 1.01
RAB23-202ENST00000468148 SKAP1Q86WV1 359 aa21.35■■□□□ 1.01
RAB23-202ENST00000468148 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.35■■□□□ 1.01
RAB23-202ENST00000468148 CUX1P39880 1505 aa21.35■■□□□ 1.01
RAB23-202ENST00000468148 TOP2BQ02880 1626 aa21.33■■□□□ 1.01
RAB23-202ENST00000468148 STK26Q9P289 416 aa21.32■■□□□ 1
RAB23-202ENST00000468148 PLEKHG5O94827 1062 aa21.31■■□□□ 1
RAB23-202ENST00000468148 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.31■■□□□ 1
RAB23-202ENST00000468148 KANK1Q14678 1352 aa21.31■■□□□ 1
RAB23-202ENST00000468148 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.31■■□□□ 1
RAB23-202ENST00000468148 PTMSP20962 102 aa21.3■■□□□ 1
RAB23-202ENST00000468148 PANK1Q8TE04 598 aa21.3■■□□□ 1
RAB23-202ENST00000468148 DDX11L8A8MPP1 907 aa21.29■■□□□ 1
RAB23-202ENST00000468148 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.29■■□□□ 1
RAB23-202ENST00000468148 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
RAB23-202ENST00000468148 NAIPQ13075 1403 aa21.28■■□□□ 1
RAB23-202ENST00000468148 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
RAB23-202ENST00000468148 GGT6Q6P531 493 aa21.25■□□□□ 0.99
RAB23-202ENST00000468148 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
RAB23-202ENST00000468148 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.24■□□□□ 0.99
RAB23-202ENST00000468148 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.24■□□□□ 0.99
RAB23-202ENST00000468148 CHMP5Q9NZZ3 219 aa21.24■□□□□ 0.99
RAB23-202ENST00000468148 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21.23■□□□□ 0.99
RAB23-202ENST00000468148 C14orf37Q86TY3 774 aa21.23■□□□□ 0.99
RAB23-202ENST00000468148 MAPKBP1O60336 1514 aa21.22■□□□□ 0.99
RAB23-202ENST00000468148 KIF3BO15066 747 aa21.22■□□□□ 0.99
RAB23-202ENST00000468148 SOX12O15370 315 aa21.22■□□□□ 0.99
RAB23-202ENST00000468148 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
RAB23-202ENST00000468148 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
RAB23-202ENST00000468148 JPH4Q96JJ6 628 aa21.22■□□□□ 0.99
RAB23-202ENST00000468148 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.21■□□□□ 0.99
RAB23-202ENST00000468148 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.2■□□□□ 0.98
RAB23-202ENST00000468148 ANKRD45Q5TZF3 282 aa21.2■□□□□ 0.98
RAB23-202ENST00000468148 MCCP23508 829 aa21.2■□□□□ 0.98
RAB23-202ENST00000468148 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.2■□□□□ 0.98
RAB23-202ENST00000468148 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
RAB23-202ENST00000468148 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
RAB23-202ENST00000468148 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
RAB23-202ENST00000468148 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
RAB23-202ENST00000468148 MIA2Q96PC5 1412 aa21.19■□□□□ 0.98
RAB23-202ENST00000468148 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.19■□□□□ 0.98
RAB23-202ENST00000468148 BCAR3O75815 825 aa21.18■□□□□ 0.98
RAB23-202ENST00000468148 CFAP44Q96MT7 982 aa21.18■□□□□ 0.98
RAB23-202ENST00000468148 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.18■□□□□ 0.98
RAB23-202ENST00000468148 KCNJ4P48050 445 aa21.18■□□□□ 0.98
RAB23-202ENST00000468148 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.18■□□□□ 0.98
RAB23-202ENST00000468148 C22orf23Q9BZE7 217 aa21.17■□□□□ 0.98
RAB23-202ENST00000468148 NCAPD3P42695 1498 aa21.17■□□□□ 0.98
RAB23-202ENST00000468148 ERCC6Q03468 1493 aa21.17■□□□□ 0.98
RAB23-202ENST00000468148 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
RAB23-202ENST00000468148 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
RAB23-202ENST00000468148 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa21.15■□□□□ 0.98
RAB23-202ENST00000468148 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
RAB23-202ENST00000468148 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
RAB23-202ENST00000468148 PPP2R1AP30153 589 aa21.15■□□□□ 0.98
RAB23-202ENST00000468148 APPP05067 770 aa21.14■□□□□ 0.98
RAB23-202ENST00000468148 PDE4CQ08493 712 aa21.14■□□□□ 0.98
RAB23-202ENST00000468148 C20orf194Q5TEA3 1177 aa21.14■□□□□ 0.98
RAB23-202ENST00000468148 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
RAB23-202ENST00000468148 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
RAB23-202ENST00000468148 DRC7Q8IY82 874 aa21.12■□□□□ 0.97
RAB23-202ENST00000468148 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.12■□□□□ 0.97
RAB23-202ENST00000468148 LNPKQ9C0E8 428 aa21.12■□□□□ 0.97
RAB23-202ENST00000468148 TRAK2O60296 914 aa21.11■□□□□ 0.97
RAB23-202ENST00000468148 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.11■□□□□ 0.97
RAB23-202ENST00000468148 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
RAB23-202ENST00000468148 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
RAB23-202ENST00000468148 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
RAB23-202ENST00000468148 NCOA1Q15788 1441 aa21.1■□□□□ 0.97
RAB23-202ENST00000468148 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.09■□□□□ 0.97
RAB23-202ENST00000468148 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.09■□□□□ 0.97
RAB23-202ENST00000468148 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
RAB23-202ENST00000468148 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.08■□□□□ 0.97
RAB23-202ENST00000468148 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
RAB23-202ENST00000468148 MRE11P49959 708 aa21.08■□□□□ 0.96
RAB23-202ENST00000468148 FGD1P98174 961 aa21.08■□□□□ 0.96
RAB23-202ENST00000468148 ST18O60284 1047 aa21.08■□□□□ 0.96
RAB23-202ENST00000468148 CALRP27797 417 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
RAB23-202ENST00000468148 NGEFQ8N5V2 710 aa21.07■□□□□ 0.96
RAB23-202ENST00000468148 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
RAB23-202ENST00000468148 RUNDC1Q96C34 613 aa21.07■□□□□ 0.96
RAB23-202ENST00000468148 FAM13BQ9NYF5 915 aa21.06■□□□□ 0.96
RAB23-202ENST00000468148 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms