RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445283.1

LIN28AP2-201, Transcript of LIN28A pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene LIN28AP2, Length 458 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AP2-201ENST00000445283 A2MP01023 1474 aa11.29□□□□□ -0.6
LIN28AP2-201ENST00000445283 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
LIN28AP2-201ENST00000445283 FAM135AQ9P2D6 1515 aa11.29□□□□□ -0.6
LIN28AP2-201ENST00000445283 ADGBQ8N7X0 1667 aa11.28□□□□□ -0.6
LIN28AP2-201ENST00000445283 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa11.28□□□□□ -0.6
LIN28AP2-201ENST00000445283 PTPRKQ15262 1439 aa11.27□□□□□ -0.6
LIN28AP2-201ENST00000445283 NCOA1Q15788 1441 aa11.27□□□□□ -0.6
LIN28AP2-201ENST00000445283 C3P01024 1663 aa11.27□□□□□ -0.6
LIN28AP2-201ENST00000445283 GGT6Q6P531 493 aa11.27□□□□□ -0.61
LIN28AP2-201ENST00000445283 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa11.26□□□□□ -0.61
LIN28AP2-201ENST00000445283 IQSEC2Q5JU85 1478 aa11.26□□□□□ -0.61
LIN28AP2-201ENST00000445283 HRCP23327 699 aa11.26□□□□□ -0.61
LIN28AP2-201ENST00000445283 CROCC2H7BZ55 1655 aa11.26□□□□□ -0.61
LIN28AP2-201ENST00000445283 HFM1A2PYH4 1435 aa11.26□□□□□ -0.61
LIN28AP2-201ENST00000445283 PLXNC1O60486 1568 aa11.25□□□□□ -0.61
LIN28AP2-201ENST00000445283 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
LIN28AP2-201ENST00000445283 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
LIN28AP2-201ENST00000445283 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa11.23□□□□□ -0.61
LIN28AP2-201ENST00000445283 PLA2R1Q13018 1463 aa11.22□□□□□ -0.61
LIN28AP2-201ENST00000445283 NAIPQ13075 1403 aa11.22□□□□□ -0.61
LIN28AP2-201ENST00000445283 KIF15Q9NS87 1388 aa11.22□□□□□ -0.61
LIN28AP2-201ENST00000445283 DUOX2Q9NRD8 1548 aa11.21□□□□□ -0.61
LIN28AP2-201ENST00000445283 ERBINQ96RT1 1412 aa11.21□□□□□ -0.61
LIN28AP2-201ENST00000445283 KIF3BO15066 747 aa11.21□□□□□ -0.61
LIN28AP2-201ENST00000445283 ITGAEP38570 1179 aa11.21□□□□□ -0.61
LIN28AP2-201ENST00000445283 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
LIN28AP2-201ENST00000445283 CHIC2Q9UKJ5 165 aa11.21□□□□□ -0.61
LIN28AP2-201ENST00000445283 SETD5Q9C0A6 1442 aa11.2□□□□□ -0.62
LIN28AP2-201ENST00000445283 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa11.19□□□□□ -0.62
LIN28AP2-201ENST00000445283 STRCQ7RTU9 1775 aa11.19□□□□□ -0.62
LIN28AP2-201ENST00000445283 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
LIN28AP2-201ENST00000445283 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa11.18□□□□□ -0.62
LIN28AP2-201ENST00000445283 ANKLE2Q86XL3 938 aa11.18□□□□□ -0.62
LIN28AP2-201ENST00000445283 PCGF6Q9BYE7 350 aa11.18□□□□□ -0.62
LIN28AP2-201ENST00000445283 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa11.18□□□□□ -0.62
LIN28AP2-201ENST00000445283 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
LIN28AP2-201ENST00000445283 GCC2Q8IWJ2 1684 aa11.17□□□□□ -0.62
LIN28AP2-201ENST00000445283 KDM5DQ9BY66 1539 aa11.16□□□□□ -0.62
LIN28AP2-201ENST00000445283 A2ML1A8K2U0 1454 aa11.16□□□□□ -0.62
LIN28AP2-201ENST00000445283 NLRP1Q9C000 1473 aa11.16□□□□□ -0.62
LIN28AP2-201ENST00000445283 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
LIN28AP2-201ENST00000445283 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
LIN28AP2-201ENST00000445283 TNRQ92752 1358 aa11.15□□□□□ -0.63
LIN28AP2-201ENST00000445283 PZPP20742 1482 aa11.14□□□□□ -0.63
LIN28AP2-201ENST00000445283 TOM1O60784 492 aa11.14□□□□□ -0.63
LIN28AP2-201ENST00000445283 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa11.14□□□□□ -0.63
LIN28AP2-201ENST00000445283 MYO3AQ8NEV4 1616 aa11.13□□□□□ -0.63
LIN28AP2-201ENST00000445283 KANK1Q14678 1352 aa11.13□□□□□ -0.63
LIN28AP2-201ENST00000445283 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa11.12□□□□□ -0.63
