RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444973.5

NEK6-209, Transcript of NIMA related kinase 6, humanhuman

TSL 5

Gene NEK6, Length 790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK6-209ENST00000444973 A2ML1A8K2U0 1454 aa44.91■■■■■ 4.78
NEK6-209ENST00000444973 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP44.9■■■■■ 4.78
NEK6-209ENST00000444973 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP44.9■■■■■ 4.78
NEK6-209ENST00000444973 TSPY4P0CV99 314 aa44.88■■■■■ 4.78
NEK6-209ENST00000444973 TSPY10P0CW01 314 aa44.88■■■■■ 4.78
NEK6-209ENST00000444973 IQSEC2Q5JU85 1478 aa44.87■■■■■ 4.77
NEK6-209ENST00000444973 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP44.87■■■■■ 4.77
NEK6-209ENST00000444973 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa44.86■■■■■ 4.77
NEK6-209ENST00000444973 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP44.86■■■■■ 4.77
NEK6-209ENST00000444973 TNRQ92752 1358 aa44.85■■■■■ 4.77
NEK6-209ENST00000444973 PZPP20742 1482 aa44.85■■■■■ 4.77
NEK6-209ENST00000444973 FAM135AQ9P2D6 1515 aa44.84■■■■■ 4.77
NEK6-209ENST00000444973 MAP3K1Q13233 1512 aa44.77■■■■■ 4.76
NEK6-209ENST00000444973 MAST1Q9Y2H9 1570 aa44.74■■■■■ 4.75
NEK6-209ENST00000444973 MYOM3Q5VTT5 1437 aa44.73■■■■■ 4.75
NEK6-209ENST00000444973 DISP3Q9P2K9 1392 aa44.69■■■■■ 4.74
NEK6-209ENST00000444973 MIA2Q96PC5 1412 aa44.68■■■■■ 4.74
NEK6-209ENST00000444973 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP44.68■■■■■ 4.74
NEK6-209ENST00000444973 NEURL4Q96JN8 1562 aa44.65■■■■■ 4.74
NEK6-209ENST00000444973 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP44.64■■■■■ 4.74
NEK6-209ENST00000444973 ABCC3O15438 1527 aa44.62■■■■■ 4.73
NEK6-209ENST00000444973 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP44.62■■■■■ 4.731e-7■■■■■ 59.4
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NEK6-209ENST00000444973 UBAP1LF5GYI3 381 aa44.61■■■■■ 4.73
NEK6-209ENST00000444973 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP44.58■■■■■ 4.73
NEK6-209ENST00000444973 UGGT1Q9NYU2 1555 aa44.56■■■■■ 4.72
NEK6-209ENST00000444973 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP44.55■■■■■ 4.72
NEK6-209ENST00000444973 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP44.55■■■■■ 4.72
NEK6-209ENST00000444973 MROH1Q8NDA8 1641 aa44.54■■■■■ 4.72
NEK6-209ENST00000444973 ANKLE2Q86XL3 938 aa44.53■■■■■ 4.72
NEK6-209ENST00000444973 DUOX2Q9NRD8 1548 aa44.5■■■■■ 4.71
NEK6-209ENST00000444973 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa44.49■■■■■ 4.71
NEK6-209ENST00000444973 ILDR2Q71H61 639 aa44.49■■■■■ 4.71
NEK6-209ENST00000444973 ERVK-7P63135 1459 aa44.47■■■■■ 4.71
NEK6-209ENST00000444973 APLP2Q06481 763 aa44.46■■■■■ 4.71
NEK6-209ENST00000444973 CEP152O94986 1710 aa44.46■■■■■ 4.71
NEK6-209ENST00000444973 SHANK2Q9UPX8 1470 aa44.45■■■■■ 4.71
NEK6-209ENST00000444973 ABCC5O15440 1437 aa44.44■■■■■ 4.7
NEK6-209ENST00000444973 KIF15Q9NS87 1388 aa44.43■■■■■ 4.7
NEK6-209ENST00000444973 PTPN23Q9H3S7 1636 aa44.43■■■■■ 4.7
NEK6-209ENST00000444973 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP44.42■■■■■ 4.7
NEK6-209ENST00000444973 CPS1P31327 1500 aa44.42■■■■■ 4.7
NEK6-209ENST00000444973 CROCC2H7BZ55 1655 aa44.42■■■■■ 4.7
NEK6-209ENST00000444973 DEPDC5O75140 1603 aa44.4■■■■■ 4.7
NEK6-209ENST00000444973 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa44.39■■■■■ 4.7
NEK6-209ENST00000444973 MED14O60244 1454 aa44.39■■■■■ 4.7
NEK6-209ENST00000444973 VWDEQ8N2E2 1590 aa44.38■■■■■ 4.69
NEK6-209ENST00000444973 DAPK1P53355 1430 aa44.33■■■■■ 4.69
