RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454225.1

CITED1-210, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene CITED1, Length 716 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-210ENST00000454225 DUOX2Q9NRD8 1548 aa39.99■■■■□ 3.99
CITED1-210ENST00000454225 KIF15Q9NS87 1388 aa39.98■■■■□ 3.99
CITED1-210ENST00000454225 FAM135AQ9P2D6 1515 aa39.98■■■■□ 3.99
CITED1-210ENST00000454225 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP39.98■■■■□ 3.99
CITED1-210ENST00000454225 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa39.97■■■■□ 3.99
CITED1-210ENST00000454225 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP39.97■■■■□ 3.99
CITED1-210ENST00000454225 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP39.97■■■■□ 3.99
CITED1-210ENST00000454225 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa39.96■■■■□ 3.99
CITED1-210ENST00000454225 CHIC2Q9UKJ5 165 aa39.93■■■■□ 3.98
CITED1-210ENST00000454225 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP39.91■■■■□ 3.98
CITED1-210ENST00000454225 MYO3AQ8NEV4 1616 aa39.88■■■■□ 3.97
CITED1-210ENST00000454225 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa39.87■■■■□ 3.97
CITED1-210ENST00000454225 ERBINQ96RT1 1412 aa39.86■■■■□ 3.97
CITED1-210ENST00000454225 STRCQ7RTU9 1775 aa39.86■■■■□ 3.97
CITED1-210ENST00000454225 MROH1Q8NDA8 1641 aa39.86■■■■□ 3.97
CITED1-210ENST00000454225 PZPP20742 1482 aa39.86■■■■□ 3.97
CITED1-210ENST00000454225 ABCC3O15438 1527 aa39.84■■■■□ 3.97
CITED1-210ENST00000454225 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP39.83■■■■□ 3.97
CITED1-210ENST00000454225 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP39.81■■■■□ 3.96
CITED1-210ENST00000454225 NCOA1Q15788 1441 aa39.81■■■■□ 3.96
CITED1-210ENST00000454225 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP39.8■■■■□ 3.96
CITED1-210ENST00000454225 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP39.8■■■■□ 3.96
CITED1-210ENST00000454225 ADGRL2O95490 1459 aa39.77■■■■□ 3.96
CITED1-210ENST00000454225 TNRQ92752 1358 aa39.77■■■■□ 3.96
CITED1-210ENST00000454225 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa39.76■■■■□ 3.95
CITED1-210ENST00000454225 CEP152O94986 1710 aa39.75■■■■□ 3.95
CITED1-210ENST00000454225 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP39.74■■■■□ 3.95
CITED1-210ENST00000454225 DMRT2Q9Y5R5 561 aa39.73■■■■□ 3.95
CITED1-210ENST00000454225 A2ML1A8K2U0 1454 aa39.7■■■■□ 3.95
CITED1-210ENST00000454225 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP39.7■■■■□ 3.95
CITED1-210ENST00000454225 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP39.69■■■■□ 3.94
CITED1-210ENST00000454225 DEPDC5O75140 1603 aa39.69■■■■□ 3.94
CITED1-210ENST00000454225 PTPRTO14522 1441 aa39.64■■■■□ 3.94
CITED1-210ENST00000454225 KANK1Q14678 1352 aa39.62■■■■□ 3.93
CITED1-210ENST00000454225 PLA2R1Q13018 1463 aa39.62■■■■□ 3.93
CITED1-210ENST00000454225 ERVK-7P63135 1459 aa39.61■■■■□ 3.93
CITED1-210ENST00000454225 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa39.61■■■■□ 3.93
CITED1-210ENST00000454225 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa39.6■■■■□ 3.93
CITED1-210ENST00000454225 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP39.59■■■■□ 3.93
CITED1-210ENST00000454225 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa39.59■■■■□ 3.93
CITED1-210ENST00000454225 NLRP1Q9C000 1473 aa39.58■■■■□ 3.93
CITED1-210ENST00000454225 ITGAEP38570 1179 aa39.57■■■■□ 3.93
CITED1-210ENST00000454225 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP39.56■■■■□ 3.92
CITED1-210ENST00000454225 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa39.54■■■■□ 3.92
CITED1-210ENST00000454225 VWDEQ8N2E2 1590 aa39.52■■■■□ 3.92
CITED1-210ENST00000454225 ROCK1Q13464 1354 aa39.52■■■■□ 3.92
CITED1-210ENST00000454225 PKD2Q13563 968 aa39.52■■■■□ 3.92
CITED1-210ENST00000454225 UGGT1Q9NYU2 1555 aa39.49■■■■□ 3.91
CITED1-210ENST00000454225 LMTK2Q8IWU2 1503 aa39.49■■■■□ 3.91
CITED1-210ENST00000454225 CERKQ8TCT0 537 aa39.47■■■■□ 3.91
CITED1-210ENST00000454225 FBXO41Q8TF61 875 aa39.46■■■■□ 3.91
CITED1-210ENST00000454225 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP39.45■■■■□ 3.91
CITED1-210ENST00000454225 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP39.44■■■■□ 3.9
CITED1-210ENST00000454225 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP39.4■■■■□ 3.9
CITED1-210ENST00000454225 EFCAB6Q5THR3 1501 aa39.39■■■■□ 3.9
CITED1-210ENST00000454225 UNC13BO14795 1591 aa39.36■■■■□ 3.89
CITED1-210ENST00000454225 ANKLE2Q86XL3 938 aa39.35■■■■□ 3.89
CITED1-210ENST00000454225 NEURL4Q96JN8 1562 aa39.34■■■■□ 3.89
CITED1-210ENST00000454225 LTBP4Q8N2S1 1624 aa39.32■■■■□ 3.88
CITED1-210ENST00000454225 UBR1Q8IWV7 1749 aa39.31■■■■□ 3.88
CITED1-210ENST00000454225 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP39.28■■■■□ 3.88
CITED1-210ENST00000454225 TET3O43151 1660 aa39.28■■■■□ 3.88
CITED1-210ENST00000454225 SYNMO15061 1565 aa39.26■■■■□ 3.88
CITED1-210ENST00000454225 NOS1P29475 1434 aa39.25■■■■□ 3.87
CITED1-210ENST00000454225 PIK3C2BO00750 1634 aa39.25■■■■□ 3.87
CITED1-210ENST00000454225 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP39.24■■■■□ 3.87
CITED1-210ENST00000454225 GCC2Q8IWJ2 1684 aa39.22■■■■□ 3.87
CITED1-210ENST00000454225 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP39.22■■■■□ 3.87
CITED1-210ENST00000454225 MED14O60244 1454 aa39.2■■■■□ 3.87
CITED1-210ENST00000454225 IDI1Q13907 227 aa39.2■■■■□ 3.87
CITED1-210ENST00000454225 IQGAP3Q86VI3 1631 aa39.19■■■■□ 3.86
CITED1-210ENST00000454225 STAG3Q9UJ98 1225 aa39.19■■■■□ 3.86
CITED1-210ENST00000454225 NUP155O75694 1391 aa39.19■■■■□ 3.86
CITED1-210ENST00000454225 IQGAP1P46940 1657 aa39.15■■■■□ 3.86
CITED1-210ENST00000454225 SLIT1O75093 1534 aa39.14■■■■□ 3.86
CITED1-210ENST00000454225 ARHGAP23Q9P227 1491 aa39.14■■■■□ 3.86
CITED1-210ENST00000454225 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP39.13■■■■□ 3.85
CITED1-210ENST00000454225 E9PCH4 1651 aa39.12■■■■□ 3.85
CITED1-210ENST00000454225 SLC52A1Q9NWF4 448 aa39.11■■■■□ 3.85
CITED1-210ENST00000454225 NAIPQ13075 1403 aa39.11■■■■□ 3.85
CITED1-210ENST00000454225 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP39.1■■■■□ 3.85
CITED1-210ENST00000454225 TXNDC2Q86VQ3 553 aa39.1■■■■□ 3.85
CITED1-210ENST00000454225 LTKP29376 864 aa39.09■■■■□ 3.85
CITED1-210ENST00000454225 TMEM2Q9UHN6 1383 aa39.08■■■■□ 3.85
CITED1-210ENST00000454225 ADGRB3O60242 1522 aa39.08■■■■□ 3.85
CITED1-210ENST00000454225 IQSEC2Q5JU85 1478 aa39.07■■■■□ 3.85
CITED1-210ENST00000454225 EID1Q9Y6B2 187 aa39.06■■■■□ 3.84
CITED1-210ENST00000454225 HFM1A2PYH4 1435 aa39.01■■■■□ 3.84
CITED1-210ENST00000454225 CPS1P31327 1500 aa38.98■■■■□ 3.83
CITED1-210ENST00000454225 MYO5BQ9ULV0 1848 aa38.94■■■■□ 3.82
CITED1-210ENST00000454225 CHGAP10645 457 aaKnown RBP38.91■■■■□ 3.82
CITED1-210ENST00000454225 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa38.91■■■■□ 3.82
CITED1-210ENST00000454225 TRIM52Q96A61 297 aa38.87■■■■□ 3.81
CITED1-210ENST00000454225 STRCP1A6NGW2 1772 aa38.87■■■■□ 3.81
CITED1-210ENST00000454225 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa38.85■■■■□ 3.81
CITED1-210ENST00000454225 UBAP1LF5GYI3 381 aa38.84■■■■□ 3.81
CITED1-210ENST00000454225 ZFYVE9O95405 1425 aa38.83■■■■□ 3.81
CITED1-210ENST00000454225 RIMS2Q9UQ26 1411 aa38.83■■■■□ 3.81
CITED1-210ENST00000454225 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP38.78■■■■□ 3.8
CITED1-210ENST00000454225 BCANQ96GW7 911 aa38.77■■■■□ 3.8
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