RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444999.5

UPP1-209, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 2

Gene UPP1, Length 869 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-209ENST00000444999 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.15■■■□□ 2.26
UPP1-209ENST00000444999 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
UPP1-209ENST00000444999 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.15■■■□□ 2.26
UPP1-209ENST00000444999 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
UPP1-209ENST00000444999 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
UPP1-209ENST00000444999 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.11■■■□□ 2.25
UPP1-209ENST00000444999 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.1■■■□□ 2.25
UPP1-209ENST00000444999 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.1■■■□□ 2.25
UPP1-209ENST00000444999 PZPP20742 1482 aa29.09■■■□□ 2.25
UPP1-209ENST00000444999 ABCC5O15440 1437 aa29.08■■■□□ 2.25
UPP1-209ENST00000444999 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
UPP1-209ENST00000444999 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.06■■■□□ 2.24
UPP1-209ENST00000444999 TNRQ92752 1358 aa29.06■■■□□ 2.24
UPP1-209ENST00000444999 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.05■■■□□ 2.24
UPP1-209ENST00000444999 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
UPP1-209ENST00000444999 PLA2R1Q13018 1463 aa29.04■■■□□ 2.24
UPP1-209ENST00000444999 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.02■■■□□ 2.24
UPP1-209ENST00000444999 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
UPP1-209ENST00000444999 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.02■■■□□ 2.24
UPP1-209ENST00000444999 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
UPP1-209ENST00000444999 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.02■■■□□ 2.24
UPP1-209ENST00000444999 DAPK1P53355 1430 aa29.02■■■□□ 2.24
UPP1-209ENST00000444999 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.02■■■□□ 2.24
UPP1-209ENST00000444999 ABCC3O15438 1527 aa29.01■■■□□ 2.23
UPP1-209ENST00000444999 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.01■■■□□ 2.23
UPP1-209ENST00000444999 PKD2Q13563 968 aa29■■■□□ 2.23
UPP1-209ENST00000444999 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29■■■□□ 2.23
UPP1-209ENST00000444999 KIF15Q9NS87 1388 aa29■■■□□ 2.23
UPP1-209ENST00000444999 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
UPP1-209ENST00000444999 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.94■■■□□ 2.22
UPP1-209ENST00000444999 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
UPP1-209ENST00000444999 CEP152O94986 1710 aa28.92■■■□□ 2.22
UPP1-209ENST00000444999 ERBINQ96RT1 1412 aa28.91■■■□□ 2.22
UPP1-209ENST00000444999 NLRP1Q9C000 1473 aa28.9■■■□□ 2.22
UPP1-209ENST00000444999 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.89■■■□□ 2.22
UPP1-209ENST00000444999 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.88■■■□□ 2.21
UPP1-209ENST00000444999 ERVK-7P63135 1459 aa28.87■■■□□ 2.21
UPP1-209ENST00000444999 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
UPP1-209ENST00000444999 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.87■■■□□ 2.21
UPP1-209ENST00000444999 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
UPP1-209ENST00000444999 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.86■■■□□ 2.21
UPP1-209ENST00000444999 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.86■■■□□ 2.21
UPP1-209ENST00000444999 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.85■■■□□ 2.21
UPP1-209ENST00000444999 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
UPP1-209ENST00000444999 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
UPP1-209ENST00000444999 DEPDC5O75140 1603 aa28.82■■■□□ 2.2
UPP1-209ENST00000444999 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.81■■■□□ 2.2
UPP1-209ENST00000444999 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.8■■■□□ 2.2
UPP1-209ENST00000444999 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
UPP1-209ENST00000444999 ADGRL2O95490 1459 aa28.78■■■□□ 2.2
UPP1-209ENST00000444999 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.78■■■□□ 2.2
UPP1-209ENST00000444999 KANK1Q14678 1352 aa28.75■■■□□ 2.19
UPP1-209ENST00000444999 MED14O60244 1454 aa28.72■■■□□ 2.19
UPP1-209ENST00000444999 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.72■■■□□ 2.19
UPP1-209ENST00000444999 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
UPP1-209ENST00000444999 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
UPP1-209ENST00000444999 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.71■■■□□ 2.19
UPP1-209ENST00000444999 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.7■■■□□ 2.19
UPP1-209ENST00000444999 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.67■■■□□ 2.18
UPP1-209ENST00000444999 UBAP1LF5GYI3 381 aa28.65■■■□□ 2.18
UPP1-209ENST00000444999 IQGAP1P46940 1657 aa28.64■■■□□ 2.18
UPP1-209ENST00000444999 PIK3C2BO00750 1634 aa28.62■■■□□ 2.17
UPP1-209ENST00000444999 CPS1P31327 1500 aa28.61■■■□□ 2.17
UPP1-209ENST00000444999 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.61■■■□□ 2.17
UPP1-209ENST00000444999 LTKP29376 864 aa28.61■■■□□ 2.17
UPP1-209ENST00000444999 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.6■■■□□ 2.17
UPP1-209ENST00000444999 SLIT1O75093 1534 aa28.59■■■□□ 2.17
UPP1-209ENST00000444999 SYNMO15061 1565 aa28.59■■■□□ 2.17
UPP1-209ENST00000444999 IDI1Q13907 227 aa28.59■■■□□ 2.17
UPP1-209ENST00000444999 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
UPP1-209ENST00000444999 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.58■■■□□ 2.17
UPP1-209ENST00000444999 NOS1P29475 1434 aa28.57■■■□□ 2.16
UPP1-209ENST00000444999 ITGAEP38570 1179 aa28.55■■■□□ 2.16
UPP1-209ENST00000444999 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.55■■■□□ 2.16
UPP1-209ENST00000444999 ROCK1Q13464 1354 aa28.54■■■□□ 2.16
UPP1-209ENST00000444999 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.53■■■□□ 2.16
UPP1-209ENST00000444999 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.53■■■□□ 2.16
UPP1-209ENST00000444999 EID1Q9Y6B2 187 aa28.51■■■□□ 2.15
UPP1-209ENST00000444999 UNC13BO14795 1591 aa28.5■■■□□ 2.15
UPP1-209ENST00000444999 TET3O43151 1660 aa28.48■■■□□ 2.15
UPP1-209ENST00000444999 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
UPP1-209ENST00000444999 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
UPP1-209ENST00000444999 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.46■■■□□ 2.15
UPP1-209ENST00000444999 ADGRB3O60242 1522 aa28.45■■■□□ 2.15
UPP1-209ENST00000444999 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.45■■■□□ 2.15
UPP1-209ENST00000444999 PIP4K2BP78356 416 aa28.45■■■□□ 2.14
UPP1-209ENST00000444999 TOM1O60784 492 aa28.44■■■□□ 2.14
UPP1-209ENST00000444999 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
UPP1-209ENST00000444999 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.42■■■□□ 2.14
UPP1-209ENST00000444999 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.42■■■□□ 2.14
UPP1-209ENST00000444999 ALKQ9UM73 1620 aa28.4■■■□□ 2.14
UPP1-209ENST00000444999 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.39■■■□□ 2.13
UPP1-209ENST00000444999 E9PCH4 1651 aa28.38■■■□□ 2.13
UPP1-209ENST00000444999 NUP155O75694 1391 aa28.37■■■□□ 2.13
UPP1-209ENST00000444999 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
UPP1-209ENST00000444999 HSPA1LP34931 641 aa28.36■■■□□ 2.13
UPP1-209ENST00000444999 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.36■■■□□ 2.13
UPP1-209ENST00000444999 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
UPP1-209ENST00000444999 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.33■■■□□ 2.13
UPP1-209ENST00000444999 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms