RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446817.1

HLA-V-202, Transcript of major histocompatibility complex, class I, V (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene HLA-V, Length 847 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-V-202ENST00000446817 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.28■■■■■ 4.2
HLA-V-202ENST00000446817 KIF3BO15066 747 aa41.27■■■■■ 4.2
HLA-V-202ENST00000446817 KDM5DQ9BY66 1539 aa41.26■■■■■ 4.2
HLA-V-202ENST00000446817 TNRQ92752 1358 aa41.25■■■■■ 4.19
HLA-V-202ENST00000446817 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.25■■■■■ 4.19
HLA-V-202ENST00000446817 FAM135AQ9P2D6 1515 aa41.23■■■■■ 4.19
HLA-V-202ENST00000446817 NCOA2Q15596 1464 aa41.21■■■■■ 4.19
HLA-V-202ENST00000446817 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41.2■■■■■ 4.19
HLA-V-202ENST00000446817 PZPP20742 1482 aa41.2■■■■■ 4.19
HLA-V-202ENST00000446817 NEURL4Q96JN8 1562 aa41.17■■■■■ 4.18
HLA-V-202ENST00000446817 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
HLA-V-202ENST00000446817 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.17■■■■■ 4.18
HLA-V-202ENST00000446817 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.15■■■■■ 4.18
HLA-V-202ENST00000446817 CPS1P31327 1500 aa41.13■■■■■ 4.18
HLA-V-202ENST00000446817 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.09■■■■■ 4.17
HLA-V-202ENST00000446817 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.09■■■■■ 4.17
HLA-V-202ENST00000446817 ANKLE2Q86XL3 938 aa41.07■■■■■ 4.17
HLA-V-202ENST00000446817 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.07■■■■■ 4.16
HLA-V-202ENST00000446817 PIP4K2BP78356 416 aa41.06■■■■■ 4.16
HLA-V-202ENST00000446817 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.05■■■■■ 4.16
HLA-V-202ENST00000446817 NLRP1Q9C000 1473 aa41.05■■■■■ 4.16
HLA-V-202ENST00000446817 TSPY4P0CV99 314 aa41.05■■■■■ 4.16
HLA-V-202ENST00000446817 TSPY10P0CW01 314 aa41.05■■■■■ 4.16
HLA-V-202ENST00000446817 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP41.04■■■■■ 4.16
HLA-V-202ENST00000446817 MIA2Q96PC5 1412 aa41.03■■■■■ 4.16
HLA-V-202ENST00000446817 TOM1O60784 492 aa41.03■■■■■ 4.16
HLA-V-202ENST00000446817 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.02■■■■■ 4.16
HLA-V-202ENST00000446817 DEPDC5O75140 1603 aa40.99■■■■■ 4.15
HLA-V-202ENST00000446817 HSPA1LP34931 641 aa40.98■■■■■ 4.15
HLA-V-202ENST00000446817 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
HLA-V-202ENST00000446817 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP40.97■■■■■ 4.15
HLA-V-202ENST00000446817 VWDEQ8N2E2 1590 aa40.97■■■■■ 4.15
HLA-V-202ENST00000446817 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP40.97■■■■■ 4.15
HLA-V-202ENST00000446817 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP40.96■■■■■ 4.15
HLA-V-202ENST00000446817 IQGAP1P46940 1657 aa40.95■■■■■ 4.15
HLA-V-202ENST00000446817 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP40.92■■■■■ 4.14
HLA-V-202ENST00000446817 MED14O60244 1454 aa40.91■■■■■ 4.14
HLA-V-202ENST00000446817 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.91■■■■■ 4.14
HLA-V-202ENST00000446817 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
HLA-V-202ENST00000446817 ABCC3O15438 1527 aa40.89■■■■■ 4.14
HLA-V-202ENST00000446817 CEP152O94986 1710 aa40.87■■■■■ 4.13
HLA-V-202ENST00000446817 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.86■■■■■ 4.13
HLA-V-202ENST00000446817 STRCP1A6NGW2 1772 aa40.81■■■■■ 4.12
HLA-V-202ENST00000446817 ERVK-7P63135 1459 aa40.8■■■■■ 4.12
HLA-V-202ENST00000446817 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.79■■■■■ 4.12
HLA-V-202ENST00000446817 MROH1Q8NDA8 1641 aa40.76■■■■■ 4.12
HLA-V-202ENST00000446817 UBR1Q8IWV7 1749 aa40.76■■■■■ 4.11
HLA-V-202ENST00000446817 SYNMO15061 1565 aa40.75■■■■■ 4.11
