RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461592.1

CCZ1-202, Transcript of CCZ1 homolog, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2

Gene CCZ1, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1-202ENST00000461592 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
CCZ1-202ENST00000461592 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
CCZ1-202ENST00000461592 DUOX2Q9NRD8 1548 aa41.08■■■■■ 4.17
CCZ1-202ENST00000461592 PREX1Q8TCU6 1659 aa41.08■■■■■ 4.17
CCZ1-202ENST00000461592 NPATQ14207 1427 aa41.07■■■■■ 4.16
CCZ1-202ENST00000461592 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.03■■■■■ 4.16
CCZ1-202ENST00000461592 KDM5DQ9BY66 1539 aa41.01■■■■■ 4.16
CCZ1-202ENST00000461592 FAM135AQ9P2D6 1515 aa41.01■■■■■ 4.16
CCZ1-202ENST00000461592 ERBINQ96RT1 1412 aa40.97■■■■■ 4.15
CCZ1-202ENST00000461592 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP40.96■■■■■ 4.15
CCZ1-202ENST00000461592 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.95■■■■■ 4.15
CCZ1-202ENST00000461592 PTPRKQ15262 1439 aa40.93■■■■■ 4.14
CCZ1-202ENST00000461592 ITGAEP38570 1179 aa40.93■■■■■ 4.14
CCZ1-202ENST00000461592 NCOA1Q15788 1441 aa40.93■■■■■ 4.14
CCZ1-202ENST00000461592 KANK1Q14678 1352 aa40.92■■■■■ 4.14
CCZ1-202ENST00000461592 DMRT2Q9Y5R5 561 aa40.92■■■■■ 4.14
CCZ1-202ENST00000461592 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.13
CCZ1-202ENST00000461592 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP40.85■■■■■ 4.13
CCZ1-202ENST00000461592 ADGRL2O95490 1459 aa40.83■■■■■ 4.13
CCZ1-202ENST00000461592 PZPP20742 1482 aa40.83■■■■■ 4.13
CCZ1-202ENST00000461592 TNRQ92752 1358 aa40.83■■■■■ 4.13
CCZ1-202ENST00000461592 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.8■■■■■ 4.12
CCZ1-202ENST00000461592 ABCC3O15438 1527 aa40.78■■■■■ 4.12
CCZ1-202ENST00000461592 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP40.78■■■■■ 4.12
CCZ1-202ENST00000461592 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.75■■■■■ 4.11
CCZ1-202ENST00000461592 ROCK1Q13464 1354 aa40.71■■■■■ 4.11
CCZ1-202ENST00000461592 MYO3AQ8NEV4 1616 aa40.71■■■■■ 4.11
CCZ1-202ENST00000461592 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP40.68■■■■■ 4.1
CCZ1-202ENST00000461592 MROH1Q8NDA8 1641 aa40.67■■■■■ 4.1
CCZ1-202ENST00000461592 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
CCZ1-202ENST00000461592 A2ML1A8K2U0 1454 aa40.67■■■■■ 4.1
CCZ1-202ENST00000461592 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa40.64■■■■■ 4.1
CCZ1-202ENST00000461592 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
CCZ1-202ENST00000461592 PKD2Q13563 968 aa40.63■■■■■ 4.09
CCZ1-202ENST00000461592 CEP152O94986 1710 aa40.62■■■■■ 4.09
CCZ1-202ENST00000461592 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.62■■■■■ 4.09
CCZ1-202ENST00000461592 NLRP1Q9C000 1473 aa40.62■■■■■ 4.09
CCZ1-202ENST00000461592 DEPDC5O75140 1603 aa40.59■■■■■ 4.09
CCZ1-202ENST00000461592 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP40.59■■■■■ 4.09
CCZ1-202ENST00000461592 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa40.59■■■■■ 4.09
CCZ1-202ENST00000461592 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa40.58■■■■■ 4.09
CCZ1-202ENST00000461592 ERVK-7P63135 1459 aa40.57■■■■■ 4.08
CCZ1-202ENST00000461592 PTPRTO14522 1441 aa40.56■■■■■ 4.08
CCZ1-202ENST00000461592 PLA2R1Q13018 1463 aa40.54■■■■■ 4.08
CCZ1-202ENST00000461592 STRCQ7RTU9 1775 aa40.53■■■■■ 4.08
CCZ1-202ENST00000461592 STAG3Q9UJ98 1225 aa40.52■■■■■ 4.08
CCZ1-202ENST00000461592 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa40.52■■■■■ 4.08
CCZ1-202ENST00000461592 ANKLE2Q86XL3 938 aa40.5■■■■■ 4.07
