RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460976.5

CTBP2-206, Transcript of C-terminal binding protein 2, human

TSL 5

Gene CTBP2, Length 603 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP2-206	ENST00000460976	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		41.29	■■■■■ 4.2
CTBP2-206	ENST00000460976	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	41.27	■■■■■ 4.2
CTBP2-206	ENST00000460976	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	41.26	■■■■■ 4.2
CTBP2-206	ENST00000460976	NCOA1	Q15788	1441 aa		41.26	■■■■■ 4.19
CTBP2-206	ENST00000460976	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		41.26	■■■■■ 4.19
CTBP2-206	ENST00000460976	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	41.25	■■■■■ 4.19
CTBP2-206	ENST00000460976	PTPRT	O14522	1441 aa		41.23	■■■■■ 4.19
CTBP2-206	ENST00000460976	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		41.22	■■■■■ 4.19
CTBP2-206	ENST00000460976	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		41.21	■■■■■ 4.19
CTBP2-206	ENST00000460976	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		41.2	■■■■■ 4.19
CTBP2-206	ENST00000460976	PZP	P20742	1482 aa		41.2	■■■■■ 4.19
CTBP2-206	ENST00000460976	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	41.19	■■■■■ 4.18
CTBP2-206	ENST00000460976	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	41.18	■■■■■ 4.18
CTBP2-206	ENST00000460976	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		41.17	■■■■■ 4.18
CTBP2-206	ENST00000460976	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	41.17	■■■■■ 4.18
CTBP2-206	ENST00000460976	ABCC5	O15440	1437 aa		41.16	■■■■■ 4.18
CTBP2-206	ENST00000460976	CERK	Q8TCT0	537 aa		41.15	■■■■■ 4.18
CTBP2-206	ENST00000460976	DAPK1	P53355	1430 aa		41.12	■■■■■ 4.17
CTBP2-206	ENST00000460976	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		41.12	■■■■■ 4.17
CTBP2-206	ENST00000460976	PLA2R1	Q13018	1463 aa		41.12	■■■■■ 4.17
CTBP2-206	ENST00000460976	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		41.1	■■■■■ 4.17
CTBP2-206	ENST00000460976	TNR	Q92752	1358 aa		41.1	■■■■■ 4.17
CTBP2-206	ENST00000460976	ABCC3	O15438	1527 aa		41.08	■■■■■ 4.17
CTBP2-206	ENST00000460976	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	41.08	■■■■■ 4.17
CTBP2-206	ENST00000460976	KIF15	Q9NS87	1388 aa		41.08	■■■■■ 4.17
CTBP2-206	ENST00000460976	CEP152	O94986	1710 aa		41.04	■■■■■ 4.16
CTBP2-206	ENST00000460976	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		41.02	■■■■■ 4.16
CTBP2-206	ENST00000460976	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		41	■■■■■ 4.15
CTBP2-206	ENST00000460976	PKD2	Q13563	968 aa		41	■■■■■ 4.15
CTBP2-206	ENST00000460976	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		40.98	■■■■■ 4.15
CTBP2-206	ENST00000460976	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	40.97	■■■■■ 4.15
CTBP2-206	ENST00000460976	NLRP1	Q9C000	1473 aa		40.96	■■■■■ 4.15
CTBP2-206	ENST00000460976	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		40.94	■■■■■ 4.14
CTBP2-206	ENST00000460976	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		40.93	■■■■■ 4.14
CTBP2-206	ENST00000460976	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	40.93	■■■■■ 4.14
CTBP2-206	ENST00000460976	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		40.93	■■■■■ 4.14
CTBP2-206	ENST00000460976	DEPDC5	O75140	1603 aa		40.93	■■■■■ 4.14
CTBP2-206	ENST00000460976	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		40.89	■■■■■ 4.14
CTBP2-206	ENST00000460976	ERVK-7	P63135	1459 aa		40.88	■■■■■ 4.13
CTBP2-206	ENST00000460976	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	40.87	■■■■■ 4.13
CTBP2-206	ENST00000460976	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		40.86	■■■■■ 4.13
CTBP2-206	ENST00000460976	ADGRL2	O95490	1459 aa		40.85	■■■■■ 4.13
CTBP2-206	ENST00000460976	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	40.85	■■■■■ 4.13
CTBP2-206	ENST00000460976	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		40.8	■■■■■ 4.12
CTBP2-206	ENST00000460976	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	40.79	■■■■■ 4.12
CTBP2-206	ENST00000460976	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		40.78	■■■■■ 4.12
CTBP2-206	ENST00000460976	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		40.78	■■■■■ 4.12
CTBP2-206	ENST00000460976	KANK1	Q14678	1352 aa		40.78	■■■■■ 4.12