LIN28AP2-201ENST00000445283 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
LIN28AP2-201ENST00000445283 CPS1P31327 1500 aa11.1□□□□□ -0.63
LIN28AP2-201ENST00000445283 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
LIN28AP2-201ENST00000445283 UBAP1LF5GYI3 381 aa11.1□□□□□ -0.63
LIN28AP2-201ENST00000445283 DEPDC5O75140 1603 aa11.09□□□□□ -0.63
LIN28AP2-201ENST00000445283 UNC13BO14795 1591 aa11.09□□□□□ -0.63
LIN28AP2-201ENST00000445283 EID1Q9Y6B2 187 aa11.09□□□□□ -0.63
LIN28AP2-201ENST00000445283 LTBP4Q8N2S1 1624 aa11.09□□□□□ -0.63
LIN28AP2-201ENST00000445283 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
LIN28AP2-201ENST00000445283 VWDEQ8N2E2 1590 aa11.08□□□□□ -0.64
LIN28AP2-201ENST00000445283 UGGT1Q9NYU2 1555 aa11.08□□□□□ -0.64
LIN28AP2-201ENST00000445283 DISP3Q9P2K9 1392 aa11.08□□□□□ -0.64
LIN28AP2-201ENST00000445283 HDGFP51858 240 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
LIN28AP2-201ENST00000445283 STAG3Q9UJ98 1225 aa11.07□□□□□ -0.64
LIN28AP2-201ENST00000445283 LMTK2Q8IWU2 1503 aa11.07□□□□□ -0.64
LIN28AP2-201ENST00000445283 NUP155O75694 1391 aa11.06□□□□□ -0.64
LIN28AP2-201ENST00000445283 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
LIN28AP2-201ENST00000445283 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
LIN28AP2-201ENST00000445283 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
LIN28AP2-201ENST00000445283 MROH1Q8NDA8 1641 aa11.05□□□□□ -0.64
LIN28AP2-201ENST00000445283 MED14O60244 1454 aa11.05□□□□□ -0.64
LIN28AP2-201ENST00000445283 CLSPNQ9HAW4 1339 aa11.05□□□□□ -0.64
LIN28AP2-201ENST00000445283 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa11.04□□□□□ -0.64
LIN28AP2-201ENST00000445283 TRIM52Q96A61 297 aa11.04□□□□□ -0.64
LIN28AP2-201ENST00000445283 IQGAP3Q86VI3 1631 aa11.04□□□□□ -0.64
LIN28AP2-201ENST00000445283 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
LIN28AP2-201ENST00000445283 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
LIN28AP2-201ENST00000445283 MPHOSPH9Q99550 1183 aa11.02□□□□□ -0.65
LIN28AP2-201ENST00000445283 SLC52A1Q9NWF4 448 aa11.02□□□□□ -0.65
LIN28AP2-201ENST00000445283 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa11.02□□□□□ -0.65
LIN28AP2-201ENST00000445283 ABCC3O15438 1527 aa11.01□□□□□ -0.65
LIN28AP2-201ENST00000445283 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
LIN28AP2-201ENST00000445283 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
LIN28AP2-201ENST00000445283 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
LIN28AP2-201ENST00000445283 SOCS7O14512 581 aa11□□□□□ -0.65
LIN28AP2-201ENST00000445283 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP11□□□□□ -0.65
LIN28AP2-201ENST00000445283 ERVK-7P63135 1459 aa11□□□□□ -0.65
LIN28AP2-201ENST00000445283 TET3O43151 1660 aa10.99□□□□□ -0.65
LIN28AP2-201ENST00000445283 TXNDC2Q86VQ3 553 aa10.99□□□□□ -0.65
LIN28AP2-201ENST00000445283 EFCAB6Q5THR3 1501 aa10.99□□□□□ -0.65
LIN28AP2-201ENST00000445283 IQGAP1P46940 1657 aa10.98□□□□□ -0.65
LIN28AP2-201ENST00000445283 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
LIN28AP2-201ENST00000445283 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
LIN28AP2-201ENST00000445283 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa10.96□□□□□ -0.65
LIN28AP2-201ENST00000445283 PIP4K2BP78356 416 aa10.96□□□□□ -0.65
LIN28AP2-201ENST00000445283 SYNMO15061 1565 aa10.95□□□□□ -0.66
LIN28AP2-201ENST00000445283 SLIT1O75093 1534 aa10.95□□□□□ -0.66
LIN28AP2-201ENST00000445283 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP10.95□□□□□ -0.66
LIN28AP2-201ENST00000445283 NEURL4Q96JN8 1562 aa10.94□□□□□ -0.66
LIN28AP2-201ENST00000445283 NOS1P29475 1434 aa10.94□□□□□ -0.66
LIN28AP2-201ENST00000445283 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.3 ms