NEK6-209ENST00000444973 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP44.33■■■■■ 4.69
NEK6-209ENST00000444973 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP44.33■■■■■ 4.69
NEK6-209ENST00000444973 ERBINQ96RT1 1412 aa44.33■■■■■ 4.69
NEK6-209ENST00000444973 IQGAP1P46940 1657 aa44.32■■■■■ 4.69
NEK6-209ENST00000444973 FGD6Q6ZV73 1430 aa44.32■■■■■ 4.68
NEK6-209ENST00000444973 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP44.3■■■■■ 4.68
NEK6-209ENST00000444973 PIP4K2BP78356 416 aa44.28■■■■■ 4.68
NEK6-209ENST00000444973 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP44.27■■■■■ 4.683e-12■■□□□ 12.4
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NEK6-209ENST00000444973 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa44.23■■■■■ 4.67
NEK6-209ENST00000444973 TOM1O60784 492 aa44.22■■■■■ 4.67
NEK6-209ENST00000444973 CHIC2Q9UKJ5 165 aa44.22■■■■■ 4.67
NEK6-209ENST00000444973 SOCS7O14512 581 aa44.16■■■■■ 4.66
NEK6-209ENST00000444973 HSPA1LP34931 641 aa44.16■■■■■ 4.66
NEK6-209ENST00000444973 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa44.15■■■■■ 4.66
NEK6-209ENST00000444973 STRCP1A6NGW2 1772 aa44.15■■■■■ 4.66
NEK6-209ENST00000444973 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP44.15■■■■■ 4.66
NEK6-209ENST00000444973 KANK1Q14678 1352 aa44.13■■■■■ 4.65
NEK6-209ENST00000444973 ARHGAP23Q9P227 1491 aa44.1■■■■■ 4.65
NEK6-209ENST00000444973 LTKP29376 864 aa44.1■■■■■ 4.65
NEK6-209ENST00000444973 SLIT1O75093 1534 aa44.09■■■■■ 4.65
NEK6-209ENST00000444973 TXNDC2Q86VQ3 553 aa44.08■■■■■ 4.65
NEK6-209ENST00000444973 ALKQ9UM73 1620 aa44.08■■■■■ 4.65
NEK6-209ENST00000444973 LRRC7Q96NW7 1537 aa44.08■■■■■ 4.65
NEK6-209ENST00000444973 PIK3C2BO00750 1634 aa44.06■■■■■ 4.64
NEK6-209ENST00000444973 SYNMO15061 1565 aa44.02■■■■■ 4.64
NEK6-209ENST00000444973 LMTK2Q8IWU2 1503 aa44.02■■■■■ 4.64
NEK6-209ENST00000444973 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP44■■■■■ 4.63
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NEK6-209ENST00000444973 EID1Q9Y6B2 187 aa43.98■■■■■ 4.63
NEK6-209ENST00000444973 ADGRL2O95490 1459 aa43.96■■■■■ 4.63
NEK6-209ENST00000444973 TMEM2Q9UHN6 1383 aa43.96■■■■■ 4.63
NEK6-209ENST00000444973 IDI1Q13907 227 aa43.94■■■■■ 4.62
NEK6-209ENST00000444973 EFCAB6Q5THR3 1501 aa43.92■■■■■ 4.62
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NEK6-209ENST00000444973 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP43.89■■■■■ 4.62
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NEK6-209ENST00000444973 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP43.85■■■■■ 4.61
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NEK6-209ENST00000444973 ADGRB3O60242 1522 aa43.78■■■■■ 4.6
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NEK6-209ENST00000444973 SLC52A1Q9NWF4 448 aa43.72■■■■■ 4.59
NEK6-209ENST00000444973 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP43.7■■■■■ 4.59
NEK6-209ENST00000444973 TET3O43151 1660 aa43.69■■■■■ 4.58
NEK6-209ENST00000444973 TMEM94Q12767 1356 aa43.65■■■■■ 4.58
NEK6-209ENST00000444973 KCNA6P17658 529 aa43.64■■■■■ 4.58
NEK6-209ENST00000444973 BCANQ96GW7 911 aa43.61■■■■■ 4.57
NEK6-209ENST00000444973 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP43.61■■■■■ 4.57
NEK6-209ENST00000444973 UNC13BO14795 1591 aa43.61■■■■■ 4.57
NEK6-209ENST00000444973 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP43.6■■■■■ 4.57
NEK6-209ENST00000444973 MYO5BQ9ULV0 1848 aa43.57■■■■■ 4.56
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