HLA-V-202ENST00000446817 ALKQ9UM73 1620 aa40.73■■■■■ 4.11
HLA-V-202ENST00000446817 MYOM3Q5VTT5 1437 aa40.69■■■■■ 4.1
HLA-V-202ENST00000446817 LRRC7Q96NW7 1537 aa40.69■■■■■ 4.1
HLA-V-202ENST00000446817 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.69■■■■■ 4.1
HLA-V-202ENST00000446817 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP40.69■■■■■ 4.1
HLA-V-202ENST00000446817 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
HLA-V-202ENST00000446817 MAP3K1Q13233 1512 aa40.63■■■■■ 4.1
HLA-V-202ENST00000446817 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.63■■■■■ 4.09
HLA-V-202ENST00000446817 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP40.62■■■■■ 4.09
HLA-V-202ENST00000446817 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.61■■■■■ 4.09
HLA-V-202ENST00000446817 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP40.57■■■■■ 4.08
HLA-V-202ENST00000446817 KIF15Q9NS87 1388 aa40.55■■■■■ 4.08
HLA-V-202ENST00000446817 SLIT1O75093 1534 aa40.52■■■■■ 4.08
HLA-V-202ENST00000446817 TXNDC2Q86VQ3 553 aa40.52■■■■■ 4.08
HLA-V-202ENST00000446817 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP40.51■■■■■ 4.08
HLA-V-202ENST00000446817 ARHGAP23Q9P227 1491 aa40.51■■■■■ 4.07
HLA-V-202ENST00000446817 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa40.5■■■■■ 4.07
HLA-V-202ENST00000446817 ERBINQ96RT1 1412 aa40.5■■■■■ 4.07
HLA-V-202ENST00000446817 PIK3C2BO00750 1634 aa40.49■■■■■ 4.07
HLA-V-202ENST00000446817 EID1Q9Y6B2 187 aa40.49■■■■■ 4.07
HLA-V-202ENST00000446817 PTPN23Q9H3S7 1636 aa40.49■■■■■ 4.07
HLA-V-202ENST00000446817 LTKP29376 864 aa40.48■■■■■ 4.07
HLA-V-202ENST00000446817 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.48■■■■■ 4.07
HLA-V-202ENST00000446817 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.47■■■■■ 4.07
HLA-V-202ENST00000446817 STAG3Q9UJ98 1225 aa40.44■■■■■ 4.06
HLA-V-202ENST00000446817 ABCC5O15440 1437 aa40.43■■■■■ 4.06
HLA-V-202ENST00000446817 KANK1Q14678 1352 aa40.43■■■■■ 4.06
HLA-V-202ENST00000446817 APLP2Q06481 763 aa40.38■■■■■ 4.05
HLA-V-202ENST00000446817 DAPK1P53355 1430 aa40.36■■■■■ 4.05
HLA-V-202ENST00000446817 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP40.36■■■■■ 4.05
HLA-V-202ENST00000446817 TMEM2Q9UHN6 1383 aa40.35■■■■■ 4.05
HLA-V-202ENST00000446817 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.33■■■■■ 4.05
HLA-V-202ENST00000446817 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.26■■■■■ 4.04
HLA-V-202ENST00000446817 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.26■■■■■ 4.04
HLA-V-202ENST00000446817 LMTK2Q8IWU2 1503 aa40.26■■■■■ 4.03
HLA-V-202ENST00000446817 FGD6Q6ZV73 1430 aa40.25■■■■■ 4.03
HLA-V-202ENST00000446817 IDI1Q13907 227 aa40.22■■■■■ 4.03
HLA-V-202ENST00000446817 TMEM94Q12767 1356 aa40.22■■■■■ 4.03
HLA-V-202ENST00000446817 FAM135BQ49AJ0 1406 aa40.19■■■■■ 4.02
HLA-V-202ENST00000446817 ADGRB3O60242 1522 aa40.18■■■■■ 4.02
HLA-V-202ENST00000446817 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa40.18■■■■■ 4.02
HLA-V-202ENST00000446817 KCNA6P17658 529 aa40.17■■■■■ 4.02
HLA-V-202ENST00000446817 SLC26A8Q96RN1 970 aa40.17■■■■■ 4.02
HLA-V-202ENST00000446817 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
HLA-V-202ENST00000446817 TET3O43151 1660 aa40.15■■■■■ 4.02
HLA-V-202ENST00000446817 BCANQ96GW7 911 aa40.14■■■■■ 4.02
HLA-V-202ENST00000446817 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP40.12■■■■■ 4.01
HLA-V-202ENST00000446817 MYO5BQ9ULV0 1848 aa40.12■■■■■ 4.01
HLA-V-202ENST00000446817 NOS1P29475 1434 aa40.11■■■■■ 4.01
HLA-V-202ENST00000446817 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP40.09■■■■■ 4.01
HLA-V-202ENST00000446817 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP40.08■■■■■ 4.01
HLA-V-202ENST00000446817 NWD1Q149M9 1564 aa40.08■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms