RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM135AQ9P2D6 1515 aa41.21■■■■■ 4.19
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAST1Q9Y2H9 1570 aa41.2■■■■■ 4.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.17■■■■■ 4.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa41.14■■■■■ 4.18
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A2ML1A8K2U0 1454 aa41.09■■■■■ 4.17
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.93■■■■■ 4.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.92■■■■■ 4.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FGD6Q6ZV73 1430 aa40.91■■■■■ 4.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IQSEC2Q5JU85 1478 aa40.9■■■■■ 4.14
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MROH1Q8NDA8 1641 aa40.89■■■■■ 4.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIF15Q9NS87 1388 aa40.89■■■■■ 4.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DAPK1P53355 1430 aa40.86■■■■■ 4.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.84■■■■■ 4.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP40.83■■■■■ 4.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP40.83■■■■■ 4.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERBINQ96RT1 1412 aa40.81■■■■■ 4.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40.81■■■■■ 4.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CEP152O94986 1710 aa40.8■■■■■ 4.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa40.8■■■■■ 4.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.79■■■■■ 4.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERVK-7P63135 1459 aa40.77■■■■■ 4.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NEURL4Q96JN8 1562 aa40.77■■■■■ 4.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKLE2Q86XL3 938 aa40.76■■■■■ 4.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP40.74■■■■■ 4.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.71■■■■■ 4.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.71■■■■■ 4.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.67■■■■■ 4.1
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa40.65■■■■■ 4.1
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VWDEQ8N2E2 1590 aa40.52■■■■■ 4.08
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LMTK2Q8IWU2 1503 aa40.5■■■■■ 4.07
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DISP3Q9P2K9 1392 aa40.39■■■■■ 4.06
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.37■■■■■ 4.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LTKP29376 864 aa40.36■■■■■ 4.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STAG3Q9UJ98 1225 aa40.36■■■■■ 4.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TOM1O60784 492 aa40.34■■■■■ 4.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EID1Q9Y6B2 187 aa40.34■■■■■ 4.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IDI1Q13907 227 aa40.32■■■■■ 4.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SYNMO15061 1565 aa40.31■■■■■ 4.04
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NOS1P29475 1434 aa40.3■■■■■ 4.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STRCP1A6NGW2 1772 aa40.29■■■■■ 4.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIP4K2BP78356 416 aa40.28■■■■■ 4.04
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ROCK1Q13464 1354 aa40.22■■■■■ 4.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.21■■■■■ 4.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TET3O43151 1660 aa40.2■■■■■ 4.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.19■■■■■ 4.02
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADGRB3O60242 1522 aa40.18■■■■■ 4.02
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSPA1LP34931 641 aa40.14■■■■■ 4.02
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALKQ9UM73 1620 aa40.13■■■■■ 4.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.12■■■■■ 4.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ITGAEP38570 1179 aa40.12■■■■■ 4.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ILDR2Q71H61 639 aa40.11■■■■■ 4.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.02■■■■■ 4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC26A8Q96RN1 970 aa40.02■■■■■ 4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 E9PCH4 1651 aa40.01■■■■■ 4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUP155O75694 1391 aa39.98■■■■□ 3.99
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BCANQ96GW7 911 aa39.97■■■■□ 3.99
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP39.97■■■■□ 3.99
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYO5BQ9ULV0 1848 aa39.97■■■■□ 3.99
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