CCZ1-202ENST00000461592 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40.48■■■■■ 4.07
CCZ1-202ENST00000461592 LMTK2Q8IWU2 1503 aa40.48■■■■■ 4.07
CCZ1-202ENST00000461592 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP40.46■■■■■ 4.07
CCZ1-202ENST00000461592 VWDEQ8N2E2 1590 aa40.43■■■■■ 4.06
CCZ1-202ENST00000461592 NUP155O75694 1391 aa40.41■■■■■ 4.06
CCZ1-202ENST00000461592 CERKQ8TCT0 537 aa40.39■■■■■ 4.06
CCZ1-202ENST00000461592 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP40.38■■■■■ 4.05
CCZ1-202ENST00000461592 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.36■■■■■ 4.05
CCZ1-202ENST00000461592 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.34■■■■■ 4.05
CCZ1-202ENST00000461592 FBXO41Q8TF61 875 aa40.33■■■■■ 4.05
CCZ1-202ENST00000461592 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.05
CCZ1-202ENST00000461592 UNC13BO14795 1591 aa40.32■■■■■ 4.05
CCZ1-202ENST00000461592 EID1Q9Y6B2 187 aa40.32■■■■■ 4.05
CCZ1-202ENST00000461592 IDI1Q13907 227 aa40.29■■■■■ 4.04
CCZ1-202ENST00000461592 TET3O43151 1660 aa40.26■■■■■ 4.04
CCZ1-202ENST00000461592 TRIM52Q96A61 297 aa40.25■■■■■ 4.03
CCZ1-202ENST00000461592 TXNDC2Q86VQ3 553 aa40.24■■■■■ 4.03
CCZ1-202ENST00000461592 NOS1P29475 1434 aa40.24■■■■■ 4.03
CCZ1-202ENST00000461592 NAIPQ13075 1403 aa40.23■■■■■ 4.03
CCZ1-202ENST00000461592 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP40.2■■■■■ 4.03
CCZ1-202ENST00000461592 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.02
CCZ1-202ENST00000461592 HFM1A2PYH4 1435 aa40.18■■■■■ 4.02
CCZ1-202ENST00000461592 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.18■■■■■ 4.02
CCZ1-202ENST00000461592 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.18■■■■■ 4.02
CCZ1-202ENST00000461592 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP40.17■■■■■ 4.02
CCZ1-202ENST00000461592 CHGAP10645 457 aaKnown RBP40.17■■■■■ 4.02
CCZ1-202ENST00000461592 UBR1Q8IWV7 1749 aa40.16■■■■■ 4.02
CCZ1-202ENST00000461592 HDGFP51858 240 aaKnown RBP40.15■■■■■ 4.02
CCZ1-202ENST00000461592 PIK3C2BO00750 1634 aa40.14■■■■■ 4.02
CCZ1-202ENST00000461592 SYNMO15061 1565 aa40.12■■■■■ 4.01
CCZ1-202ENST00000461592 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP40.12■■■■■ 4.01
CCZ1-202ENST00000461592 TMEM2Q9UHN6 1383 aa40.11■■■■■ 4.01
CCZ1-202ENST00000461592 MED14O60244 1454 aa40.1■■■■■ 4.01
CCZ1-202ENST00000461592 BCANQ96GW7 911 aa40.09■■■■■ 4.01
CCZ1-202ENST00000461592 NEURL4Q96JN8 1562 aa40.08■■■■■ 4.01
CCZ1-202ENST00000461592 LTKP29376 864 aa40.07■■■■■ 4.01
CCZ1-202ENST00000461592 SLIT1O75093 1534 aa40.06■■■■■ 4
CCZ1-202ENST00000461592 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP40.04■■■■■ 4
CCZ1-202ENST00000461592 ARHGAP23Q9P227 1491 aa40.04■■■■■ 4
CCZ1-202ENST00000461592 E9PCH4 1651 aa40.04■■■■■ 4
CCZ1-202ENST00000461592 ADGRB3O60242 1522 aa40.03■■■■■ 4
CCZ1-202ENST00000461592 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP40.02■■■■■ 4
CCZ1-202ENST00000461592 LTBP4Q8N2S1 1624 aa40.02■■■■■ 4
CCZ1-202ENST00000461592 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP40.02■■■■■ 4
CCZ1-202ENST00000461592 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40■■■■□ 3.99
CCZ1-202ENST00000461592 IQGAP1P46940 1657 aa40■■■■□ 3.99
CCZ1-202ENST00000461592 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP39.97■■■■□ 3.99
CCZ1-202ENST00000461592 IQSEC2Q5JU85 1478 aa39.94■■■■□ 3.98
CCZ1-202ENST00000461592 CPS1P31327 1500 aa39.91■■■■□ 3.98
CCZ1-202ENST00000461592 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP39.89■■■■□ 3.98
CCZ1-202ENST00000461592 RIMS2Q9UQ26 1411 aa39.88■■■■□ 3.97
CCZ1-202ENST00000461592 UBAP1LF5GYI3 381 aa39.86■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms