RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467480.1

PIM3-202, Transcript of Pim-3 proto-oncogene, serine/threonine kinase, humanhuman

TSL 2

Gene PIM3, Length 723 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIM3-202ENST00000467480 SHANK2Q9UPX8 1470 aa48.85■■■■■ 5.41
PIM3-202ENST00000467480 DAPK1P53355 1430 aa48.81■■■■■ 5.4
PIM3-202ENST00000467480 STRCQ7RTU9 1775 aa48.79■■■■■ 5.4
PIM3-202ENST00000467480 DUOX2Q9NRD8 1548 aa48.78■■■■■ 5.4
PIM3-202ENST00000467480 KIF15Q9NS87 1388 aa48.78■■■■■ 5.4
PIM3-202ENST00000467480 MYO3AQ8NEV4 1616 aa48.77■■■■■ 5.4
PIM3-202ENST00000467480 NCOA1Q15788 1441 aa48.75■■■■■ 5.4
PIM3-202ENST00000467480 FBXO41Q8TF61 875 aa48.75■■■■■ 5.39
PIM3-202ENST00000467480 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa48.75■■■■■ 5.39
PIM3-202ENST00000467480 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP48.75■■■■■ 5.39
PIM3-202ENST00000467480 CROCC2H7BZ55 1655 aa48.75■■■■■ 5.39
PIM3-202ENST00000467480 PZPP20742 1482 aa48.74■■■■■ 5.39
PIM3-202ENST00000467480 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP48.74■■■■■ 5.39
PIM3-202ENST00000467480 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP48.73■■■■■ 5.39
PIM3-202ENST00000467480 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP48.73■■■■■ 5.39
PIM3-202ENST00000467480 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa48.71■■■■■ 5.39
PIM3-202ENST00000467480 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP48.7■■■■■ 5.39
PIM3-202ENST00000467480 TNRQ92752 1358 aa48.7■■■■■ 5.39
PIM3-202ENST00000467480 PTPRTO14522 1441 aa48.69■■■■■ 5.39
PIM3-202ENST00000467480 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP48.69■■■■■ 5.38
PIM3-202ENST00000467480 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP48.68■■■■■ 5.38
PIM3-202ENST00000467480 CHIC2Q9UKJ5 165 aa48.66■■■■■ 5.38
PIM3-202ENST00000467480 ERBINQ96RT1 1412 aa48.66■■■■■ 5.38
PIM3-202ENST00000467480 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa48.64■■■■■ 5.38
PIM3-202ENST00000467480 ABCC3O15438 1527 aa48.63■■■■■ 5.37
PIM3-202ENST00000467480 A2ML1A8K2U0 1454 aa48.62■■■■■ 5.37
PIM3-202ENST00000467480 CERKQ8TCT0 537 aa48.62■■■■■ 5.37
PIM3-202ENST00000467480 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP48.59■■■■■ 5.37
PIM3-202ENST00000467480 PLA2R1Q13018 1463 aa48.58■■■■■ 5.37
PIM3-202ENST00000467480 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa48.58■■■■■ 5.37
PIM3-202ENST00000467480 MROH1Q8NDA8 1641 aa48.56■■■■■ 5.36
PIM3-202ENST00000467480 PKD2Q13563 968 aa48.54■■■■■ 5.36
PIM3-202ENST00000467480 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP48.49■■■■■ 5.35
PIM3-202ENST00000467480 NLRP1Q9C000 1473 aa48.47■■■■■ 5.35
PIM3-202ENST00000467480 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP48.47■■■■■ 5.35
PIM3-202ENST00000467480 KANK1Q14678 1352 aa48.44■■■■■ 5.35
PIM3-202ENST00000467480 ADGRL2O95490 1459 aa48.43■■■■■ 5.34
PIM3-202ENST00000467480 CEP152O94986 1710 aa48.4■■■■■ 5.34
PIM3-202ENST00000467480 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP48.39■■■■■ 5.34
PIM3-202ENST00000467480 ERVK-7P63135 1459 aa48.39■■■■■ 5.34
PIM3-202ENST00000467480 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP48.38■■■■■ 5.34
PIM3-202ENST00000467480 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa48.38■■■■■ 5.33
PIM3-202ENST00000467480 UGGT1Q9NYU2 1555 aa48.34■■■■■ 5.33
PIM3-202ENST00000467480 DEPDC5O75140 1603 aa48.33■■■■■ 5.33
PIM3-202ENST00000467480 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa48.32■■■■■ 5.33
PIM3-202ENST00000467480 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP48.3■■■■■ 5.323e-7■□□□□ 10.8
PIM3-202ENST00000467480 ANKLE2Q86XL3 938 aa48.27■■■■■ 5.32
PIM3-202ENST00000467480 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa48.26■■■■■ 5.32
PIM3-202ENST00000467480 LTBP4Q8N2S1 1624 aa48.24■■■■■ 5.31
PIM3-202ENST00000467480 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP48.22■■■■■ 5.31
PIM3-202ENST00000467480 LMTK2Q8IWU2 1503 aa48.19■■■■■ 5.31
PIM3-202ENST00000467480 VWDEQ8N2E2 1590 aa48.17■■■■■ 5.3
PIM3-202ENST00000467480 ITGAEP38570 1179 aa48.15■■■■■ 5.3
PIM3-202ENST00000467480 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP48.14■■■■■ 5.3
PIM3-202ENST00000467480 ROCK1Q13464 1354 aa48.13■■■■■ 5.3
PIM3-202ENST00000467480 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP48.12■■■■■ 5.29
PIM3-202ENST00000467480 NEURL4Q96JN8 1562 aa48.12■■■■■ 5.29
PIM3-202ENST00000467480 IQSEC2Q5JU85 1478 aa48.06■■■■■ 5.28
PIM3-202ENST00000467480 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP48.06■■■■■ 5.28
PIM3-202ENST00000467480 EFCAB6Q5THR3 1501 aa48.03■■■■■ 5.28
PIM3-202ENST00000467480 MED14O60244 1454 aa48.02■■■■■ 5.28
PIM3-202ENST00000467480 STAG3Q9UJ98 1225 aa48.01■■■■■ 5.28
PIM3-202ENST00000467480 UBR1Q8IWV7 1749 aa47.98■■■■■ 5.27
PIM3-202ENST00000467480 NOS1P29475 1434 aa47.92■■■■■ 5.26
PIM3-202ENST00000467480 IDI1Q13907 227 aa47.91■■■■■ 5.26
PIM3-202ENST00000467480 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP47.91■■■■■ 5.26
PIM3-202ENST00000467480 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP47.9■■■■■ 5.26
PIM3-202ENST00000467480 UNC13BO14795 1591 aa47.89■■■■■ 5.26
PIM3-202ENST00000467480 TXNDC2Q86VQ3 553 aa47.89■■■■■ 5.26
PIM3-202ENST00000467480 EID1Q9Y6B2 187 aa47.89■■■■■ 5.26
PIM3-202ENST00000467480 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP47.89■■■■■ 5.26
PIM3-202ENST00000467480 PIK3C2BO00750 1634 aa47.89■■■■■ 5.26
PIM3-202ENST00000467480 IQGAP1P46940 1657 aa47.88■■■■■ 5.26
PIM3-202ENST00000467480 ARHGAP23Q9P227 1491 aa47.87■■■■■ 5.25
PIM3-202ENST00000467480 SYNMO15061 1565 aa47.87■■■■■ 5.25
PIM3-202ENST00000467480 SLIT1O75093 1534 aa47.86■■■■■ 5.25
PIM3-202ENST00000467480 SLC52A1Q9NWF4 448 aa47.85■■■■■ 5.25
PIM3-202ENST00000467480 TET3O43151 1660 aa47.84■■■■■ 5.25
PIM3-202ENST00000467480 CPS1P31327 1500 aa47.84■■■■■ 5.25
PIM3-202ENST00000467480 LTKP29376 864 aa47.83■■■■■ 5.25
PIM3-202ENST00000467480 TMEM2Q9UHN6 1383 aa47.82■■■■■ 5.25
PIM3-202ENST00000467480 NUP155O75694 1391 aa47.78■■■■■ 5.24
PIM3-202ENST00000467480 UBAP1LF5GYI3 381 aa47.78■■■■■ 5.24
PIM3-202ENST00000467480 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP47.73■■■■■ 5.23
PIM3-202ENST00000467480 GCC2Q8IWJ2 1684 aa47.73■■■■■ 5.23
PIM3-202ENST00000467480 ADGRB3O60242 1522 aa47.71■■■■■ 5.23
PIM3-202ENST00000467480 IQGAP3Q86VI3 1631 aa47.7■■■■■ 5.23
PIM3-202ENST00000467480 E9PCH4 1651 aa47.6■■■■■ 5.21
PIM3-202ENST00000467480 CHGAP10645 457 aaKnown RBP47.56■■■■■ 5.2
PIM3-202ENST00000467480 TOM1O60784 492 aa47.55■■■■■ 5.2
PIM3-202ENST00000467480 NAIPQ13075 1403 aa47.55■■■■■ 5.2
PIM3-202ENST00000467480 HDGFP51858 240 aaKnown RBP47.51■■■■■ 5.2
PIM3-202ENST00000467480 BCANQ96GW7 911 aa47.51■■■■■ 5.2
PIM3-202ENST00000467480 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP47.5■■■■■ 5.19
PIM3-202ENST00000467480 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP47.49■■■■■ 5.19
PIM3-202ENST00000467480 LRRC7Q96NW7 1537 aa47.49■■■■■ 5.19
PIM3-202ENST00000467480 PIP4K2BP78356 416 aa47.46■■■■■ 5.19
PIM3-202ENST00000467480 SLC26A8Q96RN1 970 aa47.46■■■■■ 5.19
PIM3-202ENST00000467480 STRCP1A6NGW2 1772 aa47.46■■■■■ 5.19
PIM3-202ENST00000467480 RIMS2Q9UQ26 1411 aa47.46■■■■■ 5.19
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