RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446745.2

LTB-211, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 853 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-211ENST00000446745 PTPRKQ15262 1439 aa32.64■■■□□ 2.82
LTB-211ENST00000446745 DUOX2Q9NRD8 1548 aa32.63■■■□□ 2.81
LTB-211ENST00000446745 ABCC5O15440 1437 aa32.63■■■□□ 2.81
LTB-211ENST00000446745 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP32.62■■■□□ 2.81
LTB-211ENST00000446745 DAPK1P53355 1430 aa32.61■■■□□ 2.81
LTB-211ENST00000446745 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP32.61■■■□□ 2.81
LTB-211ENST00000446745 MYO3AQ8NEV4 1616 aa32.59■■■□□ 2.81
LTB-211ENST00000446745 STRCQ7RTU9 1775 aa32.58■■■□□ 2.81
LTB-211ENST00000446745 KIF15Q9NS87 1388 aa32.58■■■□□ 2.81
LTB-211ENST00000446745 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP32.56■■■□□ 2.8
LTB-211ENST00000446745 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP32.56■■■□□ 2.8
LTB-211ENST00000446745 PZPP20742 1482 aa32.55■■■□□ 2.8
LTB-211ENST00000446745 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP32.55■■■□□ 2.8
LTB-211ENST00000446745 ERBINQ96RT1 1412 aa32.53■■■□□ 2.8
LTB-211ENST00000446745 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa32.52■■■□□ 2.8
LTB-211ENST00000446745 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP32.52■■■□□ 2.8
LTB-211ENST00000446745 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.79
LTB-211ENST00000446745 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa32.51■■■□□ 2.79
LTB-211ENST00000446745 NCOA1Q15788 1441 aa32.51■■■□□ 2.79
LTB-211ENST00000446745 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa32.5■■■□□ 2.79
LTB-211ENST00000446745 TNRQ92752 1358 aa32.48■■■□□ 2.79
LTB-211ENST00000446745 PTPRTO14522 1441 aa32.48■■■□□ 2.79
LTB-211ENST00000446745 ABCC3O15438 1527 aa32.47■■■□□ 2.79
LTB-211ENST00000446745 CHIC2Q9UKJ5 165 aa32.45■■■□□ 2.79
LTB-211ENST00000446745 A2ML1A8K2U0 1454 aa32.45■■■□□ 2.79
LTB-211ENST00000446745 MROH1Q8NDA8 1641 aa32.44■■■□□ 2.78
LTB-211ENST00000446745 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP32.43■■■□□ 2.78
LTB-211ENST00000446745 FBXO41Q8TF61 875 aa32.43■■■□□ 2.78
LTB-211ENST00000446745 PLA2R1Q13018 1463 aa32.42■■■□□ 2.78
LTB-211ENST00000446745 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP32.41■■■□□ 2.78
LTB-211ENST00000446745 PKD2Q13563 968 aa32.39■■■□□ 2.78
LTB-211ENST00000446745 KANK1Q14678 1352 aa32.39■■■□□ 2.78
LTB-211ENST00000446745 ADGRL2O95490 1459 aa32.39■■■□□ 2.78
LTB-211ENST00000446745 CEP152O94986 1710 aa32.39■■■□□ 2.78
LTB-211ENST00000446745 NLRP1Q9C000 1473 aa32.38■■■□□ 2.77
LTB-211ENST00000446745 DEPDC5O75140 1603 aa32.36■■■□□ 2.77
LTB-211ENST00000446745 CERKQ8TCT0 537 aa32.35■■■□□ 2.77
LTB-211ENST00000446745 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP32.33■■■□□ 2.77
LTB-211ENST00000446745 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa32.32■■■□□ 2.77
LTB-211ENST00000446745 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa32.32■■■□□ 2.76
LTB-211ENST00000446745 ERVK-7P63135 1459 aa32.3■■■□□ 2.76
LTB-211ENST00000446745 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP32.29■■■□□ 2.76
LTB-211ENST00000446745 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa32.28■■■□□ 2.76
LTB-211ENST00000446745 UGGT1Q9NYU2 1555 aa32.27■■■□□ 2.76
LTB-211ENST00000446745 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
LTB-211ENST00000446745 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
LTB-211ENST00000446745 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa32.25■■■□□ 2.75
LTB-211ENST00000446745 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
LTB-211ENST00000446745 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP32.23■■■□□ 2.75
LTB-211ENST00000446745 LMTK2Q8IWU2 1503 aa32.21■■■□□ 2.75
LTB-211ENST00000446745 ROCK1Q13464 1354 aa32.2■■■□□ 2.75
LTB-211ENST00000446745 ANKLE2Q86XL3 938 aa32.2■■■□□ 2.75
LTB-211ENST00000446745 VWDEQ8N2E2 1590 aa32.19■■■□□ 2.74
LTB-211ENST00000446745 LTBP4Q8N2S1 1624 aa32.14■■■□□ 2.74
LTB-211ENST00000446745 ITGAEP38570 1179 aa32.12■■■□□ 2.73
LTB-211ENST00000446745 EFCAB6Q5THR3 1501 aa32.11■■■□□ 2.73
LTB-211ENST00000446745 NEURL4Q96JN8 1562 aa32.1■■■□□ 2.73
LTB-211ENST00000446745 IQSEC2Q5JU85 1478 aa32.1■■■□□ 2.73
LTB-211ENST00000446745 UBR1Q8IWV7 1749 aa32.09■■■□□ 2.73
LTB-211ENST00000446745 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP32.07■■■□□ 2.72
LTB-211ENST00000446745 UNC13BO14795 1591 aa32.07■■■□□ 2.72
LTB-211ENST00000446745 MED14O60244 1454 aa32.05■■■□□ 2.72
LTB-211ENST00000446745 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP32.05■■■□□ 2.72
LTB-211ENST00000446745 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP32.04■■■□□ 2.72
LTB-211ENST00000446745 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP32.04■■■□□ 2.72
LTB-211ENST00000446745 STAG3Q9UJ98 1225 aa32.04■■■□□ 2.72
LTB-211ENST00000446745 TET3O43151 1660 aa32.04■■■□□ 2.72
LTB-211ENST00000446745 IQGAP1P46940 1657 aa32.01■■■□□ 2.71
LTB-211ENST00000446745 PIK3C2BO00750 1634 aa32■■■□□ 2.71
LTB-211ENST00000446745 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP32■■■□□ 2.71
LTB-211ENST00000446745 GCC2Q8IWJ2 1684 aa32■■■□□ 2.71
LTB-211ENST00000446745 NOS1P29475 1434 aa31.99■■■□□ 2.71
LTB-211ENST00000446745 SLIT1O75093 1534 aa31.97■■■□□ 2.71
LTB-211ENST00000446745 SLC52A1Q9NWF4 448 aa31.97■■■□□ 2.71
LTB-211ENST00000446745 EID1Q9Y6B2 187 aa31.97■■■□□ 2.71
LTB-211ENST00000446745 SYNMO15061 1565 aa31.97■■■□□ 2.71
LTB-211ENST00000446745 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
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LTB-211ENST00000446745 CPS1P31327 1500 aa31.95■■■□□ 2.7
LTB-211ENST00000446745 IQGAP3Q86VI3 1631 aa31.94■■■□□ 2.7
LTB-211ENST00000446745 IDI1Q13907 227 aa31.94■■■□□ 2.7
LTB-211ENST00000446745 TXNDC2Q86VQ3 553 aa31.93■■■□□ 2.7
LTB-211ENST00000446745 NUP155O75694 1391 aa31.91■■■□□ 2.7
LTB-211ENST00000446745 TMEM2Q9UHN6 1383 aa31.91■■■□□ 2.7
LTB-211ENST00000446745 ADGRB3O60242 1522 aa31.9■■■□□ 2.7
LTB-211ENST00000446745 E9PCH4 1651 aa31.86■■■□□ 2.69
LTB-211ENST00000446745 LTKP29376 864 aa31.85■■■□□ 2.69
LTB-211ENST00000446745 UBAP1LF5GYI3 381 aa31.81■■■□□ 2.68
LTB-211ENST00000446745 NAIPQ13075 1403 aa31.77■■■□□ 2.68
LTB-211ENST00000446745 HDGFP51858 240 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
LTB-211ENST00000446745 HFM1A2PYH4 1435 aa31.73■■■□□ 2.67
LTB-211ENST00000446745 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa31.72■■■□□ 2.67
LTB-211ENST00000446745 CHGAP10645 457 aaKnown RBP31.72■■■□□ 2.67
LTB-211ENST00000446745 MYO5BQ9ULV0 1848 aa31.71■■■□□ 2.67
LTB-211ENST00000446745 TOM1O60784 492 aa31.71■■■□□ 2.67
LTB-211ENST00000446745 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP31.69■■■□□ 2.66
LTB-211ENST00000446745 BCANQ96GW7 911 aa31.69■■■□□ 2.66
LTB-211ENST00000446745 STRCP1A6NGW2 1772 aa31.68■■■□□ 2.66
LTB-211ENST00000446745 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa31.67■■■□□ 2.66
LTB-211ENST00000446745 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP31.67■■■□□ 2.66
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