RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458278.6

ANKRD54-208, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 623 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-208ENST00000458278 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.68■■□□□ 1.86
ANKRD54-208ENST00000458278 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
ANKRD54-208ENST00000458278 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.67■■□□□ 1.86
ANKRD54-208ENST00000458278 PTPRKQ15262 1439 aa26.65■■□□□ 1.86
ANKRD54-208ENST00000458278 KIF15Q9NS87 1388 aa26.63■■□□□ 1.85
ANKRD54-208ENST00000458278 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.62■■□□□ 1.85
ANKRD54-208ENST00000458278 ERBINQ96RT1 1412 aa26.6■■□□□ 1.85
ANKRD54-208ENST00000458278 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
ANKRD54-208ENST00000458278 PZPP20742 1482 aa26.58■■□□□ 1.85
ANKRD54-208ENST00000458278 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.58■■□□□ 1.84
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ANKRD54-208ENST00000458278 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.57■■□□□ 1.84
ANKRD54-208ENST00000458278 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.56■■□□□ 1.84
ANKRD54-208ENST00000458278 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
ANKRD54-208ENST00000458278 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.55■■□□□ 1.84
ANKRD54-208ENST00000458278 STRCQ7RTU9 1775 aa26.55■■□□□ 1.84
ANKRD54-208ENST00000458278 ABCC3O15438 1527 aa26.55■■□□□ 1.84
ANKRD54-208ENST00000458278 NCOA1Q15788 1441 aa26.54■■□□□ 1.84
ANKRD54-208ENST00000458278 ADGRL2O95490 1459 aa26.54■■□□□ 1.84
ANKRD54-208ENST00000458278 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.52■■□□□ 1.84
ANKRD54-208ENST00000458278 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.52■■□□□ 1.84
ANKRD54-208ENST00000458278 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
ANKRD54-208ENST00000458278 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
ANKRD54-208ENST00000458278 DEPDC5O75140 1603 aa26.49■■□□□ 1.83
ANKRD54-208ENST00000458278 TNRQ92752 1358 aa26.48■■□□□ 1.83
ANKRD54-208ENST00000458278 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
ANKRD54-208ENST00000458278 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.47■■□□□ 1.83
ANKRD54-208ENST00000458278 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.47■■□□□ 1.83
ANKRD54-208ENST00000458278 CEP152O94986 1710 aa26.45■■□□□ 1.83
ANKRD54-208ENST00000458278 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.45■■□□□ 1.82
ANKRD54-208ENST00000458278 PLA2R1Q13018 1463 aa26.44■■□□□ 1.82
ANKRD54-208ENST00000458278 PTPRTO14522 1441 aa26.44■■□□□ 1.82
ANKRD54-208ENST00000458278 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
ANKRD54-208ENST00000458278 NLRP1Q9C000 1473 aa26.42■■□□□ 1.82
ANKRD54-208ENST00000458278 KANK1Q14678 1352 aa26.41■■□□□ 1.82
ANKRD54-208ENST00000458278 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.41■■□□□ 1.82
ANKRD54-208ENST00000458278 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.4■■□□□ 1.82
ANKRD54-208ENST00000458278 ERVK-7P63135 1459 aa26.38■■□□□ 1.81
ANKRD54-208ENST00000458278 ROCK1Q13464 1354 aa26.38■■□□□ 1.81
ANKRD54-208ENST00000458278 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.38■■□□□ 1.81
ANKRD54-208ENST00000458278 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.37■■□□□ 1.81
ANKRD54-208ENST00000458278 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.36■■□□□ 1.81
ANKRD54-208ENST00000458278 PKD2Q13563 968 aa26.36■■□□□ 1.81
ANKRD54-208ENST00000458278 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
ANKRD54-208ENST00000458278 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.36■■□□□ 1.81
ANKRD54-208ENST00000458278 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
ANKRD54-208ENST00000458278 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.32■■□□□ 1.8
ANKRD54-208ENST00000458278 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
ANKRD54-208ENST00000458278 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.31■■□□□ 1.8
ANKRD54-208ENST00000458278 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
ANKRD54-208ENST00000458278 FBXO41Q8TF61 875 aa26.28■■□□□ 1.8
ANKRD54-208ENST00000458278 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.27■■□□□ 1.8
ANKRD54-208ENST00000458278 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
ANKRD54-208ENST00000458278 CERKQ8TCT0 537 aa26.26■■□□□ 1.79
ANKRD54-208ENST00000458278 UNC13BO14795 1591 aa26.24■■□□□ 1.79
ANKRD54-208ENST00000458278 ITGAEP38570 1179 aa26.24■■□□□ 1.79
ANKRD54-208ENST00000458278 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
ANKRD54-208ENST00000458278 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.21■■□□□ 1.79
ANKRD54-208ENST00000458278 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.2■■□□□ 1.79
ANKRD54-208ENST00000458278 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.2■■□□□ 1.79
ANKRD54-208ENST00000458278 TET3O43151 1660 aa26.2■■□□□ 1.78
ANKRD54-208ENST00000458278 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.2■■□□□ 1.78
ANKRD54-208ENST00000458278 NOS1P29475 1434 aa26.17■■□□□ 1.78
ANKRD54-208ENST00000458278 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.17■■□□□ 1.78
ANKRD54-208ENST00000458278 MED14O60244 1454 aa26.17■■□□□ 1.78
ANKRD54-208ENST00000458278 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
ANKRD54-208ENST00000458278 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.15■■□□□ 1.78
ANKRD54-208ENST00000458278 SYNMO15061 1565 aa26.15■■□□□ 1.78
ANKRD54-208ENST00000458278 PIK3C2BO00750 1634 aa26.14■■□□□ 1.77
ANKRD54-208ENST00000458278 SLIT1O75093 1534 aa26.12■■□□□ 1.77
ANKRD54-208ENST00000458278 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.11■■□□□ 1.77
ANKRD54-208ENST00000458278 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.11■■□□□ 1.77
ANKRD54-208ENST00000458278 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
ANKRD54-208ENST00000458278 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
ANKRD54-208ENST00000458278 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.1■■□□□ 1.77
ANKRD54-208ENST00000458278 NUP155O75694 1391 aa26.09■■□□□ 1.77
ANKRD54-208ENST00000458278 IDI1Q13907 227 aa26.09■■□□□ 1.77
ANKRD54-208ENST00000458278 IQGAP1P46940 1657 aa26.09■■□□□ 1.77
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ANKRD54-208ENST00000458278 NAIPQ13075 1403 aa26.06■■□□□ 1.76
ANKRD54-208ENST00000458278 E9PCH4 1651 aa26.06■■□□□ 1.76
ANKRD54-208ENST00000458278 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.06■■□□□ 1.76
ANKRD54-208ENST00000458278 ADGRB3O60242 1522 aa26.04■■□□□ 1.76
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ANKRD54-208ENST00000458278 HFM1A2PYH4 1435 aa26.03■■□□□ 1.76
ANKRD54-208ENST00000458278 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.01■■□□□ 1.75
ANKRD54-208ENST00000458278 CPS1P31327 1500 aa26■■□□□ 1.75
ANKRD54-208ENST00000458278 LTKP29376 864 aa26■■□□□ 1.75
ANKRD54-208ENST00000458278 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.94■■□□□ 1.74
ANKRD54-208ENST00000458278 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.92■■□□□ 1.74
ANKRD54-208ENST00000458278 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.9■■□□□ 1.74
ANKRD54-208ENST00000458278 ZFYVE9O95405 1425 aa25.89■■□□□ 1.74
ANKRD54-208ENST00000458278 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
ANKRD54-208ENST00000458278 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.87■■□□□ 1.73
ANKRD54-208ENST00000458278 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.85■■□□□ 1.73
ANKRD54-208ENST00000458278 TRIM52Q96A61 297 aa25.83■■□□□ 1.73
ANKRD54-208ENST00000458278 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
ANKRD54-208ENST00000458278 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.82■■□□□ 1.72
ANKRD54-208ENST00000458278 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.82■■□□□ 1.72
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