CTBP2-206	ENST00000460976	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	40.77	■■■■■ 4.12	1e-6	■■■■□ 22.6
CTBP2-206	ENST00000460976	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	40.76	■■■■■ 4.12
CTBP2-206	ENST00000460976	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	40.75	■■■■■ 4.11
CTBP2-206	ENST00000460976	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		40.72	■■■■■ 4.11
CTBP2-206	ENST00000460976	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		40.71	■■■■■ 4.11
CTBP2-206	ENST00000460976	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		40.7	■■■■■ 4.11
CTBP2-206	ENST00000460976	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		40.69	■■■■■ 4.1
CTBP2-206	ENST00000460976	MED14	O60244	1454 aa		40.64	■■■■■ 4.1
CTBP2-206	ENST00000460976	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		40.63	■■■■■ 4.09
CTBP2-206	ENST00000460976	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	40.6	■■■■■ 4.09
CTBP2-206	ENST00000460976	IQGAP1	P46940	1657 aa		40.59	■■■■■ 4.09
CTBP2-206	ENST00000460976	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		40.58	■■■■■ 4.09
CTBP2-206	ENST00000460976	PIK3C2B	O00750	1634 aa		40.56	■■■■■ 4.08
CTBP2-206	ENST00000460976	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	40.52	■■■■■ 4.08
CTBP2-206	ENST00000460976	CPS1	P31327	1500 aa		40.52	■■■■■ 4.08
CTBP2-206	ENST00000460976	ROCK1	Q13464	1354 aa		40.5	■■■■■ 4.07
CTBP2-206	ENST00000460976	UNC13B	O14795	1591 aa		40.49	■■■■■ 4.07
CTBP2-206	ENST00000460976	SLIT1	O75093	1534 aa		40.49	■■■■■ 4.07
CTBP2-206	ENST00000460976	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	40.49	■■■■■ 4.07
CTBP2-206	ENST00000460976	SYNM	O15061	1565 aa		40.48	■■■■■ 4.07
CTBP2-206	ENST00000460976	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		40.48	■■■■■ 4.07
CTBP2-206	ENST00000460976	TET3	O43151	1660 aa		40.47	■■■■■ 4.07
CTBP2-206	ENST00000460976	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	40.46	■■■■■ 4.07
CTBP2-206	ENST00000460976	NOS1	P29475	1434 aa		40.45	■■■■■ 4.07
CTBP2-206	ENST00000460976	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	40.44	■■■■■ 4.06
CTBP2-206	ENST00000460976	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		40.43	■■■■■ 4.06
CTBP2-206	ENST00000460976	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		40.39	■■■■■ 4.06
CTBP2-206	ENST00000460976	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		40.38	■■■■■ 4.05
CTBP2-206	ENST00000460976	ITGAE	P38570	1179 aa		40.37	■■■■■ 4.05
CTBP2-206	ENST00000460976	IDI1	Q13907	227 aa		40.37	■■■■■ 4.05
CTBP2-206	ENST00000460976	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		40.36	■■■■■ 4.05
CTBP2-206	ENST00000460976	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		40.35	■■■■■ 4.05
CTBP2-206	ENST00000460976	ADGRB3	O60242	1522 aa		40.34	■■■■■ 4.05
CTBP2-206	ENST00000460976	LTK	P29376	864 aa		40.34	■■■■■ 4.05
CTBP2-206	ENST00000460976	EID1	Q9Y6B2	187 aa		40.34	■■■■■ 4.05
CTBP2-206	ENST00000460976	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		40.33	■■■■■ 4.05
CTBP2-206	ENST00000460976	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		40.33	■■■■■ 4.05
CTBP2-206	ENST00000460976	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		40.3	■■■■■ 4.04
CTBP2-206	ENST00000460976		E9PCH4	1651 aa		40.28	■■■■■ 4.04
CTBP2-206	ENST00000460976	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	40.27	■■■■■ 4.04
CTBP2-206	ENST00000460976	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		40.22	■■■■■ 4.03
CTBP2-206	ENST00000460976	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		40.19	■■■■■ 4.02
CTBP2-206	ENST00000460976	NUP155	O75694	1391 aa		40.18	■■■■■ 4.02
CTBP2-206	ENST00000460976	TOM1	O60784	492 aa		40.17	■■■■■ 4.02
CTBP2-206	ENST00000460976	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		40.15	■■■■■ 4.02
CTBP2-206	ENST00000460976	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	40.09	■■■■■ 4.01
CTBP2-206	ENST00000460976	ZFYVE9	O95405	1425 aa		40.07	■■■■■ 4
CTBP2-206	ENST00000460976	ALK	Q9UM73	1620 aa		40.06	■■■■■ 4
CTBP2-206	ENST00000460976	PIP4K2B	P78356	416 aa		40.06	■■■■■ 4
CTBP2-206	ENST00000460976	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	40.05	■■■■■ 4
CTBP2-206	ENST00000460976	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		40.02	■■■■■ 4
CTBP2-206	ENST00000460976	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		40.01	■■■■■ 4

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